RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546891.5

CS-205, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 911 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-205ENST00000546891 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-205ENST00000546891 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-205ENST00000546891 TLL2Q9Y6L7 1015 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-205ENST00000546891 NLRC5Q86WI3 1866 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-205ENST00000546891 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CS-205ENST00000546891 SLC12A8A0AV02 714 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 CCDC78A2IDD5 438 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 A8MT66 165 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 F5H5T6 163 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 SDHDO14521 159 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 AIM2O14862 343 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 BUD23O43709 281 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 PRAMEF11O60813 436 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 RPP40O75818 363 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 PDE5AO76074 875 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 STAMBPO95630 424 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 GLP2RO95838 553 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 OR4Q2P0C623 313 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 RAG1P15918 1043 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 ME2P23368 584 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 SP100P23497 879 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 EPHA3P29320 983 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 CHRNA4P43681 627 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 SUOXP51687 545 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 PRKCZQ05513 592 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 GPR17Q13304 367 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 SERINC3Q13530 473 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 FLOT2Q14254 428 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 C5orf22Q49AR2 442 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 SIRPB2Q5JXA9 342 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 C10orf120Q5SQS8 335 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 ALG1LQ6GMV1 187 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 FBXL22Q6P050 247 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 CNSTQ6PJW8 725 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 HACD2Q6Y1H2 254 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 CHSY3Q70JA7 882 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 PDSS2Q86YH6 399 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 MFSD6LQ8IWD5 586 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 PQLC1Q8N2U9 271 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 ARRDC2Q8TBH0 407 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 AGR3Q8TD06 166 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 BRSK1Q8TDC3 778 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 OVCA2Q8WZ82 227 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 GATA6Q92908 595 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 HHIPL1Q96JK4 782 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 UBXN10Q96LJ8 280 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 CATSPER2Q96P56 530 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 MAGEH1Q9H213 219 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 MEAF6Q9HAF1 191 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 SYTL2Q9HCH5 934 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 PFDN4Q9NQP4 134 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 NDFIP2Q9NV92 336 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP9.83□□□□□ -0.842e-10■■■□□ 15.1
CS-205ENST00000546891 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 SEPT3Q9UH03 358 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 SUFUQ9UMX1 484 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 GABRQQ9UN88 632 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 BBIP1A8MTZ0 92 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 J3KR12 359 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 TRIM38O00635 465 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 GPC4O75487 556 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 CRTAMO95727 393 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 NDST3O95803 873 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 MMP2P08253 660 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 SERPINF2P08697 491 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 CCDC166P0CW27 439 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 UQCRBP14927 111 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 IMPDH1P20839 514 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 FDXRP22570 491 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 FGFR3P22607 806 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 GMPRP36959 345 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 ETFBP38117 255 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 PSMD8P48556 350 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 ACLYP53396 1101 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 STX1BP61266 288 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 USP46P62068 366 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 DSC2Q02487 901 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 SULT2A1Q06520 285 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-205ENST00000546891 SLC10A7Q0GE19 358 aa9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.7 ms