RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526481.6

CTSB-211, Transcript of cathepsin B, humanhuman

TSL 5

Gene CTSB, Length 660 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSB-211ENST00000526481 ANAPC5Q9UJX4 755 aa14.61□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 SIT1Q9Y3P8 196 aa14.61□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa14.61□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 TRPM6Q9BX84 2022 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 GOLGA6CA6NDK9 693 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 GOLGA6BA6NDN3 693 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 SPINT1O43278 529 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 NDST3O95803 873 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 ALPIP09923 528 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 PIRTP0C851 137 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 GOLGA6DP0CG33 693 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 MYBL2P10244 700 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 CTPS1P17812 591 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 ITIH2P19823 946 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 DRD3P35462 400 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 RPS9P46781 194 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 PLTPP55058 493 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 SEMG2Q02383 582 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 MTAPQ13126 283 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 MORF4L2Q15014 288 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 SLC1A5Q15758 541 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 QPCTQ16769 361 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 ZNF805Q5CZA5 627 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 RANBP10Q6VN20 620 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 SYT13Q7L8C5 426 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 HOOK3Q86VS8 718 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 TMIEQ8NEW7 156 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 HMGB4Q8WW32 186 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 PIH1D2Q8WWB5 315 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 IFT81Q8WYA0 676 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 ART4Q93070 314 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 IFT43Q96FT9 208 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 SERPINB12Q96P63 405 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 CASS4Q9NQ75 786 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 FAM114A2Q9NRY5 505 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 SPO11Q9Y5K1 396 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 CEP192Q8TEP8 1941 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 A0A0U1RQS6 177 aa14.59□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 C16orf96A6NNT2 1141 aa14.59□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 PSMD3O43242 534 aa14.59□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 AVILO75366 819 aa14.59□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 FGF1P05230 155 aa14.59□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 ALADP13716 330 aa14.59□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 AOC1P19801 751 aa14.59□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 CA4P22748 312 aa14.59□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 ITGB7P26010 798 aa14.59□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 SLC8A1P32418 973 aa14.59□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 DRG2P55039 364 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 VSNL1P62760 191 aa14.59□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 CNTN1Q12860 1018 aa14.59□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 CALCOCO2Q13137 446 aa14.59□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 GRM3Q14832 879 aa14.59□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 MSS51Q4VC12 460 aa14.59□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 TMEM31Q5JXX7 168 aa14.59□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 FNBP1LQ5T0N5 605 aa14.59□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa14.59□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 DSG4Q86SJ6 1040 aa14.59□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 TMPRSS6Q8IU80 811 aa14.59□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 SPEM1Q8N4L4 309 aa14.59□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 PAF1Q8N7H5 531 aa14.59□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 MCUQ8NE86 351 aa14.59□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 LRIG1Q96JA1 1093 aa14.59□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 MRGPRX1Q96LB2 322 aa14.59□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 FBRSQ9HAH7 460 aa14.59□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 GGT7Q9UJ14 662 aa14.59□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 NFU1Q9UMS0 254 aa14.59□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 ITM2BQ9Y287 266 aa14.59□□□□□ -0.07
CTSB-211ENST00000526481 A0A1W2PP55 124 aa14.58□□□□□ -0.08
CTSB-211ENST00000526481 UPK3BL1B0FP48 263 aa14.58□□□□□ -0.08
CTSB-211ENST00000526481 UPK3BL2E5RIL1 263 aa14.58□□□□□ -0.08
CTSB-211ENST00000526481 HRO43593 1189 aa14.58□□□□□ -0.08
CTSB-211ENST00000526481 ADH1BP00325 375 aa14.58□□□□□ -0.08
CTSB-211ENST00000526481 TIMP2P16035 220 aa14.58□□□□□ -0.08
CTSB-211ENST00000526481 TPH1P17752 444 aa14.58□□□□□ -0.08
CTSB-211ENST00000526481 HLA-DPA1P20036 260 aa14.58□□□□□ -0.08
CTSB-211ENST00000526481 MGAT1P26572 445 aa14.58□□□□□ -0.08
CTSB-211ENST00000526481 MAGEA3P43357 314 aa14.58□□□□□ -0.08
CTSB-211ENST00000526481 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CTSB-211ENST00000526481 CRADDP78560 199 aa14.58□□□□□ -0.08
CTSB-211ENST00000526481 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
CTSB-211ENST00000526481 CERCAMQ5T4B2 595 aa14.58□□□□□ -0.08
CTSB-211ENST00000526481 CFAP58Q5T655 872 aa14.58□□□□□ -0.08
CTSB-211ENST00000526481 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa14.58□□□□□ -0.08
CTSB-211ENST00000526481 ANO7Q6IWH7 933 aa14.58□□□□□ -0.08
CTSB-211ENST00000526481 LRRC8BQ6P9F7 803 aa14.58□□□□□ -0.08
CTSB-211ENST00000526481 MICALCLQ6ZW33 695 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms