RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533069.1

PKP3-209, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 2

Gene PKP3, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-209ENST00000533069 ACACBO00763 2458 aa16.79■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa16.78■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 CFAP69A5D8W1 941 aa16.78■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 SOCS5O75159 536 aa16.78■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 MMP12P39900 470 aa16.78■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 TAS2R40P59535 323 aa16.78■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 PFN3P60673 137 aa16.78■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 MMRN1Q13201 1228 aa16.78■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 MESDQ14696 234 aa16.78■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa16.78■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 MARC1Q5VT66 337 aa16.78■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa16.78■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 PARGQ86W56 976 aa16.78■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 PAF1Q8N7H5 531 aa16.78■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 PCDH19Q8TAB3 1148 aa16.78■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 CENPTQ96BT3 561 aa16.78■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 FAF2Q96CS3 445 aa16.78■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 NUDCD1Q96RS6 583 aa16.78■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 MGME1Q9BQP7 344 aa16.78■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 TMEM8BA6NDV4 472 aa16.77■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa16.77■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 ZNF487B1APH4 448 aa16.77■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 H3BM21 787 aa16.77■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 ENC1O14682 589 aa16.77■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 MFSD11O43934 449 aa16.77■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 SDC3O75056 442 aa16.77■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 C1SP09871 688 aa16.77■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 CDK4P11802 303 aa16.77■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 NME1P15531 152 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 ITIH2P19823 946 aa16.77■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 CR2P20023 1033 aa16.77■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 DGKAP23743 735 aa16.77■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 MMP13P45452 471 aa16.77■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP16.77■□□□□ 0.281e-8■■■■□ 22.4
PKP3-209ENST00000533069 YPEL5P62699 121 aa16.77■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 GALNT2Q10471 571 aa16.77■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 PTK2BQ14289 1009 aa16.77■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 FZD2Q14332 565 aa16.77■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 AGERQ15109 404 aa16.77■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa16.77■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa16.77■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa16.77■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 ZSWIM9Q86XI8 627 aa16.77■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 VSIG1Q86XK7 387 aa16.77■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 CPNE8Q86YQ8 564 aa16.77■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 HAUS2Q9NVX0 235 aa16.77■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 DNAJC28Q9NX36 388 aa16.77■□□□□ 0.28
PKP3-209ENST00000533069 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 GOLGA8CPA6NN73 597 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 ESPNB1AK53 854 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 PIAS2O75928 621 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 CSF2P04141 144 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 PROS1P07225 676 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 ALPPL2P10696 532 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 C6P13671 934 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 MX2P20592 715 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 NFKBIAP25963 317 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 IGFALSP35858 605 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 GARSP41250 739 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 SLC1A1P43005 524 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 LIG3P49916 1009 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 THOP1P52888 689 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 HADHBP55084 474 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 LRRC14Q15048 493 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 LRRC38Q5VT99 294 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 GALNT15Q8N3T1 639 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 GATA6Q92908 595 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 FATE1Q969F0 183 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 SCUBE2Q9NQ36 999 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 TMEM131Q92545 1883 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 NEMP2A6NFY4 417 aa16.75■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 KDELR1P24390 212 aa16.75■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 ILKQ13418 452 aa16.75■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 IRF4Q15306 451 aa16.75■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 ST3GAL2Q16842 350 aa16.75■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 DPPA4Q7L190 304 aa16.75■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa16.75■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 REXO1L1PQ8IX06 675 aa16.75■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 SLC25A45Q8N413 288 aa16.75■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 PGBD5Q8N414 524 aa16.75■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 TEX26Q8N6G2 289 aa16.75■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 OR4C6Q8NH72 309 aa16.75■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 BTN2A2Q8WVV5 523 aa16.75■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 AMACRQ9UHK6 382 aa16.75■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 PCNX2A6NKB5 2137 aa16.75■□□□□ 0.27
PKP3-209ENST00000533069 LRRD1A4D1F6 860 aa16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms