RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 OXR1Q8N573 874 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 TEX26Q8N6G2 289 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 EID2Q8N6I1 236 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 PLD5Q8N7P1 536 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 CCNYQ8ND76 341 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 ACRBPQ8NEB7 543 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 ASB12Q8WXK4 309 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 MAML1Q92585 1016 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 CENPTQ96BT3 561 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 NUDCD1Q96RS6 583 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 DTLQ9NZJ0 730 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 TTLL3Q9Y4R7 772 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 HEY1Q9Y5J3 304 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 ALG6Q9Y672 507 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 LRRK1Q38SD2 2015 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 MATN3O15232 486 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 YKT6O15498 198 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 CCNCP24863 283 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 RABIFP47224 123 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 MARCKSL1P49006 195 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 HADHBP55084 474 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 DYNLT1P63172 113 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 RALGDSQ12967 914 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 FZD2Q14332 565 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 INAVAQ3KP66 663 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 CCDC157Q569K6 752 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 SLC9A4Q6AI14 798 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 GLRX5Q86SX6 157 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 DENND6BQ8NEG7 585 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 TSGA13Q96PP4 275 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 LGMNQ99538 433 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 CDC6Q99741 560 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 SEMA3CQ99985 751 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 ANP32EQ9BTT0 268 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP12.09□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 UCKL1Q9NWZ5 548 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 DNAJC28Q9NX36 388 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 WASF3Q9UPY6 502 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 DUSP10Q9Y6W6 482 aa12.09□□□□□ -0.47
NISCH-214ENST00000490425 FREM2Q5SZK8 3169 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 ZNF487B1APH4 448 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 KCNK1O00180 336 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 APOL1O14791 398 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 PSTPIP1O43586 416 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 SOCS5O75159 536 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 CPP00450 1065 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 JCHAINP01591 159 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 HLA-DQB2P05538 268 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 KRT10P13645 584 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 CCNB1P14635 433 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 MX2P20592 715 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 CDC25BP30305 580 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 DSC2Q02487 901 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 IHHQ14623 411 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 PTPRRQ15256 657 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 IRF4Q15306 451 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 WSCD2Q2TBF2 565 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 DPPA4Q7L190 304 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 TMEM139Q8IV31 216 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 CCDC13Q8IYE1 715 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 SLC25A45Q8N413 288 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 TPCN2Q8NHX9 752 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 FAM174AQ8TBP5 190 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 HDAC11Q96DB2 347 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 SMIM14Q96QK8 99 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 LACRTQ9GZZ8 138 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 GPR27Q9NS67 375 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 TOR4AQ9NXH8 423 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 B4GALT6Q9UBX8 382 aa12.08□□□□□ -0.48
NISCH-214ENST00000490425 FTSJ1Q9UET6 329 aa12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms