RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 PADI4Q9UM07 663 aa13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 TCAF1Q9Y4C2 921 aa13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 DOCK3Q8IZD9 2030 aa13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 TARM1B6A8C7 271 aa13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 MATN3O15232 486 aa13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 CACNG3O60359 315 aa13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 MAFKO60675 156 aa13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 PAGE1O75459 146 aa13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 POMCP01189 267 aa13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 CHRNA4P43681 627 aa13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 TAS2R39P59534 338 aa13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF33AQ06730 810 aa13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 BTBD8Q5XKL5 378 aa13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 DENND5AQ6IQ26 1287 aa13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 LZTR1Q8N653 840 aa13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 RTP3Q9BQQ7 232 aa13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 WDR41Q9HAD4 459 aa13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 EFCAB1Q9HAE3 211 aa13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 NUDT5Q9UKK9 219 aa13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 RNF11Q9Y3C5 154 aa13.28□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF236Q9UL36 1845 aa13.27□□□□□ -0.28
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM247A6NEH6 219 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 MSI1O43347 362 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 PSMC3P17980 439 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 PAMP19021 973 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 CYP2C18P33260 490 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 HALP42357 657 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 UPP1Q16831 310 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF280DQ6N043 979 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 TAF2Q6P1X5 1199 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 AGMOQ6ZNB7 445 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 CATSPER1Q8NEC5 780 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 ADCY4Q8NFM4 1077 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 HEXDCQ8WVB3 486 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 GPR78Q96P69 363 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM209Q96SK2 561 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 IL12RB2Q99665 862 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 HAUS8Q9BT25 410 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 POMKQ9H5K3 350 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 NDFIP2Q9NV92 336 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 SELENONQ9NZV5 590 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 TRPV2Q9Y5S1 764 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 CBFA2T3O75081 653 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 E2F6O75461 281 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 HLA-DQB2P05538 268 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP13.27□□□□□ -0.293e-7■■■■□ 25.1
TMOD1-202ENST00000375175 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 ARNTP27540 789 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 RPL9P32969 192 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 RXRGP48443 463 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 ALDH3B2P48448 385 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 CLCN2P51788 898 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 PURAQ00577 322 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 CSHL1Q14406 222 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF423Q2M1K9 1284 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 EML3Q32P44 896 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 MORN1Q5T089 497 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 TSTD2Q5T7W7 516 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM53Q6P2H8 277 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 SPNS2Q8IVW8 549 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 CNTN4Q8IWV2 1026 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 CPNE9Q8IYJ1 553 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 RANBP9Q96S59 729 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 NPAS2Q99743 824 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 ACBD6Q9BR61 282 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 ZBTB26Q9HCK0 441 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 CYP4F12Q9HCS2 524 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 BCAP29Q9UHQ4 241 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 FBXO5Q9UKT4 447 aa13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 NEMP2A6NFY4 417 aa13.26□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa13.26□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 FBP2O00757 339 aa13.26□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 SLC22A2O15244 555 aa13.26□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 IRAK2O43187 625 aa13.26□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 CCR1P32246 355 aa13.26□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 GJA8P48165 433 aa13.26□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 POLD2P49005 469 aa13.26□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 NDST2P52849 883 aa13.26□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 ITKQ08881 620 aa13.26□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 TGFBIQ15582 683 aa13.26□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 NRF1Q16656 503 aa13.26□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 PIGGQ5H8A4 983 aa13.26□□□□□ -0.29
TMOD1-202ENST00000375175 NEPROQ6NW34 567 aa13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms