RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227638.7

PANX1-201, Transcript of pannexin 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PANX1, Length 2,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1-201ENST00000227638 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP18.25■□□□□ 0.51
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PANX1-201ENST00000227638 LINC00523Q86TU6 105 aa18.22■□□□□ 0.51
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PANX1-201ENST00000227638 EXOC2Q96KP1 924 aa18.22■□□□□ 0.51
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PANX1-201ENST00000227638 V9GYQ6 96 aa18.22■□□□□ 0.51
PANX1-201ENST00000227638 SCN4AP35499 1836 aa18.22■□□□□ 0.51
PANX1-201ENST00000227638 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
PANX1-201ENST00000227638 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
PANX1-201ENST00000227638 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
PANX1-201ENST00000227638 VILLO15195 856 aa18.21■□□□□ 0.51
PANX1-201ENST00000227638 UBDO15205 165 aa18.21■□□□□ 0.51
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