RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 SCAMP1O15126 338 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 CILPO75339 1184 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 SERPINE1P05121 402 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 ADORA2AP29274 412 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 TIE1P35590 1138 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 GJA9P57773 515 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 TBCELQ5QJ74 424 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 SLC27A1Q6PCB7 646 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 RNF135Q8IUD6 432 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 SOCS4Q8WXH5 440 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 CPA5Q8WXQ8 436 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM176AQ96HP8 235 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 CDRT15Q96T59 188 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRD-214ENST00000540109 UMPSP11172 480 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 PEX2P28328 305 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 MAPK12P53778 367 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 BNIP3Q12983 259 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 LSAMPQ13449 338 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 PLCL1Q15111 1095 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 HSDL1Q3SXM5 330 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 TIGD2Q4W5G0 525 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 TRIQKQ629K1 86 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 ANKS6Q68DC2 871 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 TAPT1Q6NXT6 567 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 KIAA0408Q6ZU52 694 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 RDH11Q8TC12 318 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 FAM45AQ8TCE6 357 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 SLITRK1Q96PX8 696 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 NT5C1AQ9BXI3 368 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 PDZD7Q9H5P4 517 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 FAIMQ9NVQ4 179 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 LGALS13Q9UHV8 139 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 PLXNB2O15031 1838 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 METTL21EPA6NDL7 271 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 TK2O00142 265 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 YES1P07947 543 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 PSMA2P25787 234 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 RPL21P46778 160 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 BOLA3Q53S33 107 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 ZDHHC24Q6UX98 284 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 BBS12Q6ZW61 710 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF767PQ75MW2 155 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 GALNT7Q86SF2 657 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 DENND6AQ8IWF6 608 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 CLIP4Q8N3C7 705 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 LRRC17Q8N6Y2 441 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF366Q8N895 744 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 OR6J1Q8NGC5 347 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 OR2B2Q9GZK3 357 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 XYLT2Q9H1B5 865 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 NEK6Q9HC98 313 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 ST14Q9Y5Y6 855 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 BBIP1A8MTZ0 92 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 H3BRB1 525 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRD-214ENST00000540109 CD58P19256 250 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 AMPD1P23109 780 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 FDFT1P37268 417 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 STT3AP46977 705 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRD-214ENST00000540109 GRIK4Q16099 956 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 FUT11Q495W5 492 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 GARNL3Q5VVW2 1013 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRD-214ENST00000540109 LCLAT1Q6UWP7 414 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 FRMD7Q6ZUT3 714 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 TAGAPQ8N103 731 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 UBE2J2Q8N2K1 259 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 APOPT1Q96IL0 206 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 HAPLN2Q9GZV7 340 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 HDHD2Q9H0R4 259 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 TPK1Q9H3S4 243 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRD-214ENST00000540109 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
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