RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620182.4

CPEB1-218, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CPEB1, Length 2,422 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1-218ENST00000620182 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.07■■□□□ 1.92
CPEB1-218ENST00000620182 PTCH1Q13635 1447 aa27.07■■□□□ 1.92
CPEB1-218ENST00000620182 TNNQ9UQP3 1299 aa27.07■■□□□ 1.92
CPEB1-218ENST00000620182 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa27.07■■□□□ 1.92
CPEB1-218ENST00000620182 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa27.06■■□□□ 1.92
CPEB1-218ENST00000620182 ACEP12821 1306 aa27.06■■□□□ 1.92
CPEB1-218ENST00000620182 SSH1Q8WYL5 1049 aa27.06■■□□□ 1.92
CPEB1-218ENST00000620182 ZNF428Q96B54 188 aa27.05■■□□□ 1.92
CPEB1-218ENST00000620182 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
CPEB1-218ENST00000620182 PHACTR3Q96KR7 559 aa27.04■■□□□ 1.92
CPEB1-218ENST00000620182 HSPA2P54652 639 aa27.04■■□□□ 1.92
CPEB1-218ENST00000620182 LMOD3Q0VAK6 560 aa27.04■■□□□ 1.92
CPEB1-218ENST00000620182 ALDH1L2Q3SY69 923 aa27.04■■□□□ 1.92
CPEB1-218ENST00000620182 C8orf34Q49A92 452 aa27.04■■□□□ 1.92
CPEB1-218ENST00000620182 DDRGK1Q96HY6 314 aa27.04■■□□□ 1.92
CPEB1-218ENST00000620182 KIF16BQ96L93 1317 aa27.03■■□□□ 1.92
CPEB1-218ENST00000620182 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
CPEB1-218ENST00000620182 NRKQ7Z2Y5 1582 aa27.02■■□□□ 1.92
CPEB1-218ENST00000620182 USP6P35125 1406 aa27.02■■□□□ 1.92
CPEB1-218ENST00000620182 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
CPEB1-218ENST00000620182 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa27.02■■□□□ 1.92
CPEB1-218ENST00000620182 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa27.02■■□□□ 1.92
CPEB1-218ENST00000620182 KCNA6P17658 529 aa27.01■■□□□ 1.91
CPEB1-218ENST00000620182 TRIM27P14373 513 aa27■■□□□ 1.91
CPEB1-218ENST00000620182 DDX19BQ9UMR2 479 aa27■■□□□ 1.91
CPEB1-218ENST00000620182 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
CPEB1-218ENST00000620182 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa27■■□□□ 1.91
CPEB1-218ENST00000620182 OVOS2Q6IE36 1432 aa27■■□□□ 1.91
CPEB1-218ENST00000620182 GNAI1P63096 354 aa26.99■■□□□ 1.91
CPEB1-218ENST00000620182 IFT57Q9NWB7 429 aa26.99■■□□□ 1.91
CPEB1-218ENST00000620182 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
CPEB1-218ENST00000620182 NUTM2FA1L443 756 aa26.98■■□□□ 1.91
CPEB1-218ENST00000620182 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
CPEB1-218ENST00000620182 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
CPEB1-218ENST00000620182 TTC21AQ8NDW8 1320 aa26.96■■□□□ 1.91
CPEB1-218ENST00000620182 USP31Q70CQ4 1352 aa26.94■■□□□ 1.9
CPEB1-218ENST00000620182 ITPRIPQ8IWB1 547 aa26.94■■□□□ 1.9
CPEB1-218ENST00000620182 SSH2Q76I76 1423 aa26.94■■□□□ 1.9
CPEB1-218ENST00000620182 ZNF853P0CG23 659 aa26.92■■□□□ 1.9
CPEB1-218ENST00000620182 NWD1Q149M9 1564 aa26.92■■□□□ 1.9
CPEB1-218ENST00000620182 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
CPEB1-218ENST00000620182 CFAP44Q96MT7 982 aa26.9■■□□□ 1.9
CPEB1-218ENST00000620182 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
CPEB1-218ENST00000620182 NALCNQ8IZF0 1738 aa26.9■■□□□ 1.9
CPEB1-218ENST00000620182 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa26.89■■□□□ 1.89
CPEB1-218ENST00000620182 VAMP4O75379 141 aa26.88■■□□□ 1.89
CPEB1-218ENST00000620182 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
CPEB1-218ENST00000620182 TMEM57Q8N5G2 664 aa26.88■■□□□ 1.89
CPEB1-218ENST00000620182 STRCQ7RTU9 1775 aa26.88■■□□□ 1.89
CPEB1-218ENST00000620182 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
CPEB1-218ENST00000620182 MBIPQ9NS73 344 aa26.88■■□□□ 1.89
CPEB1-218ENST00000620182 SULT6B1Q6IMI4 303 aa26.87■■□□□ 1.89
CPEB1-218ENST00000620182 ARHGAP45Q92619 1136 aa26.87■■□□□ 1.89
CPEB1-218ENST00000620182 ANKARQ7Z5J8 1434 aa26.86■■□□□ 1.89
CPEB1-218ENST00000620182 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
CPEB1-218ENST00000620182 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
CPEB1-218ENST00000620182 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa26.84■■□□□ 1.89
CPEB1-218ENST00000620182 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
CPEB1-218ENST00000620182 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa26.82■■□□□ 1.88
CPEB1-218ENST00000620182 AEBP1Q8IUX7 1158 aa26.82■■□□□ 1.88
CPEB1-218ENST00000620182 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
CPEB1-218ENST00000620182 TSPYL6Q8N831 410 aa26.81■■□□□ 1.88
CPEB1-218ENST00000620182 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
CPEB1-218ENST00000620182 DLG5Q8TDM6 1919 aa26.81■■□□□ 1.88
CPEB1-218ENST00000620182 PEAK1Q9H792 1746 aa26.8■■□□□ 1.88
CPEB1-218ENST00000620182 SBNO1A3KN83 1393 aa26.8■■□□□ 1.88
CPEB1-218ENST00000620182 ARHGEF10O15013 1369 aa26.8■■□□□ 1.88
CPEB1-218ENST00000620182 FAM83GA6ND36 823 aa26.8■■□□□ 1.88
CPEB1-218ENST00000620182 FLT4P35916 1363 aa26.79■■□□□ 1.88
CPEB1-218ENST00000620182 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
CPEB1-218ENST00000620182 NBR1Q14596 966 aa26.79■■□□□ 1.88
CPEB1-218ENST00000620182 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.79■■□□□ 1.88
CPEB1-218ENST00000620182 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
CPEB1-218ENST00000620182 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa26.78■■□□□ 1.88
CPEB1-218ENST00000620182 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.78■■□□□ 1.88
CPEB1-218ENST00000620182 SOX12O15370 315 aa26.77■■□□□ 1.88
CPEB1-218ENST00000620182 DCTN1Q14203 1278 aa26.76■■□□□ 1.87
CPEB1-218ENST00000620182 SMC5Q8IY18 1101 aa26.76■■□□□ 1.87
CPEB1-218ENST00000620182 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
CPEB1-218ENST00000620182 C8orf58Q8NAV2 365 aa26.76■■□□□ 1.87
CPEB1-218ENST00000620182 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.75■■□□□ 1.87
CPEB1-218ENST00000620182 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
CPEB1-218ENST00000620182 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
CPEB1-218ENST00000620182 FMN2Q9NZ56 1722 aa26.74■■□□□ 1.87
CPEB1-218ENST00000620182 AMPHP49418 695 aa26.74■■□□□ 1.87
CPEB1-218ENST00000620182 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
CPEB1-218ENST00000620182 ABCC4O15439 1325 aa26.72■■□□□ 1.87
CPEB1-218ENST00000620182 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
CPEB1-218ENST00000620182 CHL1O00533 1208 aa26.71■■□□□ 1.87
CPEB1-218ENST00000620182 NLRP6P59044 892 aa26.71■■□□□ 1.87
CPEB1-218ENST00000620182 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
CPEB1-218ENST00000620182 KIF24Q5T7B8 1368 aa26.71■■□□□ 1.87
CPEB1-218ENST00000620182 PIK3C2AO00443 1686 aa26.71■■□□□ 1.87
CPEB1-218ENST00000620182 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
CPEB1-218ENST00000620182 USP19O94966 1318 aa26.69■■□□□ 1.86
CPEB1-218ENST00000620182 KDRP35968 1356 aa26.69■■□□□ 1.86
CPEB1-218ENST00000620182 KIAA0232Q92628 1395 aa26.69■■□□□ 1.86
CPEB1-218ENST00000620182 MCM10Q7L590 875 aa26.68■■□□□ 1.86
CPEB1-218ENST00000620182 IGSF1Q8N6C5 1336 aa26.67■■□□□ 1.86
CPEB1-218ENST00000620182 SEC24BO95487 1268 aa26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.4 ms