RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 PANK2Q9BZ23 570 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRK-202ENST00000368205 MYH16Q9H6N6 1097 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRK-202ENST00000368205 MVB12BQ9H7P6 319 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRK-202ENST00000368205 TMLHEQ9NVH6 421 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRK-202ENST00000368205 LRFN1Q9P244 771 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRK-202ENST00000368205 DAPP1Q9UN19 280 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRK-202ENST00000368205 QRICH2Q9H0J4 1663 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRK-202ENST00000368205 IL16Q14005 1332 aa3.96□□□□□ -1.77
PTPRK-202ENST00000368205 TAF1P21675 1872 aa3.96□□□□□ -1.77
PTPRK-202ENST00000368205 NOS1P29475 1434 aa3.96□□□□□ -1.77
PTPRK-202ENST00000368205 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa3.96□□□□□ -1.77
PTPRK-202ENST00000368205 LMTK2Q8IWU2 1503 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 ABCA9Q8IUA7 1624 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 C17orf100A8MU93 164 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 P2RY10O00398 339 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 SYN3O14994 580 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 EDIL3O43854 480 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 ZG16O60844 167 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 VNN2O95498 520 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 MYF6P23409 242 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 AVPR2P30518 371 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 TMPOP42166 694 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 AK2P54819 239 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 PTK2BQ14289 1009 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 SPARCL1Q14515 664 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 GALNTL6Q49A17 601 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 BRSK2Q8IWQ3 736 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 SYTL1Q8IYJ3 562 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 SPEM1Q8N4L4 309 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 MCPH1Q8NEM0 835 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 TRIB2Q92519 343 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 CPT1BQ92523 772 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 MTBPQ96DY7 904 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 FBXO17Q96EF6 278 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 CFAP53Q96M91 514 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 OR1F2PQ96R84 312 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 CHST12Q9NRB3 414 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 BAG5Q9UL15 447 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 FANCAO15360 1455 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 ADGRL1O94910 1474 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 ADGRB1O14514 1584 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 CD109Q6YHK3 1445 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 ADGRB3O60242 1522 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 EFCAB6Q5THR3 1501 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 NSD2O96028 1365 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 CPED1A4D0V7 1026 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 CRYAAP02489 173 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 APOHP02749 345 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 ITGA2BP08514 1039 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 CYP21A2P08686 494 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 CHN1P15882 459 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 ABCB4P21439 1286 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 SERPINA4P29622 427 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF132P52740 706 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 KRTAP10-3P60369 221 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 ERVK11-1P61568 191 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 NUCB1Q02818 461 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 GALNT15Q8N3T1 639 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM57Q8N5G2 664 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 DEPTORQ8TB45 409 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM41AQ96HV5 264 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 KATNAL1Q9BW62 490 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 EGLN1Q9GZT9 426 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 GFRA4Q9GZZ7 299 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 ACAD9Q9H845 621 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 GRPEL1Q9HAV7 217 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 NDUFAF4Q9P032 175 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 DDX19BQ9UMR2 479 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 DHDHQ9UQ10 334 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 TCF19Q9Y242 345 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 PAM16Q9Y3D7 125 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 TULP4Q9NRJ4 1543 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 ABCC11Q96J66 1382 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 FAM157AC9JC47 383 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 FAM72CH0Y354 149 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 TNFRSF6BO95407 300 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 GYS1P13807 737 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 ARSAP15289 507 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 SSTR2P30874 369 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 CDKN1AP38936 164 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 ATP12AP54707 1039 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP3.94□□□□□ -1.78
PTPRK-202ENST00000368205 LPIN1Q14693 890 aa3.94□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms