RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 SLC44A1Q8WWI5 657 aa20.28■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 TLCD1Q96CP7 247 aa20.28■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa20.28■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 BRD9Q9H8M2 597 aa20.28■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 TREX1Q9NSU2 369 aa20.28■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 ANKRD66B4E2M5 251 aa20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 CREB1P16220 341 aa20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 CSNK1DP48730 415 aa20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 QPCTQ16769 361 aa20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 CARD16Q5EG05 197 aa20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 LRRC6Q86X45 466 aa20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 TERB1Q8NA31 727 aa20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 MDGA1Q8NFP4 955 aa20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 CEP44Q9C0F1 390 aa20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 PRKAG3Q9UGI9 489 aa20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 LGALS13Q9UHV8 139 aa20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 MROH6A6NGR9 719 aa20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 VAPBO95292 243 aa20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 PGLSO95336 258 aa20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 SLC4A1P02730 911 aa20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 ALPIP09923 528 aa20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 CTPS1P17812 591 aa20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 HPDP32754 393 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 ABL2P42684 1182 aa20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 MSH2P43246 934 aa20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 BCL2L1Q07817 233 aa20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 AGBL2Q5U5Z8 902 aa20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 ADGRD1Q6QNK2 874 aa20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 RASSF3Q86WH2 238 aa20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 TDRPQ86YL5 185 aa20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 PNPLA1Q8N8W4 532 aa20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 OR13J1Q8NGT2 312 aa20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 ERLEC1Q96DZ1 483 aa20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 LIMD1Q9UGP4 676 aa20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 SLC24A2Q9UI40 661 aa20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 HCN2Q9UL51 889 aa20.27■□□□□ 0.84
ODC1-202ENST00000405333 HEATR9A2RTY3 570 aa20.26■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 TBC1D3BA6NDS4 549 aa20.26■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 HLA-EP13747 358 aa20.26■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 RALGPS1Q5JS13 557 aa20.26■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 PIH1D2Q8WWB5 315 aa20.26■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 ADGRE3Q9BY15 652 aa20.26■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.834e-7■■■□□ 16.4
ODC1-202ENST00000405333 FETUBQ9UGM5 382 aa20.26■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 WASH3PC4AMC7 463 aa20.25■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 GSRP00390 522 aa20.25■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 ALADP13716 330 aa20.25■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 ARSDP51689 593 aa20.25■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 TMPRSS15P98073 1019 aa20.25■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 SEMG2Q02383 582 aa20.25■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 TSTD2Q5T7W7 516 aa20.25■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 ARMC12Q5T9G4 340 aa20.25■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 CYS1Q717R9 158 aa20.25■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 EXOC3L1Q86VI1 746 aa20.25■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 KCNMB4Q86W47 210 aa20.25■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 PTPRN2Q92932 1015 aa20.25■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 RANBP9Q96S59 729 aa20.25■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa20.25■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 VCANP13611 3396 aa20.25■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 A0A1W2PPM1 405 aa20.25■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 UGT2B4P06133 528 aa20.25■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 INHBAP08476 426 aa20.25■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 FOSL2P15408 326 aa20.25■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 CBX1P83916 185 aa20.25■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 MGAT5Q09328 741 aa20.25■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 EMC10Q5UCC4 262 aa20.25■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 OR13C4Q8NGS5 318 aa20.25■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 BRSK1Q8TDC3 778 aa20.25■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 GGT7Q9UJ14 662 aa20.25■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 PLA2G4CQ9UP65 541 aa20.25■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 KAT7O95251 611 aa20.24■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 ASGR2P07307 311 aa20.24■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 CTSLP07711 333 aa20.24■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 ABCG1P45844 678 aa20.24■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 EPHB1P54762 984 aa20.24■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 BMPR2Q13873 1038 aa20.24■□□□□ 0.83
ODC1-202ENST00000405333 LRRC73Q5JTD7 316 aa20.24■□□□□ 0.83
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