RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ANKARQ7Z5J8 1434 aa30.99■■■□□ 2.55
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PHACTR3Q96KR7 559 aa30.98■■■□□ 2.55
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TTC21AQ8NDW8 1320 aa30.98■■■□□ 2.55
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FMN2Q9NZ56 1722 aa30.98■■■□□ 2.55
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NALCNQ8IZF0 1738 aa30.97■■■□□ 2.55
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BCL2L13Q9BXK5 485 aa30.96■■■□□ 2.55
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 USP35Q9P2H5 1018 aa30.96■■■□□ 2.55
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C8orf34Q49A92 452 aa30.94■■■□□ 2.54
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 USP31Q70CQ4 1352 aa30.94■■■□□ 2.54
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IL16Q14005 1332 aa30.94■■■□□ 2.54
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NFE2L2Q16236 605 aa30.93■■■□□ 2.54
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM161AQ3B820 660 aa30.93■■■□□ 2.54
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PDE3AQ14432 1141 aa30.91■■■□□ 2.54
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PEAK1Q9H792 1746 aa30.91■■■□□ 2.54
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PANK1Q8TE04 598 aa30.9■■■□□ 2.54
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PIK3C2AO00443 1686 aa30.89■■■□□ 2.54
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa30.88■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 COG6Q9Y2V7 657 aa30.86■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AEBP1Q8IUX7 1158 aa30.85■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAP3K19Q56UN5 1328 aa30.85■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NLRP6P59044 892 aa30.84■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NUTM2GQ5VZR2 741 aa30.84■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SULT6B1Q6IMI4 303 aa30.84■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TNNQ9UQP3 1299 aa30.83■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa30.82■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PHF8Q9UPP1 1060 aa30.82■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C14orf37Q86TY3 774 aa30.81■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RGS3P49796 1198 aa30.8■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SMC4Q9NTJ3 1288 aa30.8■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DLG5Q8TDM6 1919 aa30.8■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RLBP1P12271 317 aa30.79■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ABTB2Q8N961 1025 aa30.78■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CLUAP1Q96AJ1 413 aa30.78■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SBNO1A3KN83 1393 aa30.78■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FLT4P35916 1363 aa30.78■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGHDP01880 384 aa30.78■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AMPHP49418 695 aa30.77■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SSH1Q8WYL5 1049 aa30.77■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LMOD3Q0VAK6 560 aa30.76■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLC4A3P48751 1232 aa30.75■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ESCO1Q5FWF5 840 aa30.75■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RGPD1P0DJD0 1748 aa30.75■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM83GA6ND36 823 aa30.75■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa30.74■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GNAI1P63096 354 aa30.72■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IFT57Q9NWB7 429 aa30.72■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DCTN1Q14203 1278 aa30.71■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NWD1Q149M9 1564 aa30.7■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ARHGEF10O15013 1369 aa30.7■■■□□ 2.5
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MBIPQ9NS73 344 aa30.69■■■□□ 2.5
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 USP54Q70EL1 1684 aa30.68■■■□□ 2.5
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PSME1Q06323 249 aa30.68■■■□□ 2.5
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NFKBIBQ15653 356 aa30.67■■■□□ 2.5
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP30.67■■■□□ 2.5
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CFAP44Q96MT7 982 aa30.66■■■□□ 2.5
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HOXC9P31274 260 aa30.65■■■□□ 2.5
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ORAI2Q96SN7 254 aa30.64■■■□□ 2.5
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EYA1Q99502 592 aa30.64■■■□□ 2.5
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa30.63■■■□□ 2.49
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TSPYL6Q8N831 410 aa30.63■■■□□ 2.49
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ALDH1L2Q3SY69 923 aa30.63■■■□□ 2.49
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 USP19O94966 1318 aa30.63■■■□□ 2.49
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGSF1Q8N6C5 1336 aa30.61■■■□□ 2.49
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KIF16BQ96L93 1317 aa30.61■■■□□ 2.49
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MCM10Q7L590 875 aa30.61■■■□□ 2.49
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AAMPQ13685 434 aa30.61■■■□□ 2.49
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FOXO3O43524 673 aa30.59■■■□□ 2.49
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF428Q96B54 188 aa30.59■■■□□ 2.49
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa30.58■■■□□ 2.49
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ITPRIPQ8IWB1 547 aa30.57■■■□□ 2.48
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C8orf58Q8NAV2 365 aa30.56■■■□□ 2.48
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LTN1O94822 1766 aa30.56■■■□□ 2.48
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RTL1A6NKG5 1358 aa30.53■■■□□ 2.48
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZBTB7CA1YPR0 619 aa30.53■■■□□ 2.48
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PLEKHG5O94827 1062 aa30.53■■■□□ 2.48
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