RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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C9orf170-201ENST00000623052 NUTM2FA1L443 756 aa16.72■□□□□ 0.27
C9orf170-201ENST00000623052 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa16.72■□□□□ 0.27
C9orf170-201ENST00000623052 CHL1O00533 1208 aa16.71■□□□□ 0.27
C9orf170-201ENST00000623052 MSH6P52701 1360 aa16.71■□□□□ 0.27
C9orf170-201ENST00000623052 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
C9orf170-201ENST00000623052 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa16.71■□□□□ 0.26
C9orf170-201ENST00000623052 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
C9orf170-201ENST00000623052 PLEKHG3A1L390 1219 aa16.7■□□□□ 0.26
C9orf170-201ENST00000623052 PIK3C2AO00443 1686 aa16.7■□□□□ 0.26
C9orf170-201ENST00000623052 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa16.7■□□□□ 0.26
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C9orf170-201ENST00000623052 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
C9orf170-201ENST00000623052 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
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