RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552253.1

PTPRB-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 2,373 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-211ENST00000552253 CPS1P31327 1500 aa7.5□□□□□ -1.21
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PTPRB-211ENST00000552253 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-211ENST00000552253 OVOS2Q6IE36 1432 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-211ENST00000552253 ATP10DQ9P241 1426 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRB-211ENST00000552253 UBR1Q8IWV7 1749 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-211ENST00000552253 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.22
PTPRB-211ENST00000552253 TMEM2Q9UHN6 1383 aa7.4□□□□□ -1.22
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