RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 NAT9Q9BTE0 207 aa24.4■■□□□ 1.5
NME4-209ENST00000460297 KIFC1Q9BW19 673 aa24.4■■□□□ 1.5
NME4-209ENST00000460297 VPS37BQ9H9H4 285 aa24.4■■□□□ 1.5
NME4-209ENST00000460297 PRSS16Q9NQE7 514 aa24.4■■□□□ 1.5
NME4-209ENST00000460297 SPO11Q9Y5K1 396 aa24.4■■□□□ 1.5
NME4-209ENST00000460297 NPC1O15118 1278 aa24.39■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 RPL26P61254 145 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 C2orf27AQ580R0 203 aa24.39■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 CES3Q6UWW8 571 aa24.39■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 TMEM135Q86UB9 458 aa24.39■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 KLHL32Q96NJ5 620 aa24.39■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 FAM129BQ96TA1 746 aa24.39■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 SUN2Q9UH99 717 aa24.39■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 PLAAQ9Y263 795 aa24.39■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 TCAF1Q9Y4C2 921 aa24.39■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 MAGEB16A2A368 324 aa24.38■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 SHBGP04278 402 aa24.38■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 TSHRP16473 764 aa24.38■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 ADRA1DP25100 572 aa24.38■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 GRIA4P48058 902 aa24.38■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 EPHB1P54762 984 aa24.38■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 CFAP58Q5T655 872 aa24.38■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 STEAP4Q687X5 459 aa24.38■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 CCNJLQ8IV13 435 aa24.38■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 OR2W6PQ8NHA6 318 aa24.38■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa24.38■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 SPOCK2Q92563 424 aa24.38■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 LRIG1Q96JA1 1093 aa24.38■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 RANBP9Q96S59 729 aa24.38■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 SARDHQ9UL12 918 aa24.38■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa24.37■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 CCDC78A2IDD5 438 aa24.37■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 ABHD2P08910 425 aa24.37■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 NUDT17P0C025 328 aa24.37■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 SEPT6Q14141 434 aa24.37■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 E2F5Q15329 346 aa24.37■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 PKN3Q6P5Z2 889 aa24.37■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 IL17RCQ8NAC3 791 aa24.37■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 KCNV2Q8TDN2 545 aa24.37■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 OR8D1Q8WZ84 308 aa24.37■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 ZBTB9Q96C00 473 aa24.37■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 ERLEC1Q96DZ1 483 aa24.37■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 MFSD3Q96ES6 412 aa24.37■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 ZIM3Q96PE6 472 aa24.37■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa24.37■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 NFS1Q9Y697 457 aa24.37■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa24.37■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 POLBP06746 335 aa24.37■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 CTPS1P17812 591 aa24.37■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 NMBRP28336 390 aa24.37■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 CCINQ13939 588 aa24.37■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 CRYMQ14894 314 aa24.37■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 PAF1Q8N7H5 531 aa24.37■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 MDGA1Q8NFP4 955 aa24.37■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 BRSK1Q8TDC3 778 aa24.37■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 VIPAS39Q9H9C1 493 aa24.37■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 PPM1HQ9ULR3 514 aa24.37■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 CA14Q9ULX7 337 aa24.37■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 A0A0J9YYE9 177 aa24.36■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa24.36■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 HEATR9A2RTY3 570 aa24.36■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 MROH6A6NGR9 719 aa24.36■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 AURKAO14965 403 aa24.36■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 LDB2O43679 373 aa24.36■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 USP1O94782 785 aa24.36■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 TRBC1P01850 177 aa24.36■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 ALPIP09923 528 aa24.36■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 NTSR1P30989 418 aa24.36■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa24.36■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 GSDMBQ8TAX9 411 aa24.36■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 FBF1Q8TES7 1133 aa24.36■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 PHTF1Q9UMS5 762 aa24.36■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 ARL5AQ9Y689 179 aa24.36■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 A0A0U1RQS6 177 aa24.35■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa24.35■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 ADAM23O75077 832 aa24.35■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 SPAG6O75602 509 aa24.35■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 PRNPP04156 253 aa24.35■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 GSTA2P09210 222 aa24.35■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 ABL2P42684 1182 aa24.35■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 METAP1P53582 386 aa24.35■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 POM121L1PQ3SYA9 428 aa24.35■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 ZNF805Q5CZA5 627 aa24.35■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 UNC5BQ8IZJ1 945 aa24.35■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 TMIEQ8NEW7 156 aa24.35■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 GABRG3Q99928 467 aa24.35■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 ARHGEF3Q9NR81 526 aa24.35■■□□□ 1.49
NME4-209ENST00000460297 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP24.35■■□□□ 1.496e-9■■■□□ 14.9
NME4-209ENST00000460297 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms