RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 RGPD1P0DJD0 1748 aa38■■■■□ 3.67
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CTDNEP1-208ENST00000573600 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa38■■■■□ 3.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 NUTM2GQ5VZR2 741 aa38■■■■□ 3.67
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CTDNEP1-208ENST00000573600 AMPHP49418 695 aa37.99■■■■□ 3.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 MSH6P52701 1360 aa37.99■■■■□ 3.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 FOXO3O43524 673 aa37.98■■■■□ 3.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRIM35Q9UPQ4 493 aa37.98■■■■□ 3.67
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CTDNEP1-208ENST00000573600 MYH16Q9H6N6 1097 aa37.98■■■■□ 3.67
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CTDNEP1-208ENST00000573600 NFE2L2Q16236 605 aa37.95■■■■□ 3.67
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CTDNEP1-208ENST00000573600 RTL1A6NKG5 1358 aa37.93■■■■□ 3.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 KRT28Q7Z3Y7 464 aa37.92■■■■□ 3.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARHGEF10O15013 1369 aa37.92■■■■□ 3.66
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CTDNEP1-208ENST00000573600 NFAT5O94916 1531 aa37.91■■■■□ 3.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 LTN1O94822 1766 aa37.9■■■■□ 3.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP37.9■■■■□ 3.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 SULT6B1Q6IMI4 303 aa37.89■■■■□ 3.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 HOXC9P31274 260 aa37.88■■■■□ 3.65
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLIT3O75094 1523 aa37.86■■■■□ 3.65
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP37.84■■■■□ 3.65
CTDNEP1-208ENST00000573600 DLG5Q8TDM6 1919 aa37.84■■■■□ 3.65
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CTDNEP1-208ENST00000573600 AEBP1Q8IUX7 1158 aa37.82■■■■□ 3.65
CTDNEP1-208ENST00000573600 IGSF1Q8N6C5 1336 aa37.81■■■■□ 3.64
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CTDNEP1-208ENST00000573600 USP19O94966 1318 aa37.8■■■■□ 3.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 NPHP3Q7Z494 1330 aa37.8■■■■□ 3.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP37.8■■■■□ 3.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLIN1O60240 522 aa37.79■■■■□ 3.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 IP6K1Q92551 441 aa37.79■■■■□ 3.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 FANCIQ9NVI1 1328 aa37.78■■■■□ 3.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 LMOD2Q6P5Q4 547 aa37.76■■■■□ 3.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 EYA1Q99502 592 aa37.76■■■■□ 3.64
CTDNEP1-208ENST00000573600 GCP02774 474 aa37.75■■■■□ 3.63
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CTDNEP1-208ENST00000573600 BCAR3O75815 825 aa37.7■■■■□ 3.63
CTDNEP1-208ENST00000573600 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa37.7■■■■□ 3.63
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CTDNEP1-208ENST00000573600 PXDNQ92626 1479 aa37.68■■■■□ 3.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 GNAI1P63096 354 aa37.67■■■■□ 3.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 IFT57Q9NWB7 429 aa37.67■■■■□ 3.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCDC136Q96JN2 1154 aa37.67■■■■□ 3.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 TNS3Q68CZ2 1445 aa37.66■■■■□ 3.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP37.66■■■■□ 3.62
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CTDNEP1-208ENST00000573600 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP37.64■■■■□ 3.62
CTDNEP1-208ENST00000573600 CRBNQ96SW2 442 aa37.64■■■■□ 3.62
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF853P0CG23 659 aa37.61■■■■□ 3.61
CTDNEP1-208ENST00000573600 C20orf194Q5TEA3 1177 aa37.61■■■■□ 3.61
CTDNEP1-208ENST00000573600 GAS2L2Q8NHY3 880 aa37.61■■■■□ 3.61
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZBTB7CA1YPR0 619 aa37.6■■■■□ 3.61
CTDNEP1-208ENST00000573600 CFAP44Q96MT7 982 aa37.6■■■■□ 3.61
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CTDNEP1-208ENST00000573600 PDE3AQ14432 1141 aa37.58■■■■□ 3.61
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CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM83GA6ND36 823 aa37.57■■■■□ 3.6
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa37.53■■■■□ 3.6
CTDNEP1-208ENST00000573600 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP37.53■■■■□ 3.6
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CTDNEP1-208ENST00000573600 DCTN1Q14203 1278 aa37.52■■■■□ 3.6
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ALDH1L2Q3SY69 923 aa37.48■■■■□ 3.59
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CTDNEP1-208ENST00000573600 BCL2L13Q9BXK5 485 aa37.46■■■■□ 3.59
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CTDNEP1-208ENST00000573600 RGPD5Q99666 1765 aa37.46■■■■□ 3.59
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CRB1P82279 1406 aa37.44■■■■□ 3.58
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CTDNEP1-208ENST00000573600 NHSL1Q5SYE7 1610 aa37.43■■■■□ 3.58
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