RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 SERPINB12Q96P63 405 aa7.1□□□□□ -1.27
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SHQ1-207ENST00000475558 FAM83CQ9BQN1 747 aa7.1□□□□□ -1.27
SHQ1-207ENST00000475558 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
SHQ1-207ENST00000475558 TXLNGYQ9BZA5 131 aa7.1□□□□□ -1.27
SHQ1-207ENST00000475558 TRABDQ9H4I3 376 aa7.1□□□□□ -1.27
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SHQ1-207ENST00000475558 SAMD15Q9P1V8 674 aa7.1□□□□□ -1.27
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SHQ1-207ENST00000475558 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa7.08□□□□□ -1.28
SHQ1-207ENST00000475558 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa7.08□□□□□ -1.28
SHQ1-207ENST00000475558 HEATR9A2RTY3 570 aa7.08□□□□□ -1.28
SHQ1-207ENST00000475558 TMEM8BA6NDV4 472 aa7.08□□□□□ -1.28
SHQ1-207ENST00000475558 TP73O15350 636 aa7.08□□□□□ -1.28
SHQ1-207ENST00000475558 SOCS5O75159 536 aa7.08□□□□□ -1.28
SHQ1-207ENST00000475558 ZMPSTE24O75844 475 aa7.08□□□□□ -1.28
SHQ1-207ENST00000475558 RHOBTB1O94844 696 aa7.08□□□□□ -1.28
SHQ1-207ENST00000475558 MAP3K6O95382 1288 aa7.08□□□□□ -1.28
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