RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525861.5

ACER3-204, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 2,058 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-204ENST00000525861 FOXO3O43524 673 aa30.35■■■□□ 2.45
ACER3-204ENST00000525861 TRIM35Q9UPQ4 493 aa30.35■■■□□ 2.45
ACER3-204ENST00000525861 RIPK4P57078 832 aa30.34■■■□□ 2.45
ACER3-204ENST00000525861 RGPD1P0DJD0 1748 aa30.33■■■□□ 2.45
ACER3-204ENST00000525861 AMPHP49418 695 aa30.32■■■□□ 2.44
ACER3-204ENST00000525861 CADPS2Q86UW7 1296 aa30.32■■■□□ 2.44
ACER3-204ENST00000525861 MSH6P52701 1360 aa30.31■■■□□ 2.44
ACER3-204ENST00000525861 PHACTR3Q96KR7 559 aa30.31■■■□□ 2.44
ACER3-204ENST00000525861 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
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ACER3-204ENST00000525861 IL16Q14005 1332 aa30.27■■■□□ 2.44
ACER3-204ENST00000525861 ARHGEF10O15013 1369 aa30.27■■■□□ 2.44
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ACER3-204ENST00000525861 KRT28Q7Z3Y7 464 aa30.26■■■□□ 2.43
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ACER3-204ENST00000525861 HOXC9P31274 260 aa30.25■■■□□ 2.43
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ACER3-204ENST00000525861 KCNH5Q8NCM2 988 aa30.24■■■□□ 2.43
ACER3-204ENST00000525861 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
ACER3-204ENST00000525861 LTN1O94822 1766 aa30.23■■■□□ 2.43
ACER3-204ENST00000525861 PLIN1O60240 522 aa30.23■■■□□ 2.43
ACER3-204ENST00000525861 SLIT3O75094 1523 aa30.22■■■□□ 2.43
ACER3-204ENST00000525861 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
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ACER3-204ENST00000525861 IGSF1Q8N6C5 1336 aa30.19■■■□□ 2.42
ACER3-204ENST00000525861 FANCIQ9NVI1 1328 aa30.19■■■□□ 2.42
ACER3-204ENST00000525861 DLG5Q8TDM6 1919 aa30.19■■■□□ 2.42
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ACER3-204ENST00000525861 LMOD3Q0VAK6 560 aa30.18■■■□□ 2.42
ACER3-204ENST00000525861 EYA1Q99502 592 aa30.16■■■□□ 2.42
ACER3-204ENST00000525861 IP6K1Q92551 441 aa30.16■■■□□ 2.42
ACER3-204ENST00000525861 NPHP3Q7Z494 1330 aa30.15■■■□□ 2.42
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ACER3-204ENST00000525861 GCP02774 474 aa30.15■■■□□ 2.42
ACER3-204ENST00000525861 LMOD2Q6P5Q4 547 aa30.15■■■□□ 2.42
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ACER3-204ENST00000525861 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
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ACER3-204ENST00000525861 FAM83GA6ND36 823 aa30.03■■■□□ 2.4
ACER3-204ENST00000525861 ZNF853P0CG23 659 aa30.03■■■□□ 2.4
ACER3-204ENST00000525861 SLAIN2Q9P270 581 aa30.03■■■□□ 2.4
ACER3-204ENST00000525861 ZBTB7CA1YPR0 619 aa30.03■■■□□ 2.4
ACER3-204ENST00000525861 PLEKHG5O94827 1062 aa30.01■■■□□ 2.39
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ACER3-204ENST00000525861 NBPF4Q96M43 638 aa29.96■■■□□ 2.39
ACER3-204ENST00000525861 BCL2L13Q9BXK5 485 aa29.96■■■□□ 2.39
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ACER3-204ENST00000525861 ZNF428Q96B54 188 aa29.93■■■□□ 2.38
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ACER3-204ENST00000525861 AXIN2Q9Y2T1 843 aa29.91■■■□□ 2.38
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ACER3-204ENST00000525861 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa29.9■■■□□ 2.38
ACER3-204ENST00000525861 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
ACER3-204ENST00000525861 ALDH1L2Q3SY69 923 aa29.89■■■□□ 2.38
ACER3-204ENST00000525861 CHL1O00533 1208 aa29.88■■■□□ 2.37
ACER3-204ENST00000525861 RGPD5Q99666 1765 aa29.88■■■□□ 2.37
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