RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 A8MX80 341 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 SPOPO43791 374 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 DFNA5O60443 496 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 NDUFA10O95299 355 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 HLA-DQB2P05538 268 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 ITGAVP06756 1048 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 LIG3P49916 1009 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 RENBPP51606 427 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 DSC2Q02487 901 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 LLGL1Q15334 1064 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 MARC1Q5VT66 337 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 MAP7D3Q8IWC1 876 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC170Q8IYT3 715 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 OXR1Q8N573 874 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 TEX26Q8N6G2 289 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 EID2Q8N6I1 236 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 HCAR2Q8TDS4 363 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 MAML1Q92585 1016 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 SMIM14Q96QK8 99 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 SCNM1Q9BWG6 230 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 KLF15Q9UIH9 416 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 FPGTO14772 594 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 YKT6O15498 198 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 MAGEC1O60732 1142 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 NOP2P46087 812 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 HADHBP55084 474 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 PFN3P60673 137 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 DYNLT1P63172 113 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 DNAJC3Q13217 504 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC9A4Q6AI14 798 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 MFSD7Q6UXD7 560 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 ZSCAN30Q86W11 494 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 SPC24Q8NBT2 197 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 ASB12Q8WXK4 309 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 HDAC11Q96DB2 347 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 LGMNQ99538 433 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 B4GALT6Q9UBX8 382 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 FTSJ1Q9UET6 329 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 TTLL3Q9Y4R7 772 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 USP24Q9UPU5 2620 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A0U1RQJ8 604 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A0U1RQS6 177 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 FFAR2O15552 330 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 CPP00450 1065 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC1A1P43005 524 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 RABIFP47224 123 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 ZBTB17Q13105 803 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 SPA17Q15506 151 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 WSCD2Q2TBF2 565 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC157Q569K6 752 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC38Q5VT99 294 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 ERAP2Q6P179 960 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 DPPA4Q7L190 304 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 PARGQ86W56 976 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 RHOT1Q8IXI2 618 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 RBFAQ8N0V3 343 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 PELI3Q8N2H9 469 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC25A45Q8N413 288 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 PAF1Q8N7H5 531 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 NSMCE1Q8WV22 266 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 KRT35Q92764 455 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 SEMA3CQ99985 751 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 CEP41Q9BYV8 373 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 DNAJC28Q9NX36 388 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 HEY1Q9Y5J3 304 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 DUSP10Q9Y6W6 482 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 IGF2RP11717 2491 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF487B1APH4 448 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNK1O00180 336 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM38O00635 465 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 APOL1O14791 398 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 PSTPIP1O43586 416 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 SOCS5O75159 536 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 PIAS2O75928 621 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 DKK1O94907 266 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 PCCBP05166 539 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 GIMD1P0DJR0 217 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 LHCGRP22888 699 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 CDKN2BP42772 138 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 SUOXP51687 545 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP2-218ENST00000511185 CLDN6P56747 220 aa18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms