RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 SETD9Q8NE22 299 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 MOSPD2Q8NHP6 518 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 NSMCE1Q8WV22 266 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 GLG1Q92896 1179 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 ATP6V0A1Q93050 837 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 GTF3C6Q969F1 213 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 VPS33AQ96AX1 596 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 ARHGEF26Q96DR7 871 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 LRRC3BQ96PB8 259 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 OR2A14Q96R47 310 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 SNX18Q96RF0 628 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 LMF1Q96S06 567 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 ANP32EQ9BTT0 268 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 TRIM31Q9BZY9 425 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 SLC32A1Q9H598 525 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 PDRG1Q9NUG6 133 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 EHD3Q9NZN3 535 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 MGAT4CQ9UBM8 478 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 NENFQ9UMX5 172 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC69A6NI79 296 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 SYN3O14994 580 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 FOXS1O43638 330 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 STRNO43815 780 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 LPXNO60711 386 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 CDC14BO60729 498 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 USP12O75317 370 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 SERPINC1P01008 464 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 LCKP06239 509 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 TGM2P21980 687 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 MCM7P33993 719 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 KHKP50053 298 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 CCR3P51677 355 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 RABGGTBP53611 331 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 LIMK1P53667 647 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 PMS2P54278 862 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 MFAP4P55083 255 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 ARF5P84085 180 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 MC2RQ01718 297 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 CFHR3Q02985 330 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 DDR1Q08345 913 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 GRAPQ13588 217 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 RPE65Q16518 533 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 MEP1BQ16820 701 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 HYAL4Q2M3T9 481 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 MMEL1Q495T6 779 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 PLK5Q496M5 336 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 GLRA4Q5JXX5 417 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF449Q6P9G9 518 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 SLC30A9Q6PML9 568 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 ADCK2Q7Z695 626 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 LNX2Q8N448 690 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 OTUD6BQ8N6M0 293 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 TAF4BQ92750 862 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 SIPA1Q96FS4 1042 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 EEF2KMTQ96G04 330 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 DACH2Q96NX9 599 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 PLA2G12BQ9BX93 195 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 MMP27Q9H306 513 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 MID1IP1Q9NPA3 183 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 KLC4Q9NSK0 619 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 ABHD10Q9NUJ1 306 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 HPF1Q9NWY4 346 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 LRIT1Q9P2V4 623 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 PEMTQ9UBM1 199 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 SLC25A13Q9UJS0 675 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 AMFRQ9UKV5 643 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 TMCC3Q9ULS5 477 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 QRICH2Q9H0J4 1663 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 PNPLA6Q8IY17 1366 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 GLI3P10071 1580 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 TRGV11A0A075B6L2 103 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 LRRD1A4D1F6 860 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 EBAG9O00559 213 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 NDC80O14777 642 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 SLC30A4O14863 429 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 LIASO43766 372 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 CEP104O60308 925 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 RTN2O75298 545 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 SEC22BO75396 215 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 HIST1H2ABP04908 130 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 ALADP13716 330 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 HIST1H2ADP20671 130 aa2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms