RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636934.1

CLN8-211, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-211ENST00000636934 SKAP1Q86WV1 359 aa23.69■■□□□ 1.38
CLN8-211ENST00000636934 TTC21AQ8NDW8 1320 aa23.69■■□□□ 1.38
CLN8-211ENST00000636934 PIK3R4Q99570 1358 aa23.69■■□□□ 1.38
CLN8-211ENST00000636934 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
CLN8-211ENST00000636934 GNAI1P63096 354 aa23.68■■□□□ 1.38
CLN8-211ENST00000636934 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.68■■□□□ 1.38
CLN8-211ENST00000636934 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.68■■□□□ 1.38
CLN8-211ENST00000636934 NALCNQ8IZF0 1738 aa23.67■■□□□ 1.38
CLN8-211ENST00000636934 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
CLN8-211ENST00000636934 IFT57Q9NWB7 429 aa23.67■■□□□ 1.38
CLN8-211ENST00000636934 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
CLN8-211ENST00000636934 RGS3P49796 1198 aa23.66■■□□□ 1.38
CLN8-211ENST00000636934 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa23.66■■□□□ 1.38
CLN8-211ENST00000636934 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.66■■□□□ 1.38
CLN8-211ENST00000636934 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
CLN8-211ENST00000636934 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.65■■□□□ 1.38
CLN8-211ENST00000636934 USP31Q70CQ4 1352 aa23.65■■□□□ 1.38
CLN8-211ENST00000636934 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.65■■□□□ 1.38
CLN8-211ENST00000636934 SSH2Q76I76 1423 aa23.64■■□□□ 1.38
CLN8-211ENST00000636934 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
CLN8-211ENST00000636934 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
CLN8-211ENST00000636934 TNNQ9UQP3 1299 aa23.63■■□□□ 1.37
CLN8-211ENST00000636934 ANKARQ7Z5J8 1434 aa23.63■■□□□ 1.37
CLN8-211ENST00000636934 TRIM27P14373 513 aa23.62■■□□□ 1.37
CLN8-211ENST00000636934 C8orf34Q49A92 452 aa23.62■■□□□ 1.37
CLN8-211ENST00000636934 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.62■■□□□ 1.37
CLN8-211ENST00000636934 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CLN8-211ENST00000636934 NUTM2FA1L443 756 aa23.6■■□□□ 1.37
CLN8-211ENST00000636934 ZNF853P0CG23 659 aa23.6■■□□□ 1.37
CLN8-211ENST00000636934 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
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CLN8-211ENST00000636934 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CLN8-211ENST00000636934 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CLN8-211ENST00000636934 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.57■■□□□ 1.36
CLN8-211ENST00000636934 CFAP44Q96MT7 982 aa23.57■■□□□ 1.36
CLN8-211ENST00000636934 DLG5Q8TDM6 1919 aa23.57■■□□□ 1.36
CLN8-211ENST00000636934 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
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CLN8-211ENST00000636934 SULT6B1Q6IMI4 303 aa23.54■■□□□ 1.36
CLN8-211ENST00000636934 ARHGEF10O15013 1369 aa23.54■■□□□ 1.36
CLN8-211ENST00000636934 SBNO1A3KN83 1393 aa23.53■■□□□ 1.36
CLN8-211ENST00000636934 VAMP4O75379 141 aa23.53■■□□□ 1.36
CLN8-211ENST00000636934 MBIPQ9NS73 344 aa23.53■■□□□ 1.36
CLN8-211ENST00000636934 RGPD1P0DJD0 1748 aa23.53■■□□□ 1.36
CLN8-211ENST00000636934 PEAK1Q9H792 1746 aa23.53■■□□□ 1.36
CLN8-211ENST00000636934 FMN2Q9NZ56 1722 aa23.53■■□□□ 1.36
CLN8-211ENST00000636934 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
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CLN8-211ENST00000636934 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
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CLN8-211ENST00000636934 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.52■■□□□ 1.36
CLN8-211ENST00000636934 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.52■■□□□ 1.36
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CLN8-211ENST00000636934 AEBP1Q8IUX7 1158 aa23.47■■□□□ 1.35
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CLN8-211ENST00000636934 USP54Q70EL1 1684 aa23.47■■□□□ 1.35
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CLN8-211ENST00000636934 AMPHP49418 695 aa23.45■■□□□ 1.34
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CLN8-211ENST00000636934 FAM83GA6ND36 823 aa23.43■■□□□ 1.34
CLN8-211ENST00000636934 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.43■■□□□ 1.34
CLN8-211ENST00000636934 KDRP35968 1356 aa23.43■■□□□ 1.34
CLN8-211ENST00000636934 KIAA0232Q92628 1395 aa23.43■■□□□ 1.34
CLN8-211ENST00000636934 SOX12O15370 315 aa23.42■■□□□ 1.34
CLN8-211ENST00000636934 NLRP6P59044 892 aa23.42■■□□□ 1.34
CLN8-211ENST00000636934 SMC5Q8IY18 1101 aa23.42■■□□□ 1.34
CLN8-211ENST00000636934 C8orf58Q8NAV2 365 aa23.42■■□□□ 1.34
CLN8-211ENST00000636934 ABCC4O15439 1325 aa23.41■■□□□ 1.34
CLN8-211ENST00000636934 CHL1O00533 1208 aa23.41■■□□□ 1.34
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CLN8-211ENST00000636934 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CLN8-211ENST00000636934 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23.4■■□□□ 1.34
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CLN8-211ENST00000636934 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CLN8-211ENST00000636934 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CLN8-211ENST00000636934 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CLN8-211ENST00000636934 ABTB2Q8N961 1025 aa23.36■■□□□ 1.33
CLN8-211ENST00000636934 RTL1A6NKG5 1358 aa23.36■■□□□ 1.33
CLN8-211ENST00000636934 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.36■■□□□ 1.33
CLN8-211ENST00000636934 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CLN8-211ENST00000636934 CRB1P82279 1406 aa23.35■■□□□ 1.33
CLN8-211ENST00000636934 MCM10Q7L590 875 aa23.35■■□□□ 1.33
CLN8-211ENST00000636934 GCC1Q96CN9 775 aa23.35■■□□□ 1.33
CLN8-211ENST00000636934 EYA1Q99502 592 aa23.35■■□□□ 1.33
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