RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483765.5

RPL21-208, Transcript of ribosomal protein L21, human

TSL 3

Gene RPL21, Length 453 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL21-208	ENST00000483765	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL21-208	ENST00000483765	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL21-208	ENST00000483765	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPL21-208	ENST00000483765	SSH2	Q76I76	1423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL21-208	ENST00000483765	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL21-208	ENST00000483765	BECN2	A8MW95	431 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL21-208	ENST00000483765	PROB1	E7EW31	1015 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL21-208	ENST00000483765	NCAM2	O15394	837 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL21-208	ENST00000483765	RGS14	O43566	566 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL21-208	ENST00000483765	SOX30	O94993	753 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL21-208	ENST00000483765	IL1A	P01583	271 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL21-208	ENST00000483765	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPL21-208	ENST00000483765	GPD2	P43304	727 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL21-208	ENST00000483765	CENPA	P49450	140 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL21-208	ENST00000483765	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPL21-208	ENST00000483765	BLK	P51451	505 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL21-208	ENST00000483765	ARSF	P54793	590 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL21-208	ENST00000483765	VAMP2	P63027	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL21-208	ENST00000483765		Q0VFX4	171 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL21-208	ENST00000483765	GPS2	Q13227	327 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL21-208	ENST00000483765	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPL21-208	ENST00000483765		Q6ZSV7	163 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL21-208	ENST00000483765	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL21-208	ENST00000483765	RBFA	Q8N0V3	343 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL21-208	ENST00000483765	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPL21-208	ENST00000483765	STAM	Q92783	540 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL21-208	ENST00000483765	DCLK3	Q9C098	648 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL21-208	ENST00000483765	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPL21-208	ENST00000483765	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL21-208	ENST00000483765	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL21-208	ENST00000483765	GJD2	Q9UKL4	321 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL21-208	ENST00000483765	FZD10	Q9ULW2	581 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL21-208	ENST00000483765	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPL21-208	ENST00000483765	CPD	O75976	1380 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL21-208	ENST00000483765	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RPL21-208	ENST00000483765	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RPL21-208	ENST00000483765	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	OR6C75	A6NL08	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	VWA5A	O00534	786 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	EBAG9	O00559	213 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	PER2	O15055	1255 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	CTPS1	P17812	591 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	CD72	P21854	359 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	DCTD	P32321	178 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	ZNF284	Q2VY69	593 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	FBXO43	Q4G163	708 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	NAA35	Q5VZE5	725 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	C17orf99	Q6UX52	265 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	MIB2	Q96AX9	1013 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	TMEM18	Q96B42	140 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	RRN3	Q9NYV6	651 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	PAPPA	Q13219	1627 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	DAPK1	P53355	1430 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	INAFM1	C9JVW0	142 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	EYA2	O00167	538 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	GUCY1B2	O75343	617 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	ITGB6	P18564	788 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	EGR4	Q05215	589 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	FAM27E3	Q08E93	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	GORAB	Q5T7V8	394 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	PDXDC1	Q6P996	788 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	CPXM2	Q8N436	756 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	APOLD1	Q96LR9	279 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	HSF4	Q9ULV5	492 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	MYO6	Q9UM54	1294 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	CBY3	A6NI87	242 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	LIAS	O43766	372 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	HOXC6	P09630	235 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	TTK	P33981	857 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	THPO	P40225	353 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL21-208	ENST00000483765	ABAT	P80404	500 aa		4.88	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms