RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 MCOLN2Q8IZK6 566 aa8.23□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 PAF1Q8N7H5 531 aa8.23□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 OR6C4Q8NGE1 309 aa8.23□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 WBP1Q96G27 269 aa8.23□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 MCEEQ96PE7 176 aa8.23□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 ERGIC2Q96RQ1 377 aa8.23□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa8.23□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 CCDC3Q9BQI4 270 aa8.23□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 APOOQ9BUR5 198 aa8.23□□□□□ -1.09
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COCH-211ENST00000557065 CPNE5Q9HCH3 593 aa8.23□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 PCDH12Q9NPG4 1184 aa8.23□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 LMBRD1Q9NUN5 540 aa8.23□□□□□ -1.09
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COCH-211ENST00000557065 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 GPR34Q9UPC5 381 aa8.23□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa8.23□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa8.23□□□□□ -1.09
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COCH-211ENST00000557065 LGALS16A8MUM7 142 aa8.22□□□□□ -1.09
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COCH-211ENST00000557065 J3KR12 359 aa8.22□□□□□ -1.09
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COCH-211ENST00000557065 RNF8O76064 485 aa8.22□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 TNFSF15O95150 251 aa8.22□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 PIGNO95427 931 aa8.22□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 TNFP01375 233 aa8.22□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 FERP16591 822 aa8.22□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 SERPINA4P29622 427 aa8.22□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 LIG3P49916 1009 aa8.22□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 CFHR1Q03591 330 aa8.22□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 VAC14Q08AM6 782 aa8.22□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP8.22□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 NFATC4Q14934 902 aa8.22□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 AGERQ15109 404 aa8.22□□□□□ -1.09
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COCH-211ENST00000557065 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa8.22□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 ERMARDQ5T6L9 678 aa8.22□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 CCDC81Q6ZN84 652 aa8.22□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 SRLQ86TD4 932 aa8.22□□□□□ -1.09
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COCH-211ENST00000557065 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 EXOC2Q96KP1 924 aa8.22□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 EDEM3Q9BZQ6 932 aa8.22□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 SLC39A8Q9C0K1 460 aa8.22□□□□□ -1.09
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COCH-211ENST00000557065 KLQ9UEF7 1012 aa8.22□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa8.22□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 COQ6Q9Y2Z9 468 aa8.22□□□□□ -1.09
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COCH-211ENST00000557065 LOC400499M0QZD8 3231 aa8.22□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 TRPM6Q9BX84 2022 aa8.22□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 DOCK9Q9BZ29 2069 aa8.22□□□□□ -1.09
COCH-211ENST00000557065 TSPAN11A1L157 253 aa8.21□□□□□ -1.1
COCH-211ENST00000557065 CDRT15L2A8MXV6 281 aa8.21□□□□□ -1.1
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COCH-211ENST00000557065 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
COCH-211ENST00000557065 TNFRSF10CO14798 259 aa8.21□□□□□ -1.1
COCH-211ENST00000557065 PLD2O14939 933 aa8.21□□□□□ -1.1
COCH-211ENST00000557065 C1QL1O75973 258 aa8.21□□□□□ -1.1
COCH-211ENST00000557065 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
COCH-211ENST00000557065 ITGA2BP08514 1039 aa8.21□□□□□ -1.1
COCH-211ENST00000557065 C6P13671 934 aa8.21□□□□□ -1.1
COCH-211ENST00000557065 PSMA2P25787 234 aa8.21□□□□□ -1.1
COCH-211ENST00000557065 RENBPP51606 427 aa8.21□□□□□ -1.1
COCH-211ENST00000557065 CCL7P80098 99 aa8.21□□□□□ -1.1
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COCH-211ENST00000557065 MAMLD1Q13495 774 aa8.21□□□□□ -1.1
COCH-211ENST00000557065 MTM1Q13496 603 aa8.21□□□□□ -1.1
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COCH-211ENST00000557065 ZNF843Q8N446 348 aa8.21□□□□□ -1.1
COCH-211ENST00000557065 FBXO39Q8N4B4 442 aa8.21□□□□□ -1.1
COCH-211ENST00000557065 FAM46DQ8NEK8 389 aa8.21□□□□□ -1.1
COCH-211ENST00000557065 PCDH19Q8TAB3 1148 aa8.21□□□□□ -1.1
COCH-211ENST00000557065 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
COCH-211ENST00000557065 CCDC74AQ96AQ1 378 aa8.21□□□□□ -1.1
COCH-211ENST00000557065 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
COCH-211ENST00000557065 WDR92Q96MX6 357 aa8.21□□□□□ -1.1
COCH-211ENST00000557065 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
COCH-211ENST00000557065 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
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