RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320031.12

ITGA3-202, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ITGA3, Length 4,888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-202ENST00000320031 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 TCAF1Q9Y4C2 921 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 FAM155BO75949 473 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 MC4RP32245 332 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 TGM3Q08188 693 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 IL10RBQ08334 325 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 TBCELQ5QJ74 424 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 SYPL2Q5VXT5 272 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 TTC7BQ86TV6 843 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 NAT8LQ8N9F0 302 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 PLD4Q96BZ4 506 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 AP3M1Q9Y2T2 418 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 NR2E3Q9Y5X4 410 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa16.58■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 PSMC3P17980 439 aa16.58■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 FASP25445 335 aa16.58■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 GPC1P35052 558 aa16.58■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF132P52740 706 aa16.58■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 OGDHQ02218 1023 aa16.58■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 HSPA14Q0VDF9 509 aa16.58■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 DMC1Q14565 340 aa16.58■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa16.58■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 DLG3Q92796 817 aa16.58■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa16.58■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 RGSL1A5PLK6 1076 aa16.58■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 PDE5AO76074 875 aa16.58■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 TMEM63AO94886 807 aa16.58■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 TCF4P15884 667 aa16.58■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 PCYT1AP49585 367 aa16.58■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 OR52K2Q8NGK3 314 aa16.58■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 CNBD2Q96M20 576 aa16.58■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 C7orf26Q96N11 449 aa16.58■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 FAM192AQ9GZU8 254 aa16.58■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 OSBPL2Q9H1P3 480 aa16.58■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 SELENONQ9NZV5 590 aa16.58■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 COX4I1P13073 169 aa16.58■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 ATP6V1B1P15313 513 aa16.58■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 RHBDF2Q6PJF5 856 aa16.58■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 P3H2Q8IVL5 708 aa16.58■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 FBXO22Q8NEZ5 403 aa16.58■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 STYXQ8WUJ0 223 aa16.58■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 CD101Q93033 1021 aa16.58■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 CDH19Q9H159 772 aa16.58■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 CAAP1Q9H8G2 361 aa16.58■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 PDLIM7Q9NR12 457 aa16.58■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 TBC1D14Q9P2M4 693 aa16.58■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 COPG2Q9UBF2 871 aa16.58■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF839A8K0R7 811 aa16.58■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 TGDSO95455 350 aa16.58■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 ADRM1Q16186 407 aa16.58■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa16.58■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 SCAMP5Q8TAC9 235 aa16.58■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 MIEF1Q9NQG6 463 aa16.58■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 TLR6Q9Y2C9 796 aa16.58■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 LRP5O75197 1615 aa16.57■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 SLC38A8A6NNN8 435 aa16.57■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 ALDH1A2O94788 518 aa16.57■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 EPB42P16452 691 aa16.57■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 OSCP1Q8WVF1 389 aa16.57■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 MFSD3Q96ES6 412 aa16.57■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 COPS8Q99627 209 aa16.57■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 TBC1D23Q9NUY8 699 aa16.57■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 PIRO00625 290 aa16.57■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 LRPAP1P30533 357 aa16.57■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 NCALDP61601 193 aa16.57■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa16.57■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 ELMO1Q92556 727 aa16.57■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 PDZK1P1A8MUH7 402 aa16.57■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa16.57■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 CTPS1P17812 591 aa16.57■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 DSC2Q02487 901 aa16.57■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 IRF5Q13568 498 aa16.57■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 OASLQ15646 514 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 RFWD3Q6PCD5 774 aa16.57■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 CLYBLQ8N0X4 340 aa16.57■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 SPATA22Q8NHS9 363 aa16.57■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa16.57■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 GRM6O15303 877 aa16.57■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 FTH1P02794 183 aa16.57■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 PFKPQ01813 784 aa16.57■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 CES5AQ6NT32 575 aa16.57■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 HMCESQ96FZ2 354 aa16.57■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 PIGVQ9NUD9 493 aa16.57■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 RAI2Q9Y5P3 530 aa16.57■□□□□ 0.24
ITGA3-202ENST00000320031 SNX10Q9Y5X0 201 aa16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms