RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469055.1

SLC35E1-204, Transcript of solute carrier family 35 member E1, humanhuman

TSL 2

Gene SLC35E1, Length 511 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E1-204ENST00000469055 ERVPABLB-1P60509 514 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 SPA17Q15506 151 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 MYLK3Q32MK0 819 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 ZNF805Q5CZA5 627 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 EFHC2Q5JST6 749 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 ERMARDQ5T6L9 678 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 IGF2-ASQ6U949 168 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 CLEC18BQ6UXF7 455 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 KDM7AQ6ZMT4 941 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 RFX8Q6ZV50 586 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 POLNQ7Z5Q5 900 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 CPNE8Q86YQ8 564 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 CLEC18CQ8NCF0 446 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 FAM174AQ8TBP5 190 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 TEKT4Q8WW24 435 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 FATE1Q969F0 183 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 SLC39A8Q9C0K1 460 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 STARD5Q9NSY2 213 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 ETNK2Q9NVF9 386 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa9.6□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 RCCD1A6NED2 376 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 POM121BA6NF01 834 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 C16orf96A6NNT2 1141 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 J3KR12 359 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 INSIG1O15503 277 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 KLK10O43240 276 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 SUV39H1O43463 412 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 POP4O95707 220 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 NTRK1P04629 796 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 H2AFZP0C0S5 128 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 TIMP2P16035 220 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 ERCC2P18074 760 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 MMP12P39900 470 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 MAGEA1P43355 309 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 LSSP48449 732 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 RALGDSQ12967 914 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 FZD2Q14332 565 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 TMEM52BQ4KMG9 183 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 H2AFVQ71UI9 128 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 OXR1Q8N573 874 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 TEX26Q8N6G2 289 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 OR13H1Q8NG92 308 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 SERAC1Q96JX3 654 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 TBATAQ96M53 351 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 CCDC114Q96M63 670 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 PSKH2Q96QS6 385 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 EPAS1Q99814 870 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 DPH1Q9BZG8 443 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 THAP2Q9H0W7 228 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 KLHL11Q9NVR0 708 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 ANKMY1Q9P2S6 941 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 KLF15Q9UIH9 416 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 PYCARDQ9ULZ3 195 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 TFR2Q9UP52 801 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 CA5BQ9Y2D0 317 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 PPIL1Q9Y3C6 166 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 ADGRG1Q9Y653 693 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 SCINQ9Y6U3 715 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SLC35E1-204ENST00000469055 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC35E1-204ENST00000469055 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC35E1-204ENST00000469055 TBC1D3EA0A087X179 549 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC35E1-204ENST00000469055 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC35E1-204ENST00000469055 A0A0U1RQJ8 604 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC35E1-204ENST00000469055 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC35E1-204ENST00000469055 CFAP69A5D8W1 941 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC35E1-204ENST00000469055 ANKRD62A6NC57 917 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC35E1-204ENST00000469055 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
SLC35E1-204ENST00000469055 ZNF487B1APH4 448 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC35E1-204ENST00000469055 TBC1D3LB9A6J9 549 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC35E1-204ENST00000469055 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
SLC35E1-204ENST00000469055 TSPAN6O43657 245 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC35E1-204ENST00000469055 MAFKO60675 156 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC35E1-204ENST00000469055 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SLC35E1-204ENST00000469055 TMEM253P0C7T8 217 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC35E1-204ENST00000469055 TBC1D3HP0C7X1 549 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC35E1-204ENST00000469055 RARAP10276 462 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC35E1-204ENST00000469055 NME1P15531 152 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SLC35E1-204ENST00000469055 IGFALSP35858 605 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC35E1-204ENST00000469055 SUOXP51687 545 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC35E1-204ENST00000469055 C21orf59P57076 290 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC35E1-204ENST00000469055 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SLC35E1-204ENST00000469055 TAZQ16635 292 aa9.58□□□□□ -0.88
SLC35E1-204ENST00000469055 POM121L1PQ3SYA9 428 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms