RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000274711.6

LRRTM2-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM2, Length 6,017 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2-201ENST00000274711 YES1P07947 543 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 VDRP11473 427 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 GADD45AP24522 165 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 S100PP25815 95 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 PPP3R1P63098 170 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 AMPD2Q01433 879 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 PRKCDQ05655 676 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 PCDH1Q08174 1060 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 SGCGQ13326 291 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 ORC1Q13415 861 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 GRK1Q15835 563 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 BATFQ16520 125 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 USP41Q3LFD5 358 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 ADNP2Q6IQ32 1131 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 ALKBH2Q6NS38 261 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 BRINP3Q76B58 766 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 SNX20Q7Z614 316 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 CCDC28AQ8IWP9 274 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 SEPT12Q8IYM1 358 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 CFAP206Q8IYR0 622 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 CYP4X1Q8N118 509 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 C2orf69Q8N8R5 385 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 ANKFN1Q8N957 763 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 PHC3Q8NDX5 983 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 FBXO32Q969P5 355 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 MKL1Q969V6 931 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 CCDC120Q96HB5 630 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 PPP3R2Q96LZ3 170 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 APBA2Q99767 749 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 KCNN2Q9H2S1 579 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 FAM86C1Q9NVL1 165 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 RAB26Q9ULW5 256 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 UGGT2Q9NYU1 1516 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 UMODL1Q5DID0 1318 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 A0A087WZ62 844 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 A0A1B0GVC2 190 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 PDCD5O14737 125 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 SCGB1D2O95969 90 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 FTH1P02794 183 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 FDX1P10109 184 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 NOS2P35228 1153 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 MCAMP43121 646 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 RPL21P46778 160 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 NUMBP49757 651 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 MECP2P51608 486 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 DRG2P55039 364 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 S100A10P60903 97 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 MXD1Q05195 221 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 TMEM62Q0P6H9 643 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 ELP6Q0PNE2 266 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 EFEMP1Q12805 493 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 ABRQ12979 859 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 SNAPC1Q16533 368 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 AMHR2Q16671 573 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 WSCD2Q2TBF2 565 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 LIN52Q52LA3 116 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 MARC1Q5VT66 337 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 LPCAT4Q643R3 524 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 GALNT5Q7Z7M9 940 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 LDHDQ86WU2 507 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 PEX5LQ8IYB4 626 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 ADCY4Q8NFM4 1077 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 IL17REQ8NFR9 667 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 OR4A15Q8NGL6 344 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 THAP6Q8TBB0 222 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 SNX33Q8WV41 574 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 TP53INP1Q96A56 240 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 NXPE2Q96DL1 559 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 CLIP3Q96DZ5 547 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 SMARCD1Q96GM5 515 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 SH2D3AQ9BRG2 576 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 FXYD6Q9H0Q3 95 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 ALG9Q9H6U8 611 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 RABL2BQ9UNT1 228 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 TRPV2Q9Y5S1 764 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 ARL5AQ9Y689 179 aa3.38□□□□□ -1.87
LRRTM2-201ENST00000274711 TVP23AA6NH52 213 aa3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms