RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513573.1

CDH18-AS1-201, CDH18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH18-AS1, Length 424 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18-AS1-201ENST00000513573 IRF2BP1Q8IU81 584 aa20.27■□□□□ 0.84
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NELFBQ8WX92 580 aa20.27■□□□□ 0.84
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PDXPQ96GD0 296 aa20.27■□□□□ 0.84
CDH18-AS1-201ENST00000513573 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.27■□□□□ 0.84
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MAN1B1Q9UKM7 699 aa20.27■□□□□ 0.84
CDH18-AS1-201ENST00000513573 BICDL2A1A5D9 508 aa20.26■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TSPAN11A1L157 253 aa20.26■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 HGSO14964 777 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 KDELR3O43731 214 aa20.26■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TNFP01375 233 aa20.26■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RHOQP17081 205 aa20.26■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 KRT9P35527 623 aa20.26■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 USP8P40818 1118 aa20.26■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 EFHC2Q5JST6 749 aa20.26■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RD3Q7Z3Z2 195 aa20.26■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SLC47A2Q86VL8 602 aa20.26■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FAM26EQ8N5C1 309 aa20.26■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ATL2Q8NHH9 583 aa20.26■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GPBAR1Q8TDU6 330 aa20.26■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 C18orf8Q96DM3 657 aa20.26■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 WDR92Q96MX6 357 aa20.26■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CRACR2AQ9BSW2 395 aa20.26■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SYNCQ9H7C4 482 aa20.26■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 KLQ9UEF7 1012 aa20.26■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 OR12D3Q9UGF7 316 aa20.26■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 COQ6Q9Y2Z9 468 aa20.26■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 OR1A2Q9Y585 309 aa20.26■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa20.26■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CPNE6O95741 557 aa20.25■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ELP6Q0PNE2 266 aa20.25■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MTM1Q13496 603 aa20.25■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ISM2Q6H9L7 571 aa20.25■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FAM131BQ86XD5 332 aa20.25■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa20.25■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 OR1E3Q8WZA6 343 aa20.25■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa20.25■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TAAR9Q96RI9 348 aa20.25■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PLCB1Q9NQ66 1216 aa20.25■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TMEM202A6NGA9 273 aa20.24■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TNFRSF10CO14798 259 aa20.24■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ADRA1BP35368 520 aa20.24■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 UGT1A3P35503 534 aa20.24■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TRIM23P36406 574 aa20.24■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 KIAA1024LP59773 190 aa20.24■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RAD51Q06609 339 aa20.24■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SQSTM1Q13501 440 aa20.24■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TCEA2Q15560 299 aa20.24■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 KLHL10Q6JEL2 608 aa20.24■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PIM3Q86V86 326 aa20.24■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FAM71AQ8IYT1 594 aa20.24■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FAM46DQ8NEK8 389 aa20.24■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CFAP57Q96MR6 1250 aa20.24■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CATSPER2Q96P56 530 aa20.24■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SPRY4Q9C004 299 aa20.24■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SIX2Q9NPC8 291 aa20.24■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 HPCAL4Q9UM19 191 aa20.24■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CFAP69A5D8W1 941 aa20.23■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FAM72CH0Y354 149 aa20.23■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TMCC1O94876 653 aa20.23■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LIFP15018 202 aa20.23■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PON1P27169 355 aa20.23■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CCR10P46092 362 aa20.23■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CD97P48960 835 aa20.23■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ARHGEF7Q14155 803 aa20.23■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 UGP2Q16851 508 aa20.23■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PHF19Q5T6S3 580 aa20.23■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FAM72AQ5TYM5 149 aa20.23■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FAM72DQ6L9T8 149 aa20.23■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LEKR1Q6ZMV7 388 aa20.23■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FAM72BQ86X60 149 aa20.23■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PLA2G15Q8NCC3 412 aa20.23■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TMEM35BQ8NCS4 154 aa20.23■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 OR56A4Q8NGH8 313 aa20.23■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PMEPA1Q969W9 287 aa20.23■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 HMCESQ96FZ2 354 aa20.23■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RDH14Q9HBH5 336 aa20.23■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FGF22Q9HCT0 170 aa20.23■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DNAI1Q9UI46 699 aa20.23■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa20.22■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ATP1A2P50993 1020 aa20.22■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RAB6CQ53S08 254 aa20.22■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa20.22■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa20.22■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GBP6Q6ZN66 633 aa20.22■□□□□ 0.83
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TAF8Q7Z7C8 310 aa20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.5 ms