RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529559.1

USP17L1-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 17-like family member 1, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene USP17L1, Length 1,593 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L1-201ENST00000529559 MSH6P52701 1360 aa15.38■□□□□ 0.05
USP17L1-201ENST00000529559 FOXO3O43524 673 aa15.36■□□□□ 0.05
USP17L1-201ENST00000529559 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa15.36■□□□□ 0.05
USP17L1-201ENST00000529559 NFAT5O94916 1531 aa15.36■□□□□ 0.05
USP17L1-201ENST00000529559 RTL1A6NKG5 1358 aa15.36■□□□□ 0.05
USP17L1-201ENST00000529559 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
USP17L1-201ENST00000529559 LTN1O94822 1766 aa15.36■□□□□ 0.05
USP17L1-201ENST00000529559 SOX12O15370 315 aa15.36■□□□□ 0.05
USP17L1-201ENST00000529559 HMOX1P09601 288 aa15.36■□□□□ 0.05
USP17L1-201ENST00000529559 NUTM2GQ5VZR2 741 aa15.35■□□□□ 0.05
USP17L1-201ENST00000529559 TRIM35Q9UPQ4 493 aa15.35■□□□□ 0.05
USP17L1-201ENST00000529559 IL16Q14005 1332 aa15.35■□□□□ 0.05
USP17L1-201ENST00000529559 ALS2Q96Q42 1657 aa15.34■□□□□ 0.05
USP17L1-201ENST00000529559 SLIT3O75094 1523 aa15.34■□□□□ 0.05
USP17L1-201ENST00000529559 ARHGEF10O15013 1369 aa15.34■□□□□ 0.05
USP17L1-201ENST00000529559 AMPHP49418 695 aa15.34■□□□□ 0.05
USP17L1-201ENST00000529559 RIPK4P57078 832 aa15.34■□□□□ 0.05
USP17L1-201ENST00000529559 NFE2L2Q16236 605 aa15.34■□□□□ 0.05
USP17L1-201ENST00000529559 PPP4R2Q9NY27 417 aa15.34■□□□□ 0.05
USP17L1-201ENST00000529559 KRT28Q7Z3Y7 464 aa15.33■□□□□ 0.05
USP17L1-201ENST00000529559 KCNH5Q8NCM2 988 aa15.33■□□□□ 0.05
USP17L1-201ENST00000529559 MYH16Q9H6N6 1097 aa15.33■□□□□ 0.05
USP17L1-201ENST00000529559 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
USP17L1-201ENST00000529559 PHACTR3Q96KR7 559 aa15.32■□□□□ 0.04
USP17L1-201ENST00000529559 DLG5Q8TDM6 1919 aa15.32■□□□□ 0.04
USP17L1-201ENST00000529559 HOXC9P31274 260 aa15.32■□□□□ 0.04
USP17L1-201ENST00000529559 USP19O94966 1318 aa15.31■□□□□ 0.04
USP17L1-201ENST00000529559 KDRP35968 1356 aa15.31■□□□□ 0.04
USP17L1-201ENST00000529559 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
USP17L1-201ENST00000529559 SULT6B1Q6IMI4 303 aa15.3■□□□□ 0.04
USP17L1-201ENST00000529559 NPHP3Q7Z494 1330 aa15.3■□□□□ 0.04
USP17L1-201ENST00000529559 IGSF1Q8N6C5 1336 aa15.3■□□□□ 0.04
USP17L1-201ENST00000529559 LMOD3Q0VAK6 560 aa15.29■□□□□ 0.04
USP17L1-201ENST00000529559 AEBP1Q8IUX7 1158 aa15.29■□□□□ 0.04
USP17L1-201ENST00000529559 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
USP17L1-201ENST00000529559 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
USP17L1-201ENST00000529559 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
USP17L1-201ENST00000529559 IP6K1Q92551 441 aa15.28■□□□□ 0.04
USP17L1-201ENST00000529559 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
USP17L1-201ENST00000529559 PXDNQ92626 1479 aa15.28■□□□□ 0.04
USP17L1-201ENST00000529559 FANCIQ9NVI1 1328 aa15.27■□□□□ 0.03
USP17L1-201ENST00000529559 GCP02774 474 aa15.27■□□□□ 0.03
USP17L1-201ENST00000529559 EYA1Q99502 592 aa15.27■□□□□ 0.03
USP17L1-201ENST00000529559 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
USP17L1-201ENST00000529559 TNS3Q68CZ2 1445 aa15.25■□□□□ 0.03
USP17L1-201ENST00000529559 ARHGEF25Q86VW2 580 aa15.25■□□□□ 0.03
USP17L1-201ENST00000529559 LMOD2Q6P5Q4 547 aa15.24■□□□□ 0.03
USP17L1-201ENST00000529559 BRINP3Q76B58 766 aa15.24■□□□□ 0.03
USP17L1-201ENST00000529559 PLIN1O60240 522 aa15.24■□□□□ 0.03
USP17L1-201ENST00000529559 SLAIN2Q9P270 581 aa15.24■□□□□ 0.03
USP17L1-201ENST00000529559 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa15.23■□□□□ 0.03
USP17L1-201ENST00000529559 RARSP54136 660 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
USP17L1-201ENST00000529559 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
USP17L1-201ENST00000529559 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa15.22■□□□□ 0.03
USP17L1-201ENST00000529559 GNAI1P63096 354 aa15.22■□□□□ 0.03
USP17L1-201ENST00000529559 EXOC6Q8TAG9 804 aa15.22■□□□□ 0.03
USP17L1-201ENST00000529559 IFT57Q9NWB7 429 aa15.22■□□□□ 0.03
USP17L1-201ENST00000529559 BCAR3O75815 825 aa15.21■□□□□ 0.03
USP17L1-201ENST00000529559 ZNF853P0CG23 659 aa15.21■□□□□ 0.03
USP17L1-201ENST00000529559 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
USP17L1-201ENST00000529559 ABCC6O95255 1503 aa15.21■□□□□ 0.03
USP17L1-201ENST00000529559 NCAPD2Q15021 1401 aa15.2■□□□□ 0.02
USP17L1-201ENST00000529559 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
USP17L1-201ENST00000529559 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa15.2■□□□□ 0.02
USP17L1-201ENST00000529559 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa15.19■□□□□ 0.02
USP17L1-201ENST00000529559 GAS2L2Q8NHY3 880 aa15.19■□□□□ 0.02
USP17L1-201ENST00000529559 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
USP17L1-201ENST00000529559 CFAP44Q96MT7 982 aa15.19■□□□□ 0.02
USP17L1-201ENST00000529559 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
USP17L1-201ENST00000529559 RGPD2P0DJD1 1756 aa15.19■□□□□ 0.02
USP17L1-201ENST00000529559 NHSL1Q5SYE7 1610 aa15.19■□□□□ 0.02
USP17L1-201ENST00000529559 CCDC136Q96JN2 1154 aa15.19■□□□□ 0.02
USP17L1-201ENST00000529559 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
USP17L1-201ENST00000529559 PDE3AQ14432 1141 aa15.18■□□□□ 0.02
USP17L1-201ENST00000529559 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
USP17L1-201ENST00000529559 C20orf194Q5TEA3 1177 aa15.18■□□□□ 0.02
USP17L1-201ENST00000529559 ZNF428Q96B54 188 aa15.18■□□□□ 0.02
USP17L1-201ENST00000529559 CRBNQ96SW2 442 aa15.18■□□□□ 0.02
USP17L1-201ENST00000529559 COL18A1P39060 1754 aa15.17■□□□□ 0.02
USP17L1-201ENST00000529559 RGPD5Q99666 1765 aa15.17■□□□□ 0.02
USP17L1-201ENST00000529559 ZBTB7CA1YPR0 619 aa15.17■□□□□ 0.02
USP17L1-201ENST00000529559 FAM83GA6ND36 823 aa15.17■□□□□ 0.02
USP17L1-201ENST00000529559 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
USP17L1-201ENST00000529559 NBPF6Q5VWK0 638 aa15.16■□□□□ 0.02
USP17L1-201ENST00000529559 NBPF4Q96M43 638 aa15.16■□□□□ 0.02
USP17L1-201ENST00000529559 LRRC37A3O60309 1634 aa15.16■□□□□ 0.02
USP17L1-201ENST00000529559 CPDO75976 1380 aa15.16■□□□□ 0.02
USP17L1-201ENST00000529559 MBIPQ9NS73 344 aa15.15■□□□□ 0.02
USP17L1-201ENST00000529559 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
USP17L1-201ENST00000529559 LMO7Q8WWI1 1683 aa15.15■□□□□ 0.02
USP17L1-201ENST00000529559 LTBP4Q8N2S1 1624 aa15.15■□□□□ 0.02
USP17L1-201ENST00000529559 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
USP17L1-201ENST00000529559 DCTN1Q14203 1278 aa15.15■□□□□ 0.02
USP17L1-201ENST00000529559 ANKRD24Q8TF21 1146 aa15.15■□□□□ 0.02
USP17L1-201ENST00000529559 CRB1P82279 1406 aa15.15■□□□□ 0.02
USP17L1-201ENST00000529559 CANXP27824 592 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
USP17L1-201ENST00000529559 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
USP17L1-201ENST00000529559 ALDH1L2Q3SY69 923 aa15.14■□□□□ 0.01
USP17L1-201ENST00000529559 USHBP1Q8N6Y0 703 aa15.14■□□□□ 0.01
USP17L1-201ENST00000529559 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms