RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519651.5

TSNARE1-204, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSNARE1, Length 2,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-204ENST00000519651 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1-204ENST00000519651 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1-204ENST00000519651 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.63■■□□□ 1.21
TSNARE1-204ENST00000519651 AMPHP49418 695 aa22.61■■□□□ 1.21
TSNARE1-204ENST00000519651 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.61■■□□□ 1.21
TSNARE1-204ENST00000519651 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
TSNARE1-204ENST00000519651 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
TSNARE1-204ENST00000519651 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
TSNARE1-204ENST00000519651 PSME1Q06323 249 aa22.59■■□□□ 1.21
TSNARE1-204ENST00000519651 PANK1Q8TE04 598 aa22.59■■□□□ 1.21
TSNARE1-204ENST00000519651 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
TSNARE1-204ENST00000519651 SBNO1A3KN83 1393 aa22.58■■□□□ 1.21
TSNARE1-204ENST00000519651 PIK3C2AO00443 1686 aa22.58■■□□□ 1.21
TSNARE1-204ENST00000519651 FLT4P35916 1363 aa22.58■■□□□ 1.2
TSNARE1-204ENST00000519651 PEAK1Q9H792 1746 aa22.57■■□□□ 1.2
TSNARE1-204ENST00000519651 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.57■■□□□ 1.2
TSNARE1-204ENST00000519651 COG6Q9Y2V7 657 aa22.57■■□□□ 1.2
TSNARE1-204ENST00000519651 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1-204ENST00000519651 GNAI1P63096 354 aa22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-204ENST00000519651 ORAI2Q96SN7 254 aa22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-204ENST00000519651 FAM83GA6ND36 823 aa22.53■■□□□ 1.2
TSNARE1-204ENST00000519651 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-204ENST00000519651 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-204ENST00000519651 IFT57Q9NWB7 429 aa22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-204ENST00000519651 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-204ENST00000519651 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-204ENST00000519651 TNNQ9UQP3 1299 aa22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-204ENST00000519651 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.52■■□□□ 1.2
TSNARE1-204ENST00000519651 DCTN1Q14203 1278 aa22.51■■□□□ 1.19
TSNARE1-204ENST00000519651 FOXO3O43524 673 aa22.51■■□□□ 1.19
TSNARE1-204ENST00000519651 RLBP1P12271 317 aa22.51■■□□□ 1.19
TSNARE1-204ENST00000519651 NWD1Q149M9 1564 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-204ENST00000519651 HOXC9P31274 260 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-204ENST00000519651 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.5■■□□□ 1.19
TSNARE1-204ENST00000519651 CFAP44Q96MT7 982 aa22.49■■□□□ 1.19
TSNARE1-204ENST00000519651 EYA1Q99502 592 aa22.49■■□□□ 1.19
TSNARE1-204ENST00000519651 ARHGEF10O15013 1369 aa22.49■■□□□ 1.19
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF853P0CG23 659 aa22.49■■□□□ 1.19
TSNARE1-204ENST00000519651 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
TSNARE1-204ENST00000519651 HSPA2P54652 639 aa22.48■■□□□ 1.19
TSNARE1-204ENST00000519651 MBIPQ9NS73 344 aa22.48■■□□□ 1.19
TSNARE1-204ENST00000519651 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.48■■□□□ 1.19
TSNARE1-204ENST00000519651 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
TSNARE1-204ENST00000519651 MS4A1P11836 297 aa22.47■■□□□ 1.19
TSNARE1-204ENST00000519651 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
TSNARE1-204ENST00000519651 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
TSNARE1-204ENST00000519651 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.46■■□□□ 1.19
TSNARE1-204ENST00000519651 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
TSNARE1-204ENST00000519651 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.46■■□□□ 1.19
TSNARE1-204ENST00000519651 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.45■■□□□ 1.18
TSNARE1-204ENST00000519651 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.45■■□□□ 1.18
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF428Q96B54 188 aa22.45■■□□□ 1.18
TSNARE1-204ENST00000519651 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
TSNARE1-204ENST00000519651 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
TSNARE1-204ENST00000519651 VAMP4O75379 141 aa22.44■■□□□ 1.18
TSNARE1-204ENST00000519651 AAMPQ13685 434 aa22.44■■□□□ 1.18
TSNARE1-204ENST00000519651 SKAP1Q86WV1 359 aa22.44■■□□□ 1.18
TSNARE1-204ENST00000519651 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
TSNARE1-204ENST00000519651 TRIM27P14373 513 aa22.43■■□□□ 1.18
TSNARE1-204ENST00000519651 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.43■■□□□ 1.18
TSNARE1-204ENST00000519651 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.43■■□□□ 1.18
TSNARE1-204ENST00000519651 MCM10Q7L590 875 aa22.43■■□□□ 1.18
TSNARE1-204ENST00000519651 TSPYL6Q8N831 410 aa22.43■■□□□ 1.18
TSNARE1-204ENST00000519651 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.43■■□□□ 1.18
TSNARE1-204ENST00000519651 KDRP35968 1356 aa22.43■■□□□ 1.18
TSNARE1-204ENST00000519651 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
TSNARE1-204ENST00000519651 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
TSNARE1-204ENST00000519651 ATF3P18847 181 aa22.42■■□□□ 1.18
TSNARE1-204ENST00000519651 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
TSNARE1-204ENST00000519651 USP54Q70EL1 1684 aa22.42■■□□□ 1.18
TSNARE1-204ENST00000519651 KIF16BQ96L93 1317 aa22.42■■□□□ 1.18
TSNARE1-204ENST00000519651 TMEM94Q12767 1356 aa22.41■■□□□ 1.18
TSNARE1-204ENST00000519651 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.41■■□□□ 1.18
TSNARE1-204ENST00000519651 IGHDP01880 384 aa22.41■■□□□ 1.18
TSNARE1-204ENST00000519651 KRT28Q7Z3Y7 464 aa22.41■■□□□ 1.18
TSNARE1-204ENST00000519651 PLEKHG5O94827 1062 aa22.4■■□□□ 1.18
TSNARE1-204ENST00000519651 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
TSNARE1-204ENST00000519651 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
TSNARE1-204ENST00000519651 IP6K1Q92551 441 aa22.4■■□□□ 1.18
TSNARE1-204ENST00000519651 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.4■■□□□ 1.18
TSNARE1-204ENST00000519651 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.39■■□□□ 1.18
TSNARE1-204ENST00000519651 RTL1A6NKG5 1358 aa22.39■■□□□ 1.17
TSNARE1-204ENST00000519651 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.39■■□□□ 1.17
TSNARE1-204ENST00000519651 GCP02774 474 aa22.37■■□□□ 1.17
TSNARE1-204ENST00000519651 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
TSNARE1-204ENST00000519651 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.37■■□□□ 1.17
TSNARE1-204ENST00000519651 CHL1O00533 1208 aa22.37■■□□□ 1.17
TSNARE1-204ENST00000519651 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.37■■□□□ 1.17
TSNARE1-204ENST00000519651 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.36■■□□□ 1.17
TSNARE1-204ENST00000519651 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
TSNARE1-204ENST00000519651 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.35■■□□□ 1.17
TSNARE1-204ENST00000519651 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.34■■□□□ 1.17
TSNARE1-204ENST00000519651 NFAT5O94916 1531 aa22.34■■□□□ 1.17
TSNARE1-204ENST00000519651 PDE4AP27815 886 aa22.34■■□□□ 1.17
TSNARE1-204ENST00000519651 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.34■■□□□ 1.17
TSNARE1-204ENST00000519651 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.33■■□□□ 1.16
TSNARE1-204ENST00000519651 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.33■■□□□ 1.16
TSNARE1-204ENST00000519651 MST1RQ04912 1400 aa22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-204ENST00000519651 LTN1O94822 1766 aa22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-204ENST00000519651 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms