RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549362.1

USP25-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 2

Gene USP25, Length 606 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-210ENST00000549362 PYGLP06737 847 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 TRIM49P0CI25 452 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 TRIM49CP0CI26 452 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 CR2P20023 1033 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 FGFR4P22455 802 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 IL1R2P27930 398 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 SLC6A4P31645 630 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 PHBP35232 272 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 CASP2P42575 452 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 MSH2P43246 934 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 NSFP46459 744 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 QARSP47897 775 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 IFNAR2P48551 515 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 GPC3P51654 580 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 CCNG1P51959 295 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 JAK3P52333 1124 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 GTF2BQ00403 316 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 GCNT1Q02742 428 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 TAP1Q03518 808 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 DUSP8Q13202 625 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 PRKG1Q13976 671 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 RASA2Q15283 850 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 E2F5Q15329 346 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 ZACNQ401N2 412 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 WASHC2DQ5SRD0 308 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 STRIP1Q5VSL9 837 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 RGS9BPQ6ZS82 235 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 OTUD6AQ7L8S5 288 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 GSTA5Q7RTV2 222 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 PLEKHH3Q7Z736 793 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 VSIG1Q86XK7 387 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 TDRPQ86YL5 185 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 LINC01356Q8N9X3 169 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 RNF169Q8NCN4 708 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 FBXL13Q8NEE6 735 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 SUPT20HQ8NEM7 779 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 LRRC8CQ8TDW0 803 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 PIGOQ8TEQ8 1089 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 SHC3Q92529 594 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 KRT35Q92764 455 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 INPP5DQ92835 1189 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 CD101Q93033 1021 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP4.49□□□□□ -1.694e-6■□□□□ 9.7
USP25-210ENST00000549362 TBC1D31Q96DN5 1066 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 MBD6Q96DN6 1003 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 MOGAT1Q96PD6 335 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 TMEM237Q96Q45 408 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 LRRC37BQ96QE4 947 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 LMF1Q96S06 567 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 SMC6Q96SB8 1091 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 RMDN3Q96TC7 470 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 MXRA8Q9BRK3 442 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 LXNQ9BS40 222 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 GPR88Q9GZN0 384 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 DEFB129Q9H1M3 183 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 NELFAQ9H3P2 528 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 DNAJC18Q9H819 358 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 ERVK-5Q9HDB9 667 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 ITM2CQ9NQX7 267 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 ARHGEF3Q9NR81 526 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 TM7SF3Q9NS93 570 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 ANKEF1Q9NU02 776 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 FBXO34Q9NWN3 711 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 RGL1Q9NZL6 768 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 PDP2Q9P2J9 529 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 GRHPRQ9UBQ7 328 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 SLC24A2Q9UI40 661 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 FEM1BQ9UK73 627 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 COQ4Q9Y3A0 265 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 MYH11P35749 1972 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 LRRC37AA6NMS7 1700 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 BTAF1O14981 1849 aa4.49□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa4.48□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa4.48□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 A0A087WWL8 130 aa4.48□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa4.48□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 FAM234BA2RU67 622 aa4.48□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 PRSS47A8MTI9 375 aa4.48□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 J3KRW8 73 aa4.48□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 NCAM2O15394 837 aa4.48□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 MAGEB2O15479 319 aa4.48□□□□□ -1.69
USP25-210ENST00000549362 TOM1O60784 492 aa4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms