RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493967.1

PATJ-211, Transcript of PATJ, crumbs cell polarity complex component, humanhuman

TSL 2

Gene PATJ, Length 574 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJ-211ENST00000493967 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 LLGL1Q15334 1064 aa7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 TMEM52BQ4KMG9 183 aa7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 ODF2Q5BJF6 829 aa7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 ZNF542PQ5EBM4 170 aa7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 TPRG1LQ5T0D9 272 aa7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 LRRC38Q5VT99 294 aa7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 SLC9A4Q6AI14 798 aa7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 ERAP2Q6P179 960 aa7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 MFSD7Q6UXD7 560 aa7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 NPNTQ6UXI9 565 aa7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 ZSCAN30Q86W11 494 aa7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 RFX6Q8HWS3 928 aa7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 LRRC49Q8IUZ0 686 aa7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 BBS5Q8N3I7 341 aa7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 OXR1Q8N573 874 aa7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 TEX26Q8N6G2 289 aa7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 PLD5Q8N7P1 536 aa7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 PNPLA1Q8N8W4 532 aa7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 CCNYQ8ND76 341 aa7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 ACRBPQ8NEB7 543 aa7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 ASB12Q8WXK4 309 aa7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 MAML1Q92585 1016 aa7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 CENPTQ96BT3 561 aa7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 LGMNQ99538 433 aa7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 SEMA3CQ99985 751 aa7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 DTLQ9NZJ0 730 aa7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 TTLL3Q9Y4R7 772 aa7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 HEY1Q9Y5J3 304 aa7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 DUSP10Q9Y6W6 482 aa7.56□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 ZNF487B1APH4 448 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 KCNK1O00180 336 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 APOL1O14791 398 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 YKT6O15498 198 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 SOCS5O75159 536 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 HLA-DQB2P05538 268 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 FTH1P19P0C7X4 201 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 KRT10P13645 584 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 CCNB1P14635 433 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 MX2P20592 715 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 CCNCP24863 283 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 CDC25BP30305 580 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 RABIFP47224 123 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 LIG3P49916 1009 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 PFN3P60673 137 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 DSC2Q02487 901 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 RALGDSQ12967 914 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 FZD2Q14332 565 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 IHHQ14623 411 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 PTPRRQ15256 657 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 IRF4Q15306 451 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 WSCD2Q2TBF2 565 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 CCDC157Q569K6 752 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 KAZNQ674X7 775 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 C11orf63Q6NUN7 778 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 DPPA4Q7L190 304 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 GLRX5Q86SX6 157 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 SLCO6A1Q86UG4 719 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 TMEM139Q8IV31 216 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 CCDC13Q8IYE1 715 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 EID2Q8N6I1 236 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 DENND6BQ8NEG7 585 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 TPCN2Q8NHX9 752 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 HDAC11Q96DB2 347 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 TSGA13Q96PP4 275 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 CDC6Q99741 560 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 ANP32EQ9BTT0 268 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 LACRTQ9GZZ8 138 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 GPR27Q9NS67 375 aa7.55□□□□□ -1.2
PATJ-211ENST00000493967 UCKL1Q9NWZ5 548 aa7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms