RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590546.6

USP36-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP36, Length 1,771 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36-218ENST00000590546 PHACTR3Q96KR7 559 aa29.02■■■□□ 2.24
USP36-218ENST00000590546 CRBNQ96SW2 442 aa29.02■■■□□ 2.24
USP36-218ENST00000590546 FANCIQ9NVI1 1328 aa29.01■■■□□ 2.23
USP36-218ENST00000590546 ARHGEF10O15013 1369 aa29■■■□□ 2.23
USP36-218ENST00000590546 DCCP43146 1447 aa29■■■□□ 2.23
USP36-218ENST00000590546 RARSP54136 660 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
USP36-218ENST00000590546 PDE3AQ14432 1141 aa29■■■□□ 2.23
USP36-218ENST00000590546 SOX12O15370 315 aa28.99■■■□□ 2.23
USP36-218ENST00000590546 BCAR3O75815 825 aa28.99■■■□□ 2.23
USP36-218ENST00000590546 RGPD1P0DJD0 1748 aa28.99■■■□□ 2.23
USP36-218ENST00000590546 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
USP36-218ENST00000590546 SULT6B1Q6IMI4 303 aa28.98■■■□□ 2.23
USP36-218ENST00000590546 KIF1AQ12756 1690 aa28.97■■■□□ 2.23
USP36-218ENST00000590546 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa28.97■■■□□ 2.23
USP36-218ENST00000590546 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.96■■■□□ 2.23
USP36-218ENST00000590546 RTL1A6NKG5 1358 aa28.96■■■□□ 2.23
USP36-218ENST00000590546 C20orf194Q5TEA3 1177 aa28.96■■■□□ 2.23
USP36-218ENST00000590546 KCNH5Q8NCM2 988 aa28.96■■■□□ 2.23
USP36-218ENST00000590546 C1orf167Q5SNV9 1468 aa28.95■■■□□ 2.22
USP36-218ENST00000590546 ATF3P18847 181 aa28.94■■■□□ 2.22
USP36-218ENST00000590546 TMEM94Q12767 1356 aa28.94■■■□□ 2.22
USP36-218ENST00000590546 ORAI2Q96SN7 254 aa28.94■■■□□ 2.22
USP36-218ENST00000590546 HSPA2P54652 639 aa28.93■■■□□ 2.22
USP36-218ENST00000590546 CANXP27824 592 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
USP36-218ENST00000590546 GNAI1P63096 354 aa28.92■■■□□ 2.22
USP36-218ENST00000590546 NUTM2GQ5VZR2 741 aa28.92■■■□□ 2.22
USP36-218ENST00000590546 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
USP36-218ENST00000590546 IFT57Q9NWB7 429 aa28.92■■■□□ 2.22
USP36-218ENST00000590546 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.92■■■□□ 2.22
USP36-218ENST00000590546 KDRP35968 1356 aa28.91■■■□□ 2.22
USP36-218ENST00000590546 HOXC9P31274 260 aa28.91■■■□□ 2.22
USP36-218ENST00000590546 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
USP36-218ENST00000590546 ZNF428Q96B54 188 aa28.9■■■□□ 2.22
USP36-218ENST00000590546 IGSF1Q8N6C5 1336 aa28.9■■■□□ 2.22
USP36-218ENST00000590546 FOXO3O43524 673 aa28.9■■■□□ 2.22
USP36-218ENST00000590546 AEBP1Q8IUX7 1158 aa28.9■■■□□ 2.22
USP36-218ENST00000590546 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.88■■■□□ 2.21
USP36-218ENST00000590546 CADPS2Q86UW7 1296 aa28.88■■■□□ 2.21
USP36-218ENST00000590546 DLG5Q8TDM6 1919 aa28.87■■■□□ 2.21
USP36-218ENST00000590546 MS4A1P11836 297 aa28.87■■■□□ 2.21
USP36-218ENST00000590546 AAMPQ13685 434 aa28.87■■■□□ 2.21
USP36-218ENST00000590546 MST1RQ04912 1400 aa28.86■■■□□ 2.21
USP36-218ENST00000590546 NFAT5O94916 1531 aa28.86■■■□□ 2.21
USP36-218ENST00000590546 ZNF853P0CG23 659 aa28.85■■■□□ 2.21
USP36-218ENST00000590546 EYA1Q99502 592 aa28.85■■■□□ 2.21
USP36-218ENST00000590546 KRT28Q7Z3Y7 464 aa28.85■■■□□ 2.21
USP36-218ENST00000590546 IP6K1Q92551 441 aa28.85■■■□□ 2.21
USP36-218ENST00000590546 CFAP44Q96MT7 982 aa28.85■■■□□ 2.21
USP36-218ENST00000590546 MSH6P52701 1360 aa28.83■■■□□ 2.21
USP36-218ENST00000590546 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
USP36-218ENST00000590546 ALDH1L2Q3SY69 923 aa28.83■■■□□ 2.21
USP36-218ENST00000590546 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
USP36-218ENST00000590546 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
USP36-218ENST00000590546 SLIT3O75094 1523 aa28.81■■■□□ 2.2
USP36-218ENST00000590546 LTN1O94822 1766 aa28.81■■■□□ 2.2
USP36-218ENST00000590546 GAS2L2Q8NHY3 880 aa28.8■■■□□ 2.2
USP36-218ENST00000590546 STRCQ7RTU9 1775 aa28.8■■■□□ 2.2
USP36-218ENST00000590546 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa28.8■■■□□ 2.2
USP36-218ENST00000590546 SMC4Q9NTJ3 1288 aa28.8■■■□□ 2.2
USP36-218ENST00000590546 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
USP36-218ENST00000590546 USP19O94966 1318 aa28.79■■■□□ 2.2
USP36-218ENST00000590546 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
USP36-218ENST00000590546 GCP02774 474 aa28.77■■■□□ 2.2
USP36-218ENST00000590546 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
USP36-218ENST00000590546 KIF16BQ96L93 1317 aa28.77■■■□□ 2.2
USP36-218ENST00000590546 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
USP36-218ENST00000590546 SSH1Q8WYL5 1049 aa28.76■■■□□ 2.19
USP36-218ENST00000590546 BCL2L13Q9BXK5 485 aa28.76■■■□□ 2.19
USP36-218ENST00000590546 NPHP3Q7Z494 1330 aa28.75■■■□□ 2.19
USP36-218ENST00000590546 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
USP36-218ENST00000590546 MBIPQ9NS73 344 aa28.75■■■□□ 2.19
USP36-218ENST00000590546 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
USP36-218ENST00000590546 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
USP36-218ENST00000590546 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
USP36-218ENST00000590546 FAM83GA6ND36 823 aa28.74■■■□□ 2.19
USP36-218ENST00000590546 PANK1Q8TE04 598 aa28.74■■■□□ 2.19
USP36-218ENST00000590546 ARHGEF25Q86VW2 580 aa28.73■■■□□ 2.19
USP36-218ENST00000590546 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
USP36-218ENST00000590546 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
USP36-218ENST00000590546 LMOD2Q6P5Q4 547 aa28.72■■■□□ 2.19
USP36-218ENST00000590546 COG6Q9Y2V7 657 aa28.72■■■□□ 2.19
USP36-218ENST00000590546 KDM2BQ8NHM5 1336 aa28.71■■■□□ 2.19
USP36-218ENST00000590546 ALS2Q96Q42 1657 aa28.71■■■□□ 2.19
USP36-218ENST00000590546 VAMP4O75379 141 aa28.71■■■□□ 2.19
USP36-218ENST00000590546 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
USP36-218ENST00000590546 DCTN1Q14203 1278 aa28.7■■■□□ 2.19
USP36-218ENST00000590546 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.19
USP36-218ENST00000590546 CLUAP1Q96AJ1 413 aa28.7■■■□□ 2.19
USP36-218ENST00000590546 CHL1O00533 1208 aa28.7■■■□□ 2.18
USP36-218ENST00000590546 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
USP36-218ENST00000590546 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa28.69■■■□□ 2.18
USP36-218ENST00000590546 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
USP36-218ENST00000590546 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
USP36-218ENST00000590546 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
USP36-218ENST00000590546 MVPQ14764 893 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
USP36-218ENST00000590546 CRB1P82279 1406 aa28.66■■■□□ 2.18
USP36-218ENST00000590546 KIAA0232Q92628 1395 aa28.65■■■□□ 2.18
USP36-218ENST00000590546 MCM10Q7L590 875 aa28.65■■■□□ 2.18
USP36-218ENST00000590546 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
USP36-218ENST00000590546 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.9 ms