RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.64□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TACC1O75410 805 aa4.64□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCNAP12004 261 aa4.64□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRTAP5-9P26371 169 aa4.64□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SSTR2P30874 369 aa4.64□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RRP1P56182 461 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HDAC4P56524 1084 aa4.64□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UFM1P61960 85 aa4.64□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CAMK1Q14012 370 aa4.64□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa4.64□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIF19Q2TAC6 998 aa4.64□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa4.64□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SGO1Q5FBB7 561 aa4.64□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NAA35Q5VZE5 725 aa4.64□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa4.64□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SHFQ7M4L6 423 aa4.64□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NOXA1Q86UR1 476 aa4.64□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HTRA1Q92743 480 aa4.64□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OTULINQ96BN8 352 aa4.64□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MXRA8Q9BRK3 442 aa4.64□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa4.64□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NUF2Q9BZD4 464 aa4.64□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SMYD2Q9NRG4 433 aa4.64□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C20orf141Q9NUB4 165 aa4.64□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TBX20Q9UMR3 447 aa4.64□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PAM16Q9Y3D7 125 aa4.64□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SMTNL1A8MU46 457 aa4.63□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa4.63□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IFNL4K9M1U5 179 aa4.63□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TAF4O00268 1085 aa4.63□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NDUFB4O95168 129 aa4.63□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa4.63□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AGAP20933 346 aa4.63□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GGT5P36269 586 aa4.63□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GALNT2Q10471 571 aa4.63□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GRIK3Q13003 919 aa4.63□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COASYQ13057 564 aa4.63□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MYBPHQ13203 477 aa4.63□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EFNB3Q15768 340 aa4.63□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BAK1Q16611 211 aa4.63□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 XKR9Q5GH70 373 aa4.63□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TXNDC8Q6A555 127 aa4.63□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NEK10Q6ZWH5 1172 aa4.63□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SCMH1Q96GD3 660 aa4.63□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 APOPT1Q96IL0 206 aa4.63□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF556Q9HAH1 456 aa4.63□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa4.63□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZIC3O60481 467 aa4.62□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COX7A2P14406 83 aa4.62□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CHATP28329 748 aa4.62□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TUBP50607 506 aa4.62□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GAS1P54826 345 aa4.62□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BRWD1-AS2P59051 145 aa4.62□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RPP30P78346 268 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DDR1Q08345 913 aa4.62□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DLG1Q12959 904 aa4.62□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP4.62□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa4.62□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPSB3Q6PJ21 355 aa4.62□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RHBDF2Q6PJF5 856 aa4.62□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LMLNQ96KR4 655 aa4.62□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PSMD1Q99460 953 aa4.62□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MPHOSPH8Q99549 860 aa4.62□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PDP2Q9P2J9 529 aa4.62□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC9A2Q9UBY0 812 aa4.62□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NFS1Q9Y697 457 aa4.62□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A1W2PQM1 296 aa4.61□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IFITM10A6NMD0 228 aa4.61□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC16A5O15375 505 aa4.61□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GAGE7O76087 117 aa4.61□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GAGE12FP0CL80 117 aa4.61□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GAGE12GP0CL81 117 aa4.61□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GAGE12IP0CL82 117 aa4.61□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ETFAP13804 333 aa4.61□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DAOP14920 347 aa4.61□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPTP24298 496 aa4.61□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SHMT1P34896 483 aa4.61□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ERVFC1-1P60608 527 aa4.61□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GAGE1Q13065 139 aa4.61□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GAGE4Q13068 117 aa4.61□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VEPH1Q14D04 833 aa4.61□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPR68Q15743 365 aa4.61□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa4.61□□□□□ -1.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANKRD54Q6NXT1 300 aa4.61□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66 ms