RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534284.1

CYCSP28-201, Transcript of cytochrome c, somatic pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene CYCSP28, Length 321 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYCSP28-201ENST00000534284 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP4.84□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 MYOCQ99972 504 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 MRI1Q9BV20 369 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 SGPP1Q9BX95 441 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 C2orf40Q9H1Z8 148 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 OR10A2Q9H208 303 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 PORCNQ9H237 461 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 VEZTQ9HBM0 779 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 KCNK9Q9NPC2 374 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 SAR1AQ9NR31 198 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 TM7SF3Q9NS93 570 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 NRBP2Q9NSY0 501 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 RNF146Q9NTX7 359 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 NINJ2Q9NZG7 142 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 SLC9A2Q9UBY0 812 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 FBXO40Q9UH90 709 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 NEU2Q9Y3R4 380 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 USH1CQ9Y6N9 552 aa4.84□□□□□ -1.63
CYCSP28-201ENST00000534284 ARID2Q68CP9 1835 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 BRWD3Q6RI45 1802 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 UMODL1Q5DID0 1318 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 A0A0B4J269 797 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 CLRN2A0PK11 232 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 FAM234BA2RU67 622 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 GOLGA8IPA6NC78 632 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 SMIM23A6NLE4 172 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 GOLGA8JA6NMD2 632 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 ZNF785A8K8V0 405 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 YDJCA8MPS7 323 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 ANKRD63C9JTQ0 380 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 K7ERI5 159 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 VWA5AO00534 786 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 ACKR2O00590 384 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 NPC1O15118 1278 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 ALOX15BO15296 676 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 TM9SF1O15321 606 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 MTSS1O43312 755 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 LIASO43766 372 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 PEX10O60683 326 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 ATP6V1G2O95670 118 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 NDST3O95803 873 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 CCNE2O96020 404 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 IL1BP01584 269 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 GSTA2P09210 222 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 TGFB3P10600 412 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 RARBP10826 455 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 RALAP11233 206 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 COL6A1P12109 1028 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 P4HA1P13674 534 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 NQO1P15559 274 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 KCNA2P16389 499 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 MMP8P22894 467 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 BDNFP23560 247 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 RRM1P23921 792 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 KLRC2P26717 231 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 CALRP27797 417 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 ELF1P32519 619 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 COPB2P35606 906 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 CCNG1P51959 295 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 ZNF132P52740 706 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 EPHB3P54753 998 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 VCPP55072 806 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 BACE1P56817 501 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 RAP2BP61225 183 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 NOP14P78316 857 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 USP10Q14694 798 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 EMC2Q15006 297 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 STXBP2Q15833 593 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 PDK4Q16654 411 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 CMPK2Q5EBM0 449 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 TFDP3Q5H9I0 405 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 ZMAT1Q5H9K5 638 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 AGBL4Q5VU57 503 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 ZNF529Q6P280 563 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 DNAJC24Q6P3W2 148 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 DCUN1D2Q6PH85 259 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 VSTM1Q6UX27 236 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 USP30Q70CQ3 517 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 ANO5Q75V66 913 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 TRABD2AQ86V40 505 aa4.83□□□□□ -1.64
CYCSP28-201ENST00000534284 CEP57Q86XR8 500 aa4.83□□□□□ -1.64
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