RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556210.1

CUX1-215, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CUX1, Length 4,044 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-215ENST00000556210 TPGS1Q6ZTW0 290 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 ANKRD23Q86SG2 305 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 OR13C4Q8NGS5 318 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 ING2Q9H160 280 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 TBC1D13Q9NVG8 400 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 MOCS1Q9NZB8 636 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 PCDH10Q9P2E7 1040 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 LZTS1Q9Y250 596 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 CKMP06732 381 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 RBP1P09455 135 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 XPAP23025 273 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 LRPAP1P30533 357 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 GLUD2P49448 558 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 USP46P62068 366 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 PTPRNQ16849 979 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 LRRTM3Q86VH5 581 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 ACOX2Q99424 681 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 ZYG11BQ9C0D3 744 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 BRD8Q9H0E9 1235 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 TLE6Q9H808 572 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 IGSF9Q9P2J2 1179 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 SORCS3Q9UPU3 1222 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 ARL5AQ9Y689 179 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 CABYRO75952 493 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 TOMM70O94826 608 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 CRABP2P29373 138 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 CRHR2Q13324 411 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 CDH18Q13634 790 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 NFYCQ13952 458 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 KIAA0319Q5VV43 1072 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 SDCCAG3Q96C92 435 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 ADNPQ9H2P0 1102 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 EURLQ9NYK6 297 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 RRN3Q9NYV6 651 aa14.94□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 FFAR3O14843 346 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 GPR42O15529 346 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 DLX3O60479 287 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 PSME3P61289 254 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 ITGA7Q13683 1181 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 SFT2D3Q587I9 215 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 OR10T2Q8NGX3 314 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 CCDC138Q96M89 665 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 GDAP2Q9NXN4 497 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 GJD2Q9UKL4 321 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 DOCK5Q9H7D0 1870 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 OR6B1O95007 311 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 TNFAIP8O95379 198 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 IL10P22301 178 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 SLC7A2P52569 658 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 PURAQ00577 322 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 MAPRE2Q15555 327 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 FAM219BQ5XKK7 198 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 CUZD1Q86UP6 607 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 HS6ST3Q8IZP7 471 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 FBXO39Q8N4B4 442 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 TTC9BQ8N6N2 239 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 CNTD1Q8N815 330 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 CDYL2Q8N8U2 506 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 ARNTL2Q8WYA1 636 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 PBXIP1Q96AQ6 731 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 SCUBE2Q9NQ36 999 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 GIT1Q9Y2X7 761 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 ACTL7AQ9Y615 435 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 C2orf81A6NN90 581 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 MAP3K13O43283 966 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 PCNAP12004 261 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 ACVRL1P37023 503 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 SLC11A2P49281 568 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 GATMP50440 423 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 THOP1P52888 689 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 RPS24P62847 133 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 PRKCZQ05513 592 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 POM121L1PQ3SYA9 428 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 C6orf52Q5T4I8 152 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 ZNF534Q76KX8 674 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 FBXW8Q8N3Y1 598 aa14.93□□□□□ -0.02
CUX1-215ENST00000556210 DDI1Q8WTU0 396 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms