RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361927.8

COLGALT2-201, Transcript of collagen beta(1-O)galactosyltransferase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COLGALT2, Length 5,177 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT2-201ENST00000361927 VGLL2Q8N8G2 317 aa15.95■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 FEM1AQ9BSK4 669 aa15.95■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa15.95■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa15.95■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 STAT5AP42229 794 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 CDKN2BP42772 138 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 HERC3Q15034 1050 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 PRR5LQ6MZQ0 368 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 TTLL6Q8N841 843 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 DHFRP00374 187 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 SCN1BQ07699 218 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 KRT78Q8N1N4 520 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 NETO2Q8NC67 525 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 PPM1MQ96MI6 270 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 BAIAP2Q9UQB8 552 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 PSMD10O75832 226 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 IRF1P10914 325 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 SHMT1P34896 483 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 MOGQ16653 247 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 ERICH5Q6P6B1 374 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 CPNE8Q86YQ8 564 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 COPS4Q9BT78 406 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 MIEF1Q9NQG6 463 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 ZNF112Q9UJU3 913 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 C9JVG2 144 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 FBP2O00757 339 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 LRIG2O94898 1065 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 SERPINF2P08697 491 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 IGFBP5P24593 272 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 CENPAP49450 140 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 HADHBP55084 474 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 TUBA1BP68363 451 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 LIPEQ05469 1076 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 ZACNQ401N2 412 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 SDE2Q6IQ49 451 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 TUBA1AQ71U36 451 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 SYT12Q8IV01 421 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 FNDC8Q8TC99 324 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 TOP1MTQ969P6 601 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 ZFP42Q96MM3 310 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 CAMKK2Q96RR4 588 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 FBXO5Q9UKT4 447 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 PEX16Q9Y5Y5 336 aa15.94■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 MST1RQ04912 1400 aa15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 A0A1B0GVG6 124 aa15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 EI24O14681 340 aa15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 ITM2AO43736 263 aa15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 ENDOD1O94919 500 aa15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 EPB42P16452 691 aa15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 HARS2P49590 506 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 RPL38P63173 70 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 PTSQ03393 145 aa15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 ALFQ53S48 1182 aa15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 HYIQ5T013 277 aa15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 CRAMP1Q96RY5 1269 aa15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 SCUBE2Q9NQ36 999 aa15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 EFR3BQ9Y2G0 817 aa15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 NDUFB5O43674 189 aa15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 CYP3A4P08684 503 aa15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 ITIH1P19827 911 aa15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 CYP3A7P24462 503 aa15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 PTP4A2Q12974 167 aa15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 DIRAS2Q96HU8 199 aa15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 PXMP2Q9NR77 195 aa15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 OPTCQ9UBM4 332 aa15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 SNX7Q9UNH6 387 aa15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 STAU1O95793 577 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 GOT1P17174 413 aa15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 SLC18A1P54219 525 aa15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 ZPBP2Q6X784 338 aa15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 TBC1D19Q8N5T2 526 aa15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 Q96MT0 163 aa15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 PKP2Q99959 881 aa15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 MTFR1LQ9H019 292 aa15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 RHOJQ9H4E5 214 aa15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 SETD4Q9NVD3 440 aa15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
COLGALT2-201ENST00000361927 IGSF9Q9P2J2 1179 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms