RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580784.5

CSNK1D-215, Transcript of casein kinase 1 delta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSNK1D, Length 1,081 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1D-215ENST00000580784 BCL2L1Q07817 233 aa21.45■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 SLC10A7Q0GE19 358 aa21.45■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 PHACTR4Q8IZ21 702 aa21.45■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa21.45■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 BTN2A2Q8WVV5 523 aa21.45■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 CSPG4P5Q96PW8 444 aa21.45■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 NUP85Q9BW27 656 aa21.45■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 ANAPC7Q9UJX3 599 aa21.45■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa21.45■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 AK5Q9Y6K8 562 aa21.45■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 TOR1BO14657 336 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 OPA1O60313 960 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 CYP1A2P05177 515 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 ADKP55263 362 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 LBRQ14739 615 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 RTP5Q14D33 572 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 COL28A1Q2UY09 1125 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 PRRT3Q5FWE3 981 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 FAXCQ5TGI0 409 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 TMCO3Q6UWJ1 677 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 MACC1Q6ZN28 852 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 NIPA2Q8N8Q9 360 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 ECHDC3Q96DC8 303 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 IQCDQ96DY2 449 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 PSKH2Q96QS6 385 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 IL12RB2Q99665 862 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 NRSN2Q9GZP1 204 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 SPASTQ9UBP0 616 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 SEPT3Q9UH03 358 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 IP6K2Q9UHH9 426 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 RP1P56715 2156 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 TPP1O14773 563 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 CASP14P31944 242 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 PPARDQ03181 441 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 INPP5AQ14642 412 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 CDKN3Q16667 212 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 CCDC122Q5T0U0 273 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 TMCO4Q5TGY1 634 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 PAF1Q8N7H5 531 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 ZNF599Q96NL3 588 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 LRRC61Q9BV99 259 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 SLC13A1Q9BZW2 595 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 USP29Q9HBJ7 922 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 PCDH18Q9HCL0 1135 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 SALL4Q9UJQ4 1053 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 CPED1A4D0V7 1026 aa21.42■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 CACNA1GO43497 2377 aa21.42■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 PEX11BO96011 259 aa21.42■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 GP1BAP07359 652 aa21.42■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 PEX5P50542 639 aa21.42■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 RENBPP51606 427 aa21.42■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 AGERQ15109 404 aa21.42■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 CDCP2Q5VXM1 449 aa21.42■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 NYAP1Q6ZVC0 841 aa21.42■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 IFI44Q8TCB0 444 aa21.42■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 TEKT4Q8WW24 435 aa21.42■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 APOOQ9BUR5 198 aa21.42■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 CLPBQ9H078 707 aa21.42■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 EVA1BQ9NVM1 165 aa21.42■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 OR1A2Q9Y585 309 aa21.42■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 LRP4O75096 1905 aa21.41■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 A8MX80 341 aa21.41■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 YY2O15391 372 aa21.41■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 MAFKO60675 156 aa21.41■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 TSHRP16473 764 aa21.41■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 AP1S1P61966 158 aa21.41■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 RALGDSQ12967 914 aa21.41■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 GUSBP11Q6P575 273 aa21.41■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 ENPP7Q6UWV6 458 aa21.41■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 LIPIQ6XZB0 460 aa21.41■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 PGBD5Q8N414 524 aa21.41■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 PLA2G15Q8NCC3 412 aa21.41■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 ABCG4Q9H172 646 aa21.41■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 SCUBE2Q9NQ36 999 aa21.41■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa21.41■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa21.41■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 CFAP69A5D8W1 941 aa21.4■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa21.4■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 LMO7DNF2Z398 122 aa21.4■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 MYO1FO00160 1098 aa21.4■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 PCCBP05166 539 aa21.4■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 IL4RP24394 825 aa21.4■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 SSR1P43307 286 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 MMRN1Q13201 1228 aa21.4■■□□□ 1.02
CSNK1D-215ENST00000580784 ZNF235Q14590 738 aa21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms