RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 KLHL40Q2TBA0 621 aa16.58■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF805Q5CZA5 627 aa16.58■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 DCAF12Q5T6F0 453 aa16.58■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa16.58■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 RTP4Q96DX8 246 aa16.58■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 FAM204AQ9H8W3 233 aa16.58■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 CYP4F12Q9HCS2 524 aa16.58■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 TLK1Q9UKI8 766 aa16.58■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
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SPCS1-201ENST00000233025 CD1CP29017 333 aa16.57■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 GKP32189 559 aa16.57■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP16.57■□□□□ 0.24
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SPCS1-201ENST00000233025 LRRC73Q5JTD7 316 aa16.57■□□□□ 0.24
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SPCS1-201ENST00000233025 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 SLC34A3Q8N130 599 aa16.57■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 OR4D9Q8NGE8 314 aa16.57■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 COQ4Q9Y3A0 265 aa16.57■□□□□ 0.24
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SPCS1-201ENST00000233025 MAZP56270 477 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
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SPCS1-201ENST00000233025 CBWD6Q4V339 395 aa16.56■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 CBWD3Q5JTY5 395 aa16.56■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 CBWD5Q5RIA9 395 aa16.56■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF683Q8IZ20 524 aa16.56■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
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SPCS1-201ENST00000233025 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 WDR92Q96MX6 357 aa16.56■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 ST7Q9NRC1 585 aa16.56■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 DDIT4Q9NX09 232 aa16.56■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
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SPCS1-201ENST00000233025 DCHS2Q6V1P9 2916 aa16.56■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
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SPCS1-201ENST00000233025 ADCY5O95622 1261 aa16.55■□□□□ 0.24
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SPCS1-201ENST00000233025 PRCPP42785 496 aa16.55■□□□□ 0.24
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SPCS1-201ENST00000233025 ARF5P84085 180 aa16.55■□□□□ 0.24
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SPCS1-201ENST00000233025 NADK2Q4G0N4 442 aa16.55■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 COBLL1Q53SF7 1204 aa16.55■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 FOXR2Q6PJQ5 311 aa16.55■□□□□ 0.24
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SPCS1-201ENST00000233025 APOOQ9BUR5 198 aa16.55■□□□□ 0.24
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SPCS1-201ENST00000233025 TMEM9Q9P0T7 183 aa16.55■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 POLHQ9Y253 713 aa16.55■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 OR1A2Q9Y585 309 aa16.55■□□□□ 0.24
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SPCS1-201ENST00000233025 CD160O95971 181 aa16.54■□□□□ 0.24
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SPCS1-201ENST00000233025 EPB41P11171 864 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 ACADSBP45954 432 aa16.54■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 TAF5Q15542 800 aa16.54■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 RETSATQ6NUM9 610 aa16.54■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 IRF2BP1Q8IU81 584 aa16.54■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 PLPP6Q8IY26 295 aa16.54■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 NRSN1Q8IZ57 195 aa16.54■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 ATL2Q8NHH9 583 aa16.54■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 CCL4L1Q8NHW4 92 aa16.54■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 SLC4A5Q9BY07 1137 aa16.54■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM168Q9H0V1 697 aa16.54■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 FGF22Q9HCT0 170 aa16.54■□□□□ 0.24
SPCS1-201ENST00000233025 COQ6Q9Y2Z9 468 aa16.54■□□□□ 0.24
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