RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 ZFP14Q9HCL3 533 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 EHD3Q9NZN3 535 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 CSH1P0DML2 217 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 CSH2P0DML3 217 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 ATP12AP54707 1039 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 PTPN20Q4JDL3 420 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 BHLHB9Q6PI77 547 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 CLNKQ7Z7G1 428 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 KBTBD2Q8IY47 623 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 C12orf29Q8N999 325 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 OR52K2Q8NGK3 314 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 SLC39A8Q9C0K1 460 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGEF3Q9NR81 526 aa21.25■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 ADCY6O43306 1168 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 WARSP23381 471 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 WNT3AP56704 352 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 QPCTQ16769 361 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 MZT2BQ6NZ67 158 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 RD3Q7Z3Z2 195 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 PROSER1Q86XN7 944 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 PNPOQ9NVS9 261 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 IKZF3Q9UKT9 509 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 CST1P01037 141 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 DOK6Q6PKX4 331 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 OR4L1Q8NH43 312 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 SUSD6Q92537 303 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 ADI1Q9BV57 179 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 COG5Q9UP83 839 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 B4GALT5O43286 388 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 SEC24AO95486 1093 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 LCLAT1Q6UWP7 414 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 TPGS1Q6ZTW0 290 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 IKBIPQ70UQ0 350 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 PQLC1Q8N2U9 271 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 HDAC10Q969S8 669 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 VPS35Q96QK1 796 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 FTH1P02794 183 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 PTP4A2Q12974 167 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 CMC1Q7Z7K0 106 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 FAM35AQ86V20 835 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF540Q8NDQ6 660 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 VMP1Q96GC9 406 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 SLC4A9Q96Q91 983 aa21.24■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 PAGE2Q7Z2X7 111 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 HELQQ8TDG4 1101 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 C8orf4Q9NR00 106 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 ARL8BQ9NVJ2 186 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 PSMD13Q9UNM6 376 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 GIT1Q9Y2X7 761 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 TRAF6Q9Y4K3 522 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 GSC2O15499 205 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 SLC7A2P52569 658 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 AMIGO2Q86SJ2 522 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 SLC15A5A6NIM6 579 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 ATP6AP2O75787 350 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 MOSPD2Q8NHP6 518 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 C2P06681 752 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 UMPSP11172 480 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 PPIBP23284 216 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 USP4Q13107 963 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 ADCY4Q8NFM4 1077 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF671Q8TAW3 534 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 C7orf26Q96N11 449 aa21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 SNHG28P0DPA3 235 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 TSPAN8P19075 237 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 STAT5AP42229 794 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 FAM20CQ8IXL6 584 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 ERGIC3Q9Y282 383 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 NOL4O94818 638 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 OR6B1O95007 311 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 UQCRBP14927 111 aa21.22■□□□□ 0.99
CCSAP-201ENST00000284617 FAM13CQ8NE31 585 aa21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms