RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462572.1

PAICSP6-201, Transcript of phosphoribosylaminoimidazole carboxylase, phosphoribosylaminoimidazole succinocarboxamide synthetase pseudogene 6, humanhuman

BASIC

Gene PAICSP6, Length 1,280 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAICSP6-201ENST00000462572 CENPTQ96BT3 561 aa9.64□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 LRIG1Q96JA1 1093 aa9.64□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa9.64□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 NT5MQ9NPB1 228 aa9.64□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 TFR2Q9UP52 801 aa9.64□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa9.64□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 RAXQ9Y2V3 346 aa9.64□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 TTLL3Q9Y4R7 772 aa9.64□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa9.64□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 CPED1A4D0V7 1026 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 FAM221BA6H8Z2 402 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 K7ESM1 405 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 AGRPO00253 132 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 CBFA2T2O43439 604 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 AKR1B10O60218 316 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 MAFKO60675 156 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 GCATO75600 419 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 PEX11BO96011 259 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 JUPP14923 745 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 CKMT2P17540 419 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 CTPS1P17812 591 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 IL4RP24394 825 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 SERPINA4P29622 427 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 MMP12P39900 470 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 THOP1P52888 689 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 ITKQ08881 620 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 TRAF2Q12933 501 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 RALGDSQ12967 914 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 DPYSL3Q14195 570 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 INPP5AQ14642 412 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 LLGL1Q15334 1064 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 CDKN3Q16667 212 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 TMEM52BQ4KMG9 183 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 BOLA3Q53S33 107 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 PRRT3Q5FWE3 981 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 FAXCQ5TGI0 409 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 TMCO4Q5TGY1 634 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 ERAP2Q6P179 960 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 PARGQ86W56 976 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 PHACTR4Q8IZ21 702 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 NIPA2Q8N8Q9 360 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 KCTD6Q8NC69 237 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 OR8K1Q8NGG5 319 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 OR4C6Q8NH72 309 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 PCDH19Q8TAB3 1148 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 APOLD1Q96LR9 279 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 NOD2Q9HC29 1040 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 GPR27Q9NS67 375 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 ABHD10Q9NUJ1 306 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 SIRPGQ9P1W8 387 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 DKK3Q9UBP4 350 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 B4GALT6Q9UBX8 382 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 SEPT3Q9UH03 358 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 U3KQA8 63 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 ASXL3Q9C0F0 2248 aa9.63□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 ACACAQ13085 2346 aa9.62□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 LRP4O75096 1905 aa9.62□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 KNTC1P50748 2209 aa9.62□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa9.62□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 TSPAN11A1L157 253 aa9.62□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 GOLGA6CA6NDK9 693 aa9.62□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 GOLGA6BA6NDN3 693 aa9.62□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 AQP9O43315 295 aa9.62□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 MFAP3LO75121 409 aa9.62□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 PROSCO94903 275 aa9.62□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 CSF2P04141 144 aa9.62□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 CAPNS1P04632 268 aa9.62□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 TPM3P06753 285 aa9.62□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 ALPIP09923 528 aa9.62□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 H2AFZP0C0S5 128 aa9.62□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 ELFN1P0C7U0 828 aa9.62□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 GOLGA6DP0CG33 693 aa9.62□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 NME1P15531 152 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 GM2AP17900 193 aa9.62□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 HCAR3P49019 387 aa9.62□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 ARSEP51690 589 aa9.62□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP9.62□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 DSC2Q02487 901 aa9.62□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 GBE1Q04446 702 aa9.62□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 ELP6Q0PNE2 266 aa9.62□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 CAMK2BQ13554 666 aa9.62□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 LRRC14Q15048 493 aa9.62□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 ACOX1Q15067 660 aa9.62□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 SLC18A3Q16572 532 aa9.62□□□□□ -0.87
PAICSP6-201ENST00000462572 HADHQ16836 314 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms