RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530238.5

BRMS1-207, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 5

Gene BRMS1, Length 1,817 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-207ENST00000530238 GGNBP2Q9H3C7 697 aa29.52■■■□□ 2.32
BRMS1-207ENST00000530238 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
BRMS1-207ENST00000530238 RLBP1P12271 317 aa29.51■■■□□ 2.31
BRMS1-207ENST00000530238 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
BRMS1-207ENST00000530238 NUTM2FA1L443 756 aa29.5■■■□□ 2.31
BRMS1-207ENST00000530238 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
BRMS1-207ENST00000530238 BECN1Q14457 450 aa29.5■■■□□ 2.31
BRMS1-207ENST00000530238 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
BRMS1-207ENST00000530238 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa29.5■■■□□ 2.31
BRMS1-207ENST00000530238 DCCP43146 1447 aa29.49■■■□□ 2.31
BRMS1-207ENST00000530238 MST1RQ04912 1400 aa29.48■■■□□ 2.31
BRMS1-207ENST00000530238 NFKBIBQ15653 356 aa29.48■■■□□ 2.31
BRMS1-207ENST00000530238 TRIM35Q9UPQ4 493 aa29.48■■■□□ 2.31
BRMS1-207ENST00000530238 ZNF428Q96B54 188 aa29.47■■■□□ 2.31
BRMS1-207ENST00000530238 DDX19BQ9UMR2 479 aa29.47■■■□□ 2.31
BRMS1-207ENST00000530238 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa29.46■■■□□ 2.31
BRMS1-207ENST00000530238 USP19O94966 1318 aa29.46■■■□□ 2.31
BRMS1-207ENST00000530238 WASLO00401 505 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
BRMS1-207ENST00000530238 FCHSD2O94868 740 aa29.45■■■□□ 2.31
BRMS1-207ENST00000530238 SMC4Q9NTJ3 1288 aa29.45■■■□□ 2.31
BRMS1-207ENST00000530238 KIF16BQ96L93 1317 aa29.45■■■□□ 2.31
BRMS1-207ENST00000530238 BCL2L13Q9BXK5 485 aa29.44■■■□□ 2.3
BRMS1-207ENST00000530238 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa29.44■■■□□ 2.3
BRMS1-207ENST00000530238 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
BRMS1-207ENST00000530238 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
BRMS1-207ENST00000530238 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
BRMS1-207ENST00000530238 ALDH1L2Q3SY69 923 aa29.42■■■□□ 2.3
BRMS1-207ENST00000530238 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa29.42■■■□□ 2.3
BRMS1-207ENST00000530238 HSPA1LP34931 641 aa29.41■■■□□ 2.3
BRMS1-207ENST00000530238 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa29.41■■■□□ 2.3
BRMS1-207ENST00000530238 RIPK4P57078 832 aa29.4■■■□□ 2.3
BRMS1-207ENST00000530238 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
BRMS1-207ENST00000530238 BRINP3Q76B58 766 aa29.4■■■□□ 2.3
BRMS1-207ENST00000530238 ORAI2Q96SN7 254 aa29.4■■■□□ 2.3
BRMS1-207ENST00000530238 C1orf167Q5SNV9 1468 aa29.4■■■□□ 2.3
BRMS1-207ENST00000530238 SLC4A3P48751 1232 aa29.39■■■□□ 2.3
BRMS1-207ENST00000530238 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
BRMS1-207ENST00000530238 TNNQ9UQP3 1299 aa29.38■■■□□ 2.29
BRMS1-207ENST00000530238 FMN2Q9NZ56 1722 aa29.38■■■□□ 2.29
BRMS1-207ENST00000530238 CABP1Q9NZU7 370 aa29.38■■■□□ 2.29
BRMS1-207ENST00000530238 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
BRMS1-207ENST00000530238 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
BRMS1-207ENST00000530238 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
BRMS1-207ENST00000530238 TRIM27P14373 513 aa29.36■■■□□ 2.29
BRMS1-207ENST00000530238 SSH1Q8WYL5 1049 aa29.36■■■□□ 2.29
BRMS1-207ENST00000530238 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
BRMS1-207ENST00000530238 GSE1Q14687 1217 aa29.36■■■□□ 2.29
BRMS1-207ENST00000530238 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
BRMS1-207ENST00000530238 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
BRMS1-207ENST00000530238 TBC1D32Q96NH3 1257 aa29.34■■■□□ 2.29
BRMS1-207ENST00000530238 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
BRMS1-207ENST00000530238 ESCO1Q5FWF5 840 aa29.32■■■□□ 2.28
BRMS1-207ENST00000530238 AATKQ6ZMQ8 1374 aa29.32■■■□□ 2.28
BRMS1-207ENST00000530238 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
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BRMS1-207ENST00000530238 PRR36Q9H6K5 1346 aa29.3■■■□□ 2.28
BRMS1-207ENST00000530238 ITPRIPQ8IWB1 547 aa29.3■■■□□ 2.28
BRMS1-207ENST00000530238 MON2Q7Z3U7 1717 aa29.29■■■□□ 2.28
BRMS1-207ENST00000530238 CCDC61Q9Y6R9 512 aa29.29■■■□□ 2.28
BRMS1-207ENST00000530238 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
BRMS1-207ENST00000530238 SEC24BO95487 1268 aa29.29■■■□□ 2.28
BRMS1-207ENST00000530238 SMC5Q8IY18 1101 aa29.29■■■□□ 2.28
BRMS1-207ENST00000530238 POLKQ9UBT6 870 aa29.29■■■□□ 2.28
BRMS1-207ENST00000530238 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
BRMS1-207ENST00000530238 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa29.28■■■□□ 2.28
BRMS1-207ENST00000530238 NFE2L2Q16236 605 aa29.27■■■□□ 2.28
BRMS1-207ENST00000530238 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa29.26■■■□□ 2.27
BRMS1-207ENST00000530238 LMOD3Q0VAK6 560 aa29.25■■■□□ 2.27
BRMS1-207ENST00000530238 ARHGAP45Q92619 1136 aa29.25■■■□□ 2.27
BRMS1-207ENST00000530238 PHLPP1O60346 1717 aa29.25■■■□□ 2.27
BRMS1-207ENST00000530238 PRKAR2BP31323 418 aa29.24■■■□□ 2.27
BRMS1-207ENST00000530238 AKAP12Q02952 1782 aa29.24■■■□□ 2.27
BRMS1-207ENST00000530238 ITSN1Q15811 1721 aa29.23■■■□□ 2.27
BRMS1-207ENST00000530238 FOXO3O43524 673 aa29.22■■■□□ 2.27
BRMS1-207ENST00000530238 GNAI1P63096 354 aa29.22■■■□□ 2.27
BRMS1-207ENST00000530238 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
BRMS1-207ENST00000530238 IFT57Q9NWB7 429 aa29.22■■■□□ 2.27
BRMS1-207ENST00000530238 TMEM57Q8N5G2 664 aa29.22■■■□□ 2.27
BRMS1-207ENST00000530238 NHSL1Q5SYE7 1610 aa29.21■■■□□ 2.27
BRMS1-207ENST00000530238 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
BRMS1-207ENST00000530238 ANKARQ7Z5J8 1434 aa29.2■■■□□ 2.26
BRMS1-207ENST00000530238 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP29.2■■■□□ 2.26
BRMS1-207ENST00000530238 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
BRMS1-207ENST00000530238 PLEKHG3A1L390 1219 aa29.18■■■□□ 2.26
BRMS1-207ENST00000530238 PHF8Q9UPP1 1060 aa29.18■■■□□ 2.26
BRMS1-207ENST00000530238 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
BRMS1-207ENST00000530238 IL13P35225 146 aa29.17■■■□□ 2.26
BRMS1-207ENST00000530238 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
BRMS1-207ENST00000530238 NRKQ7Z2Y5 1582 aa29.16■■■□□ 2.26
BRMS1-207ENST00000530238 NUCB1Q02818 461 aa29.15■■■□□ 2.26
BRMS1-207ENST00000530238 COG3Q96JB2 828 aa29.14■■■□□ 2.26
BRMS1-207ENST00000530238 KIF24Q5T7B8 1368 aa29.13■■■□□ 2.25
BRMS1-207ENST00000530238 ZNF853P0CG23 659 aa29.13■■■□□ 2.25
BRMS1-207ENST00000530238 GCC1Q96CN9 775 aa29.13■■■□□ 2.25
BRMS1-207ENST00000530238 KIF1AQ12756 1690 aa29.12■■■□□ 2.25
BRMS1-207ENST00000530238 C22orf23Q9BZE7 217 aa29.12■■■□□ 2.25
BRMS1-207ENST00000530238 ANTXR1Q9H6X2 564 aa29.12■■■□□ 2.25
BRMS1-207ENST00000530238 TBC1D2Q9BYX2 928 aa29.11■■■□□ 2.25
BRMS1-207ENST00000530238 VAMP4O75379 141 aa29.1■■■□□ 2.25
BRMS1-207ENST00000530238 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
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