RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590546.6

USP36-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP36, Length 1,771 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36-218ENST00000590546 PHACTR3Q96KR7 559 aa29.02■■■□□ 2.24
USP36-218ENST00000590546 CRBNQ96SW2 442 aa29.02■■■□□ 2.24
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USP36-218ENST00000590546 ARHGEF10O15013 1369 aa29■■■□□ 2.23
USP36-218ENST00000590546 DCCP43146 1447 aa29■■■□□ 2.23
USP36-218ENST00000590546 RARSP54136 660 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
USP36-218ENST00000590546 PDE3AQ14432 1141 aa29■■■□□ 2.23
USP36-218ENST00000590546 SOX12O15370 315 aa28.99■■■□□ 2.23
USP36-218ENST00000590546 BCAR3O75815 825 aa28.99■■■□□ 2.23
USP36-218ENST00000590546 RGPD1P0DJD0 1748 aa28.99■■■□□ 2.23
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USP36-218ENST00000590546 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa28.97■■■□□ 2.23
USP36-218ENST00000590546 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.96■■■□□ 2.23
USP36-218ENST00000590546 RTL1A6NKG5 1358 aa28.96■■■□□ 2.23
USP36-218ENST00000590546 C20orf194Q5TEA3 1177 aa28.96■■■□□ 2.23
USP36-218ENST00000590546 KCNH5Q8NCM2 988 aa28.96■■■□□ 2.23
USP36-218ENST00000590546 C1orf167Q5SNV9 1468 aa28.95■■■□□ 2.22
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USP36-218ENST00000590546 TMEM94Q12767 1356 aa28.94■■■□□ 2.22
USP36-218ENST00000590546 ORAI2Q96SN7 254 aa28.94■■■□□ 2.22
USP36-218ENST00000590546 HSPA2P54652 639 aa28.93■■■□□ 2.22
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USP36-218ENST00000590546 NUTM2GQ5VZR2 741 aa28.92■■■□□ 2.22
USP36-218ENST00000590546 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
USP36-218ENST00000590546 IFT57Q9NWB7 429 aa28.92■■■□□ 2.22
USP36-218ENST00000590546 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.92■■■□□ 2.22
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USP36-218ENST00000590546 IGSF1Q8N6C5 1336 aa28.9■■■□□ 2.22
USP36-218ENST00000590546 FOXO3O43524 673 aa28.9■■■□□ 2.22
USP36-218ENST00000590546 AEBP1Q8IUX7 1158 aa28.9■■■□□ 2.22
USP36-218ENST00000590546 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.88■■■□□ 2.21
USP36-218ENST00000590546 CADPS2Q86UW7 1296 aa28.88■■■□□ 2.21
USP36-218ENST00000590546 DLG5Q8TDM6 1919 aa28.87■■■□□ 2.21
USP36-218ENST00000590546 MS4A1P11836 297 aa28.87■■■□□ 2.21
USP36-218ENST00000590546 AAMPQ13685 434 aa28.87■■■□□ 2.21
USP36-218ENST00000590546 MST1RQ04912 1400 aa28.86■■■□□ 2.21
USP36-218ENST00000590546 NFAT5O94916 1531 aa28.86■■■□□ 2.21
USP36-218ENST00000590546 ZNF853P0CG23 659 aa28.85■■■□□ 2.21
USP36-218ENST00000590546 EYA1Q99502 592 aa28.85■■■□□ 2.21
USP36-218ENST00000590546 KRT28Q7Z3Y7 464 aa28.85■■■□□ 2.21
USP36-218ENST00000590546 IP6K1Q92551 441 aa28.85■■■□□ 2.21
USP36-218ENST00000590546 CFAP44Q96MT7 982 aa28.85■■■□□ 2.21
USP36-218ENST00000590546 MSH6P52701 1360 aa28.83■■■□□ 2.21
USP36-218ENST00000590546 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
USP36-218ENST00000590546 ALDH1L2Q3SY69 923 aa28.83■■■□□ 2.21
USP36-218ENST00000590546 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
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USP36-218ENST00000590546 STRCQ7RTU9 1775 aa28.8■■■□□ 2.2
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USP36-218ENST00000590546 SMC4Q9NTJ3 1288 aa28.8■■■□□ 2.2
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USP36-218ENST00000590546 BCL2L13Q9BXK5 485 aa28.76■■■□□ 2.19
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USP36-218ENST00000590546 PANK1Q8TE04 598 aa28.74■■■□□ 2.19
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USP36-218ENST00000590546 VAMP4O75379 141 aa28.71■■■□□ 2.19
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USP36-218ENST00000590546 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
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USP36-218ENST00000590546 CRB1P82279 1406 aa28.66■■■□□ 2.18
USP36-218ENST00000590546 KIAA0232Q92628 1395 aa28.65■■■□□ 2.18
USP36-218ENST00000590546 MCM10Q7L590 875 aa28.65■■■□□ 2.18
USP36-218ENST00000590546 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
USP36-218ENST00000590546 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
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