RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576460.5

NOMO3-216, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

TSL 5

Gene NOMO3, Length 516 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-216ENST00000576460 MAP3K19Q56UN5 1328 aa10.85□□□□□ -0.67
NOMO3-216ENST00000576460 SOX12O15370 315 aa10.85□□□□□ -0.67
NOMO3-216ENST00000576460 FCHSD2O94868 740 aa10.85□□□□□ -0.67
NOMO3-216ENST00000576460 IL13P35225 146 aa10.85□□□□□ -0.67
NOMO3-216ENST00000576460 PDE3BQ13370 1112 aa10.85□□□□□ -0.67
NOMO3-216ENST00000576460 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
NOMO3-216ENST00000576460 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa10.84□□□□□ -0.67
NOMO3-216ENST00000576460 GCP02774 474 aa10.84□□□□□ -0.67
NOMO3-216ENST00000576460 NEFMP07197 916 aa10.84□□□□□ -0.67
NOMO3-216ENST00000576460 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
NOMO3-216ENST00000576460 ARHGEF10O15013 1369 aa10.84□□□□□ -0.67
NOMO3-216ENST00000576460 FLT4P35916 1363 aa10.84□□□□□ -0.67
NOMO3-216ENST00000576460 USP19O94966 1318 aa10.84□□□□□ -0.67
NOMO3-216ENST00000576460 LTN1O94822 1766 aa10.83□□□□□ -0.68
NOMO3-216ENST00000576460 PXDNQ92626 1479 aa10.83□□□□□ -0.68
NOMO3-216ENST00000576460 APAF1O14727 1248 aa10.83□□□□□ -0.68
NOMO3-216ENST00000576460 TOM1O60784 492 aa10.83□□□□□ -0.68
NOMO3-216ENST00000576460 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa10.83□□□□□ -0.68
NOMO3-216ENST00000576460 CCDC146Q8IYE0 955 aa10.83□□□□□ -0.68
NOMO3-216ENST00000576460 IP6K1Q92551 441 aa10.83□□□□□ -0.68
NOMO3-216ENST00000576460 TNS3Q68CZ2 1445 aa10.83□□□□□ -0.68
NOMO3-216ENST00000576460 HOXC9P31274 260 aa10.82□□□□□ -0.68
NOMO3-216ENST00000576460 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
NOMO3-216ENST00000576460 SLIT3O75094 1523 aa10.82□□□□□ -0.68
NOMO3-216ENST00000576460 PEAK1Q9H792 1746 aa10.81□□□□□ -0.68
NOMO3-216ENST00000576460 RTL1A6NKG5 1358 aa10.81□□□□□ -0.68
NOMO3-216ENST00000576460 NHSL1Q5SYE7 1610 aa10.81□□□□□ -0.68
NOMO3-216ENST00000576460 ARHGEF25Q86VW2 580 aa10.81□□□□□ -0.68
NOMO3-216ENST00000576460 TCP11L2Q8N4U5 519 aa10.81□□□□□ -0.68
NOMO3-216ENST00000576460 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
NOMO3-216ENST00000576460 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa10.81□□□□□ -0.68
NOMO3-216ENST00000576460 NFAT5O94916 1531 aa10.8□□□□□ -0.68
NOMO3-216ENST00000576460 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
NOMO3-216ENST00000576460 PLEKHF1Q96S99 279 aa10.8□□□□□ -0.68
NOMO3-216ENST00000576460 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
NOMO3-216ENST00000576460 CCDC27Q2M243 656 aa10.79□□□□□ -0.68
NOMO3-216ENST00000576460 VSIG10Q8N0Z9 540 aa10.79□□□□□ -0.68
NOMO3-216ENST00000576460 RSPH6AQ9H0K4 717 aa10.79□□□□□ -0.68
NOMO3-216ENST00000576460 IQSEC2Q5JU85 1478 aa10.79□□□□□ -0.68
NOMO3-216ENST00000576460 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa10.78□□□□□ -0.68
NOMO3-216ENST00000576460 HMOX1P09601 288 aa10.78□□□□□ -0.68
NOMO3-216ENST00000576460 PRKAR2BP31323 418 aa10.78□□□□□ -0.68
NOMO3-216ENST00000576460 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
NOMO3-216ENST00000576460 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa10.78□□□□□ -0.68
NOMO3-216ENST00000576460 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.68
NOMO3-216ENST00000576460 ZBTB7CA1YPR0 619 aa10.77□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 PLEKHG5O94827 1062 aa10.77□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 TMPOP42166 694 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 GOLGA2Q08379 1002 aa10.77□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 SULT6B1Q6IMI4 303 aa10.77□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 WDR63Q8IWG1 891 aa10.77□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 EYA1Q99502 592 aa10.77□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 ZNF521Q96K83 1311 aa10.77□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 RGPD5Q99666 1765 aa10.77□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 RGPD1P0DJD0 1748 aa10.76□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 UBAP1LF5GYI3 381 aa10.76□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 NEUROD2Q15784 382 aa10.76□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 WWC1Q8IX03 1113 aa10.76□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 CABLES1Q8TDN4 633 aa10.76□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 CPDO75976 1380 aa10.76□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa10.75□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 RIPK4P57078 832 aa10.75□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 NFE2L2Q16236 605 aa10.75□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 CERKQ8TCT0 537 aa10.75□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 IGSF1Q8N6C5 1336 aa10.75□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 DLG5Q8TDM6 1919 aa10.74□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 SLFN5Q08AF3 891 aa10.74□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 PHACTR3Q96KR7 559 aa10.74□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 TAOK2Q9UL54 1235 aa10.74□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 COL18A1P39060 1754 aa10.74□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 KDRP35968 1356 aa10.74□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 ABCC6O95255 1503 aa10.74□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 RGPD2P0DJD1 1756 aa10.73□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 E9PSI1 815 aa10.73□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 LMOD3Q0VAK6 560 aa10.73□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 AEBP1Q8IUX7 1158 aa10.73□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 ANKRD24Q8TF21 1146 aa10.73□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 CDCA7LQ96GN5 454 aa10.73□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 PHLPP1O60346 1717 aa10.72□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 PIP4K2BP78356 416 aa10.72□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 NBPF6Q5VWK0 638 aa10.72□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 NBPF4Q96M43 638 aa10.72□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 PRDM11Q9NQV5 511 aa10.72□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 TRIM35Q9UPQ4 493 aa10.72□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 AXIN2Q9Y2T1 843 aa10.72□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 IL16Q14005 1332 aa10.72□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 GAS2L2Q8NHY3 880 aa10.71□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 KIAA0232Q92628 1395 aa10.71□□□□□ -0.69
NOMO3-216ENST00000576460 CHRNA2Q15822 529 aa10.7□□□□□ -0.7
NOMO3-216ENST00000576460 DUSP27Q5VZP5 1158 aa10.7□□□□□ -0.7
NOMO3-216ENST00000576460 MYH16Q9H6N6 1097 aa10.7□□□□□ -0.7
NOMO3-216ENST00000576460 ABCA3Q99758 1704 aa10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms