RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266546.10

CLSTN3-201, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLSTN3, Length 4,185 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-201ENST00000266546 SYT11Q9BT88 431 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 PRDM12Q9H4Q4 367 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 CXorf21Q9HAI6 301 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 CDHR5Q9HBB8 845 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 H3BSA7 217 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 SOAT2O75908 522 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 RALGDSQ12967 914 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 XYLT1Q86Y38 959 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 LPGAT1Q92604 370 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 TMEM169Q96HH4 297 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 SPON2Q9BUD6 331 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 IL22Q9GZX6 179 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 ACSS2Q9NR19 701 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 TRHDEQ9UKU6 1024 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 LOC285556D6RIA3 1793 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 ARL5CA6NH57 179 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 ASNA1O43681 348 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 RHOBTB1O94844 696 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 TYMPP19971 482 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 ITGAXP20702 1163 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 POU4F1Q01851 419 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 GBE1Q04446 702 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 IKBKEQ14164 716 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 OR52E8Q6IFG1 317 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 GK5Q6ZS86 529 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 FRMD7Q6ZUT3 714 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 NIPA2Q8N8Q9 360 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 RDH11Q8TC12 318 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 EDEM1Q92611 657 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 DEFB118Q96PH6 123 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 YME1L1Q96TA2 773 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 POPDC2Q9HBU9 364 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 CNGB3Q9NQW8 809 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 GIMAP4Q9NUV9 329 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 SAGE1Q9NXZ1 904 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 PIRO00625 290 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 ATP6AP2O75787 350 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 WDR47O94967 919 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 GSNP06396 782 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 RPL26P61254 145 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 SMARCB1Q12824 385 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 DGUOKQ16854 277 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 TRAF7Q6Q0C0 670 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 TAS2R42Q7RTR8 314 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 PIGZQ86VD9 579 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 GATA6Q92908 595 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 MID1IP1Q9NPA3 183 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 EGFL7Q9UHF1 273 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 FADS3Q9Y5Q0 445 aa11.6□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 ITM2AO43736 263 aa11.59□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 EFCAB14O75071 495 aa11.59□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 HMBSP08397 361 aa11.59□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 IMPDH2P12268 514 aa11.59□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 MLNP12872 115 aa11.59□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 OLFML1Q6UWY5 402 aa11.59□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 YAF2Q8IY57 180 aa11.59□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 CNTD1Q8N815 330 aa11.59□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 HSPBAP1Q96EW2 488 aa11.59□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 ZFP42Q96MM3 310 aa11.59□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 TLE6Q9H808 572 aa11.59□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 COQ10BQ9H8M1 238 aa11.59□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 COMMD8Q9NX08 183 aa11.59□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 PLK2Q9NYY3 685 aa11.59□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 A0A1B0GVG6 124 aa11.59□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 GOT1P17174 413 aa11.59□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 GPD2P43304 727 aa11.59□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 THOP1P52888 689 aa11.59□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 MRNIPQ6NTE8 343 aa11.59□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa11.59□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 MCRS1Q96EZ8 462 aa11.59□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 ACBD6Q9BR61 282 aa11.59□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 B3GNT5Q9BYG0 378 aa11.59□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa11.59□□□□□ -0.55
CLSTN3-201ENST00000266546 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms