RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362858.1

RNU6-655P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 655, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-655P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-655P-201ENST00000362858 OGFRQ9NZT2 677 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 MORF4L1Q9UBU8 362 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 GIMAP2Q9UG22 337 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 NDRG3Q9UGV2 375 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 RAP2CQ9Y3L5 183 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF711Q9Y462 761 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 NCANO14594 1321 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 A0A1W2PRQ8 180 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 WIPF3A6NGB9 483 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 GLOD5A6NK44 160 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 MASP2O00187 686 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 CTDSP2O14595 271 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 PRRG2O14669 202 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 ATP2C2O75185 946 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 BCAR3O75815 825 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 CTSAP10619 480 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 ETFAP13804 333 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 IL7RP16871 459 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 CAMPP49913 170 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 HSD17B4P51659 736 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 CLCN3P51790 818 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 PMS2P54278 862 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 MFAP4P55083 255 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 RPS13P62277 151 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 NHLH1Q02575 133 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 GHRHRQ02643 423 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 LRMPQ12912 555 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 CDC16Q13042 620 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 CAPSQ13938 189 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 FHL2Q14192 279 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 ADIPOQQ15848 244 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 KRT24Q2M2I5 525 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 SMTNL2Q2TAL5 461 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 PCGF3Q3KNV8 242 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 USP41Q3LFD5 358 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 CDONQ4KMG0 1287 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 BMP2KLQ5H9B9 411 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 CEP78Q5JTW2 689 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 SPECC1Q5M775 1068 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 C6orf141Q5SZD1 244 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 GARNL3Q5VVW2 1013 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 ARMC3Q5W041 872 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 PMS2CLQ68D20 193 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 HMBOX1Q6NT76 420 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMEM71Q6P5X7 295 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 DEF8Q6ZN54 512 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 SEPT14Q6ZU15 432 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 TRILQ7L0X0 811 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 PTF1AQ7RTS3 328 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 GPSM1Q86YR5 675 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC35F3Q8IY50 421 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 TEX11Q8IYF3 940 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 HORMAD2Q8N7B1 307 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 NKAIN3Q8N8D7 197 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 IL17RCQ8NAC3 791 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 KCTD6Q8NC69 237 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 HUS1BQ8NHY5 278 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 FBXL8Q96CD0 374 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 ELMOD3Q96FG2 381 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF333Q96JL9 665 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC41A2Q96JW4 573 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMEM68Q96MH6 324 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLITRK1Q96PX8 696 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 ABHD1Q96SE0 405 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 FAM110AQ9BQ89 295 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMEM47Q9BQJ4 181 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 LHPPQ9H008 270 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 CDT1Q9H211 546 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 KLHL31Q9H511 634 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 MAGEE1Q9HCI5 957 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 BPIFA1Q9NP55 256 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 GIMAP4Q9NUV9 329 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms