RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 LMOD3Q0VAK6 560 aa29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-212ENST00000591041 NUTM2GQ5VZR2 741 aa29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-212ENST00000591041 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-212ENST00000591041 PLEKHF1Q96S99 279 aa29.6■■■□□ 2.33
CAPNS1-212ENST00000591041 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-212ENST00000591041 RSPH6AQ9H0K4 717 aa29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-212ENST00000591041 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-212ENST00000591041 PRKAR2BP31323 418 aa29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-212ENST00000591041 ERICH6BQ5W0A0 696 aa29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-212ENST00000591041 POTEAQ6S8J7 498 aa29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-212ENST00000591041 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-212ENST00000591041 SLIT3O75094 1523 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-212ENST00000591041 USP19O94966 1318 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-212ENST00000591041 WWC1Q8IX03 1113 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-212ENST00000591041 TNS3Q68CZ2 1445 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-212ENST00000591041 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-212ENST00000591041 TMPOP42166 694 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-212ENST00000591041 MYH16Q9H6N6 1097 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-212ENST00000591041 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-212ENST00000591041 HOXC9P31274 260 aa29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-212ENST00000591041 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-212ENST00000591041 SLFN5Q08AF3 891 aa29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-212ENST00000591041 NEUROD2Q15784 382 aa29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-212ENST00000591041 BRINP3Q76B58 766 aa29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-212ENST00000591041 IP6K1Q92551 441 aa29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-212ENST00000591041 GCP02774 474 aa29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-212ENST00000591041 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-212ENST00000591041 NFAT5O94916 1531 aa29.53■■■□□ 2.32
CAPNS1-212ENST00000591041 ALS2Q96Q42 1657 aa29.53■■■□□ 2.32
CAPNS1-212ENST00000591041 PEAK1Q9H792 1746 aa29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-212ENST00000591041 RCAN3Q9UKA8 241 aa29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-212ENST00000591041 IL16Q14005 1332 aa29.51■■■□□ 2.32
CAPNS1-212ENST00000591041 HMOX1P09601 288 aa29.51■■■□□ 2.31
CAPNS1-212ENST00000591041 RIPK4P57078 832 aa29.51■■■□□ 2.31
CAPNS1-212ENST00000591041 NFE2L2Q16236 605 aa29.51■■■□□ 2.31
CAPNS1-212ENST00000591041 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
CAPNS1-212ENST00000591041 CDCA7LQ96GN5 454 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-212ENST00000591041 PXDNQ92626 1479 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-212ENST00000591041 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-212ENST00000591041 SULT6B1Q6IMI4 303 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-212ENST00000591041 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-212ENST00000591041 FKBP8Q14318 412 aa29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-212ENST00000591041 LTN1O94822 1766 aa29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-212ENST00000591041 DUSP27Q5VZP5 1158 aa29.47■■■□□ 2.31
CAPNS1-212ENST00000591041 ARHGEF25Q86VW2 580 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-212ENST00000591041 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-212ENST00000591041 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-212ENST00000591041 IGSF1Q8N6C5 1336 aa29.45■■■□□ 2.31
CAPNS1-212ENST00000591041 RGPD1P0DJD0 1748 aa29.44■■■□□ 2.3
CAPNS1-212ENST00000591041 ABCC6O95255 1503 aa29.44■■■□□ 2.3
CAPNS1-212ENST00000591041 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
CAPNS1-212ENST00000591041 PHLPP1O60346 1717 aa29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-212ENST00000591041 ZBTB7CA1YPR0 619 aa29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-212ENST00000591041 KDRP35968 1356 aa29.41■■■□□ 2.3
CAPNS1-212ENST00000591041 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
CAPNS1-212ENST00000591041 GAS2L2Q8NHY3 880 aa29.41■■■□□ 2.3
CAPNS1-212ENST00000591041 RNF123Q5XPI4 1314 aa29.41■■■□□ 2.3
CAPNS1-212ENST00000591041 JCADQ9P266 1359 aa29.4■■■□□ 2.3
CAPNS1-212ENST00000591041 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-212ENST00000591041 EYA1Q99502 592 aa29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-212ENST00000591041 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
CAPNS1-212ENST00000591041 NHSL1Q5SYE7 1610 aa29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-212ENST00000591041 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIM35Q9UPQ4 493 aa29.36■■■□□ 2.29
CAPNS1-212ENST00000591041 PHACTR3Q96KR7 559 aa29.35■■■□□ 2.29
CAPNS1-212ENST00000591041 RRP1P56182 461 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-212ENST00000591041 GNAI1P63096 354 aa29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-212ENST00000591041 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-212ENST00000591041 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-212ENST00000591041 CPDO75976 1380 aa29.34■■■□□ 2.29
CAPNS1-212ENST00000591041 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-212ENST00000591041 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
CAPNS1-212ENST00000591041 AEBP1Q8IUX7 1158 aa29.32■■■□□ 2.28
CAPNS1-212ENST00000591041 ANKRD24Q8TF21 1146 aa29.31■■■□□ 2.28
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
CAPNS1-212ENST00000591041 PLEKHG5O94827 1062 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-212ENST00000591041 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-212ENST00000591041 IFT57Q9NWB7 429 aa29.3■■■□□ 2.28
CAPNS1-212ENST00000591041 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF428Q96B54 188 aa29.27■■■□□ 2.28
CAPNS1-212ENST00000591041 AMOTQ4VCS5 1084 aa29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-212ENST00000591041 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
CAPNS1-212ENST00000591041 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-212ENST00000591041 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-212ENST00000591041 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
CAPNS1-212ENST00000591041 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
CAPNS1-212ENST00000591041 FANCIQ9NVI1 1328 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-212ENST00000591041 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-212ENST00000591041 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa29.23■■■□□ 2.27
CAPNS1-212ENST00000591041 ERBB3P21860 1342 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-212ENST00000591041 CFAP44Q96MT7 982 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-212ENST00000591041 PRDM11Q9NQV5 511 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP4R2Q9NY27 417 aa29.22■■■□□ 2.27
CAPNS1-212ENST00000591041 GNAT3A8MTJ3 354 aa29.21■■■□□ 2.27
CAPNS1-212ENST00000591041 CANXP27824 592 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-212ENST00000591041 NBPF6Q5VWK0 638 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-212ENST00000591041 NBPF4Q96M43 638 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-212ENST00000591041 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms