RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572369.5

SMG6-211, Transcript of SMG6, nonsense mediated mRNA decay factor, humanhuman

TSL 3

Gene SMG6, Length 689 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6-211ENST00000572369 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP7.86□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 DEFB124Q8NES8 71 aa7.86□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 MDM1Q8TC05 714 aa7.86□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 CXorf40AQ8TE69 158 aa7.86□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 RAB7BQ96AH8 199 aa7.86□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 FAF2Q96CS3 445 aa7.86□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 SLC6A18Q96N87 628 aa7.86□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa7.86□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 TSGA10Q9BZW7 698 aa7.86□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa7.86□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 LACRTQ9GZZ8 138 aa7.86□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 SUV39H2Q9H5I1 410 aa7.86□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 CAPN10Q9HC96 672 aa7.86□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 NT5MQ9NPB1 228 aa7.86□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 SEPT10Q9P0V9 454 aa7.86□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 AMFRQ9UKV5 643 aa7.86□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 DUSP10Q9Y6W6 482 aa7.86□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 DOCK9Q9BZ29 2069 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 CCDC66A2RUB6 948 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 TSPAN6O43657 245 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 AP1G1O43747 822 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 CST8O60676 142 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 MAGEC1O60732 1142 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 TRIM16O95361 564 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 CER1O95813 267 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 CCDC175P0C221 793 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 KRT10P13645 584 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 CCNB1P14635 433 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 PRLRP16471 622 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 CCNCP24863 283 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 NFKBIAP25963 317 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 CTNNA2P26232 953 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 AKT2P31751 481 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 RGRP47804 291 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 GRIA4P48058 902 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 CSNK1DP48730 415 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 FAM193AP78312 1265 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 GBE1Q04446 702 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 ELP6Q0PNE2 266 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 GALNT2Q10471 571 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 PDK1Q15118 436 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 TFDP3Q5H9I0 405 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 SEL1L3Q68CR1 1132 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 BRAT1Q6PJG6 821 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 LAYNQ6UX15 382 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 NPNTQ6UXI9 565 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 LRRC8AQ8IWT6 810 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 CCDC13Q8IYE1 715 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 KATNAL2Q8IYT4 538 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 PQLC3Q8N755 202 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 UBL4BQ8N7F7 174 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 PLD5Q8N7P1 536 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 FAM181AQ8N9Y4 354 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 OR2I1PQ8NGU4 316 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 HCAR2Q8TDS4 363 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 LRRN4Q8WUT4 740 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 P3H4Q92791 437 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 FAM131CQ96AQ9 280 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 HAUS1Q96CS2 278 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 PSKH2Q96QS6 385 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 NUDCD1Q96RS6 583 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 SLC17A9Q9BYT1 436 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 GAREM1Q9H706 876 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 EBF2Q9HAK2 575 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 DTLQ9NZJ0 730 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 DKK3Q9UBP4 350 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 TRIM10Q9UDY6 481 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 SALL4Q9UJQ4 1053 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 GUCA1BQ9UMX6 200 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 DMTF1Q9Y222 760 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 ITM2BQ9Y287 266 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 FADS3Q9Y5Q0 445 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 TRPM6Q9BX84 2022 aa7.85□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 ATMQ13315 3056 aa7.84□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 PCDH15Q96QU1 1955 aa7.84□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 A0A087WV48 116 aa7.84□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 IGLON5A6NGN9 336 aa7.84□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 UPK3BL1B0FP48 263 aa7.84□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 UPK3BL2E5RIL1 263 aa7.84□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 MUSKO15146 869 aa7.84□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 LATO43561 262 aa7.84□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 MMP20O60882 483 aa7.84□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 GJB3O75712 270 aa7.84□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 TM7SF2O76062 418 aa7.84□□□□□ -1.15
SMG6-211ENST00000572369 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
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