RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 SPRED2Q7Z698 418 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CPLX4Q7Z7G2 160 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 UNC5BQ8IZJ1 945 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 BANPQ8N9N5 519 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 OR52K2Q8NGK3 314 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 FIBINQ8TAL6 211 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 BCAS4Q8TDM0 211 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ACMSDQ8TDX5 336 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 DENND1AQ8TEH3 1009 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 MZB1Q8WU39 189 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CKAP2Q8WWK9 683 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ATP2A3Q93084 1043 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 BHMTQ93088 406 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ACDQ96AP0 544 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 OTUB2Q96DC9 234 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 MFSD3Q96ES6 412 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 APOPT1Q96IL0 206 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 NUDCD1Q96RS6 583 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 FAM167BQ9BTA0 163 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ADGRE3Q9BY15 652 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CCDC134Q9H6E4 229 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 SFXN1Q9H9B4 322 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CERS4Q9HA82 394 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 KIF9Q9HAQ2 790 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 SLC28A3Q9HAS3 691 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 NOD2Q9HC29 1040 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 PRKAG3Q9UGI9 489 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 VPS51Q9UID3 782 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 OR51B4Q9Y5P0 310 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 GOLGA8RI6L899 631 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 SNAP91O60641 907 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 UGT1A9O60656 530 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 VAPBO95292 243 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CRTAMO95727 393 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 FAM107AO95990 144 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 PENKP01210 267 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 VIMP08670 466 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CEBPBP17676 345 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 WEE1P30291 646 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CHRNA4P43681 627 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CCT5P48643 541 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 POLD2P49005 469 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 NUMBP49757 651 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 SERPINB8P50452 374 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 PLK1P53350 603 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 AP1S1P61966 158 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ARF5P84085 180 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 SULT2A1Q06520 285 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 USP4Q13107 963 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 MPP2Q14168 576 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 DMC1Q14565 340 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF77Q15935 545 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CNGA3Q16281 694 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 SLC5A9Q2M3M2 681 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 PLEKHG6Q3KR16 790 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 RNF43Q68DV7 783 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 LINGO4Q6UY18 593 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 SRLQ86TD4 932 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 LMNTD2Q8IXW0 634 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 TDHQ8IZJ6 230 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 NDUFAF2Q8N183 169 aa6.68□□□□□ -1.34
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HDAC8-211ENST00000415409 KIAA1958Q8N8K9 716 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 GDAP1Q8TB36 358 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CALML6Q8TD86 181 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 TCP10LQ8TDR4 215 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 PTPRN2Q92932 1015 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 RMDN1Q96DB5 314 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 ALG14Q96F25 216 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 SERAC1Q96JX3 654 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CABS1Q96KC9 395 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 MAGEB18Q96M61 343 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 CCT8L2Q96SF2 557 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 PBX4Q9BYU1 374 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 FAM107BQ9H098 131 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 RABEP2Q9H5N1 569 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 UGT1A7Q9HAW7 530 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 UGT1A10Q9HAW8 530 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 UGT1A8Q9HAW9 530 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC8-211ENST00000415409 SPHK2Q9NRA0 654 aa6.68□□□□□ -1.34
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