RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gria4Q9Z2W8 902 aa12.89□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SpnP15702 395 aa12.89□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gjb3P28231 270 aa12.89□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atp4aQ64436 1033 aa12.89□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyp3a16Q64481 504 aa12.89□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zdhhc24Q6IR37 284 aa12.89□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cpa1Q7TPZ8 419 aa12.89□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lmo3Q8BZL8 145 aa12.89□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr474Q8VFC9 310 aa12.89□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam83dQ9D7I8 585 aa12.89□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znf354bQ9QXT9 601 aa12.89□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1123A2AT85 323 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 9230113P08RikD3YWX3 137 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam181aJ3QNB7 292 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 GcatO88986 416 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sstr3P30935 428 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pecam1Q08481 727 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znf367Q0VDT2 340 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gpsm3Q3U1Z5 159 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm136Q3V037 328 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp280bQ505F4 534 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fbxw10Q5SUS0 1030 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vps50Q8CI71 964 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Clip4Q8CI96 704 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Eva1bQ8K2Y3 164 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stard13Q923Q2 1113 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyp4f13Q99N19 523 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zdbf2Q5SS00 2493 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 4930402K13RikB1AW18 415 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ndst2P52850 883 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ephb2P54763 986 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 KrtdapQ3V2T4 102 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Foxd1Q61345 456 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kcna4Q61423 654 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zbtb41Q811F1 908 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc151Q8BSN3 593 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lrrc56Q8K375 552 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pcdha6Q91Y14 946 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ssxb1Q9CPU1 170 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ly6kQ9CWP4 154 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tchhl1Q9D3P1 638 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PirQ9D711 290 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Piwil1Q9JMB7 862 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Skint11A7XV14 364 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zbed6D2EAC2 980 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm3002E9PW72 216 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm3755K7N743 167 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 BpgmP15327 259 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lzts1P60853 599 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 UtyP79457 1212 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zc3hav1Q3UPF5 946 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klhl23Q6GQU2 558 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Il17cQ8K4C5 194 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mkl1Q8K4J6 964 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trap1Q9CQN1 706 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AccsA2AIG8 502 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TpbpaP13438 124 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Serpina3gQ5I2A0 440 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Eif2b4Q61749 524 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arhgap26Q6ZQ82 814 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1198Q7TR12 308 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spata7Q80VP2 582 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zbtb24Q80X44 710 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp418Q8BFS8 652 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam126bQ8C729 530 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q922R1 422 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdh13Q9WTR5 714 aa12.88□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm3147A0A0J9YU88 481 aa12.87□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm10424A0A0J9YVD0 481 aa12.87□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfr2E9Q5M4 874 aa12.87□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rnf169E9Q7F2 694 aa12.87□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm7971J3QMM8 481 aa12.87□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Got2P05202 430 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cct8P42932 548 aa12.87□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ldb1P70662 411 aa12.87□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp868Q3UTQ6 422 aa12.87□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AbrQ5SSL4 859 aa12.87□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pnma8aQ80VM8 430 aa12.87□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rhbdf2Q80WQ6 827 aa12.87□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mapk15Q80Y86 549 aa12.87□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppp1r15bQ8BFW3 697 aa12.87□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cgref1Q8R1U2 281 aa12.87□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pcdhga9Q91XX9 932 aa12.87□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Necab2Q91ZP9 389 aa12.87□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fcf1Q9CTH6 198 aa12.87□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rhobtb1Q9DAK3 695 aa12.87□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gipc2Q9Z2H7 314 aa12.87□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dusp8O09112 663 aa12.87□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc1a6O35544 561 aa12.87□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fpr-rs3O88537 343 aa12.87□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nudt1P53368 156 aa12.87□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Akr1c6P70694 323 aa12.87□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CrtamQ149L7 389 aa12.87□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 WhammQ571B6 793 aa12.87□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm5431Q5NCB3 844 aa12.87□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 GapdhsQ64467 440 aa12.87□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trpm4Q7TN37 1213 aa12.87□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Oscp1Q8BHW2 379 aa12.87□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stx16Q8BVI5 326 aa12.87□□□□□ -0.35
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmp1Q99KU0 406 aa12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26 ms