RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 ABCG4Q9H172 646 aa5.66□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 RAD18Q9NS91 495 aa5.66□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa5.66□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 IMPACTQ9P2X3 320 aa5.66□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 SPASTQ9UBP0 616 aa5.66□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa5.66□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 PHTF1Q9UMS5 762 aa5.66□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa5.66□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 RAI2Q9Y5P3 530 aa5.66□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa5.66□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 KNTC1P50748 2209 aa5.66□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 DOCK4Q8N1I0 1966 aa5.66□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A1W2PR77 199 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 LRRD1A4D1F6 860 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 IGLON5A6NGN9 336 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 H0Y8X5 98 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 PSMD11O00231 422 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 APOL1O14791 398 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 MATN3O15232 486 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 INSIG1O15503 277 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 ARHGAP6O43182 974 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 PSTPIP1O43586 416 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 STK10O94804 968 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 FTH1P19P0C7X4 201 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 CTSEP14091 401 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF30P17039 623 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 CKMT2P17540 419 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 CTNNA2P26232 953 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 GARSP41250 739 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 COPS2P61201 443 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 PPP2CBP62714 309 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 PPP2CAP67775 309 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 OGDHQ02218 1023 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 PPARDQ03181 441 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 BIRC2Q13490 618 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 MTM1Q13496 603 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM52BQ4KMG9 183 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM259Q4ZIN3 620 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 FAXCQ5TGI0 409 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 AFMIDQ63HM1 303 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 LVRNQ6Q4G3 990 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 TMPRSS12Q86WS5 348 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 GKN2Q86XP6 184 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 RCOR2Q8IZ40 523 aa5.65□□□□□ -1.5
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CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM145Q8NBT3 493 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 OR6K2Q8NGY2 324 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 SAP25Q8TEE9 199 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 SPOCK2Q92563 424 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 ARRDC3Q96B67 414 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 GRAMD1AQ96CP6 724 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 NUDCD1Q96RS6 583 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 VAT1Q99536 393 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 TSGA10Q9BZW7 698 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 CDH19Q9H159 772 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 PCDH18Q9HCL0 1135 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 CD93Q9NPY3 652 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 NDFIP2Q9NV92 336 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 DNAJC28Q9NX36 388 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 NLGN3Q9NZ94 848 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 TTLL3Q9Y4R7 772 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 CEP192Q8TEP8 1941 aa5.65□□□□□ -1.51
CLSTN3-215ENST00000544584 TRPM6Q9BX84 2022 aa5.64□□□□□ -1.51
CLSTN3-215ENST00000544584 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CLSTN3-215ENST00000544584 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa5.64□□□□□ -1.51
CLSTN3-215ENST00000544584 TSPAN11A1L157 253 aa5.64□□□□□ -1.51
CLSTN3-215ENST00000544584 GOLGA6CA6NDK9 693 aa5.64□□□□□ -1.51
CLSTN3-215ENST00000544584 GOLGA6BA6NDN3 693 aa5.64□□□□□ -1.51
CLSTN3-215ENST00000544584 J3KR12 359 aa5.64□□□□□ -1.51
CLSTN3-215ENST00000544584 ENC1O14682 589 aa5.64□□□□□ -1.51
CLSTN3-215ENST00000544584 TPP1O14773 563 aa5.64□□□□□ -1.51
CLSTN3-215ENST00000544584 TNFRSF10CO14798 259 aa5.64□□□□□ -1.51
CLSTN3-215ENST00000544584 AREL1O15033 823 aa5.64□□□□□ -1.51
CLSTN3-215ENST00000544584 SCAMP1O15126 338 aa5.64□□□□□ -1.51
CLSTN3-215ENST00000544584 AQP9O43315 295 aa5.64□□□□□ -1.51
CLSTN3-215ENST00000544584 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
CLSTN3-215ENST00000544584 MMP20O60882 483 aa5.64□□□□□ -1.51
CLSTN3-215ENST00000544584 RFPL3O75679 317 aa5.64□□□□□ -1.51
CLSTN3-215ENST00000544584 MTA2O94776 668 aa5.64□□□□□ -1.51
CLSTN3-215ENST00000544584 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP5.64□□□□□ -1.51
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