RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557657.5

TMEM260-216, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM260, Length 2,572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-216ENST00000557657 KIF16BQ96L93 1317 aa26.92■■□□□ 1.9
TMEM260-216ENST00000557657 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
TMEM260-216ENST00000557657 C8orf58Q8NAV2 365 aa26.9■■□□□ 1.9
TMEM260-216ENST00000557657 USP35Q9P2H5 1018 aa26.9■■□□□ 1.9
TMEM260-216ENST00000557657 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.89■■□□□ 1.9
TMEM260-216ENST00000557657 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
TMEM260-216ENST00000557657 ALDH1L2Q3SY69 923 aa26.89■■□□□ 1.9
TMEM260-216ENST00000557657 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.89
TMEM260-216ENST00000557657 ACEP12821 1306 aa26.88■■□□□ 1.89
TMEM260-216ENST00000557657 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
TMEM260-216ENST00000557657 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
TMEM260-216ENST00000557657 TECPR2O15040 1411 aa26.88■■□□□ 1.89
TMEM260-216ENST00000557657 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
TMEM260-216ENST00000557657 AATKQ6ZMQ8 1374 aa26.87■■□□□ 1.89
TMEM260-216ENST00000557657 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
TMEM260-216ENST00000557657 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
TMEM260-216ENST00000557657 KRT24Q2M2I5 525 aa26.86■■□□□ 1.89
TMEM260-216ENST00000557657 SULT6B1Q6IMI4 303 aa26.86■■□□□ 1.89
TMEM260-216ENST00000557657 ZNF853P0CG23 659 aa26.85■■□□□ 1.89
TMEM260-216ENST00000557657 LNPKQ9C0E8 428 aa26.85■■□□□ 1.89
TMEM260-216ENST00000557657 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa26.85■■□□□ 1.89
TMEM260-216ENST00000557657 GNAI1P63096 354 aa26.85■■□□□ 1.89
TMEM260-216ENST00000557657 SMC5Q8IY18 1101 aa26.85■■□□□ 1.89
TMEM260-216ENST00000557657 TBC1D32Q96NH3 1257 aa26.85■■□□□ 1.89
TMEM260-216ENST00000557657 IFT57Q9NWB7 429 aa26.85■■□□□ 1.89
TMEM260-216ENST00000557657 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa26.84■■□□□ 1.89
TMEM260-216ENST00000557657 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.84■■□□□ 1.89
TMEM260-216ENST00000557657 MON2Q7Z3U7 1717 aa26.84■■□□□ 1.89
TMEM260-216ENST00000557657 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
TMEM260-216ENST00000557657 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
TMEM260-216ENST00000557657 SIRT1Q96EB6 747 aa26.83■■□□□ 1.89
TMEM260-216ENST00000557657 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
TMEM260-216ENST00000557657 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
TMEM260-216ENST00000557657 C3P01024 1663 aa26.81■■□□□ 1.88
TMEM260-216ENST00000557657 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
TMEM260-216ENST00000557657 PTPRUQ92729 1446 aa26.81■■□□□ 1.88
TMEM260-216ENST00000557657 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa26.81■■□□□ 1.88
TMEM260-216ENST00000557657 DLG5Q8TDM6 1919 aa26.8■■□□□ 1.88
TMEM260-216ENST00000557657 MCM10Q7L590 875 aa26.8■■□□□ 1.88
TMEM260-216ENST00000557657 CFAP44Q96MT7 982 aa26.8■■□□□ 1.88
TMEM260-216ENST00000557657 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
TMEM260-216ENST00000557657 KNDC1Q76NI1 1749 aa26.8■■□□□ 1.88
TMEM260-216ENST00000557657 AKAP12Q02952 1782 aa26.78■■□□□ 1.88
TMEM260-216ENST00000557657 ITSN1Q15811 1721 aa26.77■■□□□ 1.88
TMEM260-216ENST00000557657 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
TMEM260-216ENST00000557657 TBC1D2Q9BYX2 928 aa26.77■■□□□ 1.88
TMEM260-216ENST00000557657 NUCB1Q02818 461 aa26.76■■□□□ 1.87
TMEM260-216ENST00000557657 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa26.76■■□□□ 1.87
TMEM260-216ENST00000557657 SIRT2Q8IXJ6 389 aa26.76■■□□□ 1.87
TMEM260-216ENST00000557657 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
TMEM260-216ENST00000557657 ANKRD45Q5TZF3 282 aa26.74■■□□□ 1.87
TMEM260-216ENST00000557657 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.74■■□□□ 1.87
TMEM260-216ENST00000557657 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.74■■□□□ 1.87
TMEM260-216ENST00000557657 BECN1Q14457 450 aa26.73■■□□□ 1.87
TMEM260-216ENST00000557657 CHD1LQ86WJ1 897 aa26.73■■□□□ 1.87
TMEM260-216ENST00000557657 FOXO3O43524 673 aa26.73■■□□□ 1.87
TMEM260-216ENST00000557657 ZNF428Q96B54 188 aa26.73■■□□□ 1.87
TMEM260-216ENST00000557657 USP6P35125 1406 aa26.72■■□□□ 1.87
TMEM260-216ENST00000557657 PLEKHG3A1L390 1219 aa26.72■■□□□ 1.87
TMEM260-216ENST00000557657 PTCH1Q13635 1447 aa26.72■■□□□ 1.87
TMEM260-216ENST00000557657 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.72■■□□□ 1.87
TMEM260-216ENST00000557657 C22orf23Q9BZE7 217 aa26.72■■□□□ 1.87
TMEM260-216ENST00000557657 ABCC4O15439 1325 aa26.71■■□□□ 1.87
TMEM260-216ENST00000557657 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa26.71■■□□□ 1.87
TMEM260-216ENST00000557657 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.71■■□□□ 1.87
TMEM260-216ENST00000557657 GSE1Q14687 1217 aa26.69■■□□□ 1.86
TMEM260-216ENST00000557657 ARHGAP45Q92619 1136 aa26.69■■□□□ 1.86
TMEM260-216ENST00000557657 PEAK1Q9H792 1746 aa26.69■■□□□ 1.86
TMEM260-216ENST00000557657 NUTM2GQ5VZR2 741 aa26.69■■□□□ 1.86
TMEM260-216ENST00000557657 EID1Q9Y6B2 187 aa26.69■■□□□ 1.86
TMEM260-216ENST00000557657 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.68■■□□□ 1.86
TMEM260-216ENST00000557657 PIK3R4Q99570 1358 aa26.67■■□□□ 1.86
TMEM260-216ENST00000557657 ANTXR1Q9H6X2 564 aa26.66■■□□□ 1.86
TMEM260-216ENST00000557657 NRKQ7Z2Y5 1582 aa26.66■■□□□ 1.86
TMEM260-216ENST00000557657 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
TMEM260-216ENST00000557657 IL27Q8NEV9 243 aa26.63■■□□□ 1.85
TMEM260-216ENST00000557657 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa26.63■■□□□ 1.85
TMEM260-216ENST00000557657 CHL1O00533 1208 aa26.62■■□□□ 1.85
TMEM260-216ENST00000557657 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
TMEM260-216ENST00000557657 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
TMEM260-216ENST00000557657 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
TMEM260-216ENST00000557657 SSH2Q76I76 1423 aa26.61■■□□□ 1.85
TMEM260-216ENST00000557657 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
TMEM260-216ENST00000557657 USP31Q70CQ4 1352 aa26.59■■□□□ 1.85
TMEM260-216ENST00000557657 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
TMEM260-216ENST00000557657 GCC1Q96CN9 775 aa26.58■■□□□ 1.85
TMEM260-216ENST00000557657 KCNA6P17658 529 aa26.57■■□□□ 1.84
TMEM260-216ENST00000557657 AMPHP49418 695 aa26.57■■□□□ 1.84
TMEM260-216ENST00000557657 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
TMEM260-216ENST00000557657 EYA1Q99502 592 aa26.57■■□□□ 1.84
TMEM260-216ENST00000557657 TBX22Q9Y458 520 aa26.56■■□□□ 1.84
TMEM260-216ENST00000557657 APBB1O00213 710 aa26.56■■□□□ 1.84
TMEM260-216ENST00000557657 RGS12O14924 1447 aa26.55■■□□□ 1.84
TMEM260-216ENST00000557657 NLRP6P59044 892 aa26.55■■□□□ 1.84
TMEM260-216ENST00000557657 BMP2KLQ5H9B9 411 aa26.54■■□□□ 1.84
TMEM260-216ENST00000557657 G2E3Q7L622 706 aa26.54■■□□□ 1.84
TMEM260-216ENST00000557657 SLC4A2P04920 1241 aa26.54■■□□□ 1.84
TMEM260-216ENST00000557657 BRPF3Q9ULD4 1205 aa26.54■■□□□ 1.84
TMEM260-216ENST00000557657 CRB1P82279 1406 aa26.54■■□□□ 1.84
TMEM260-216ENST00000557657 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms