RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516635.1

RNU6-344P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 344, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-344P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-344P-201ENST00000516635 PRR20DP86480 221 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-344P-201ENST00000516635 PRR20BP86481 221 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-344P-201ENST00000516635 PRR20AP86496 221 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-344P-201ENST00000516635 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-344P-201ENST00000516635 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC10A4Q96EP9 437 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZMYND15Q9H091 742 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM187AA6NFU0 413 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-344P-201ENST00000516635 ARID3CA6NKF2 412 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRAK2O60296 914 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-344P-201ENST00000516635 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-344P-201ENST00000516635 FSHRP23945 695 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-344P-201ENST00000516635 TSGA10IPQ3SY00 556 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-344P-201ENST00000516635 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-344P-201ENST00000516635 HPS1Q92902 700 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-344P-201ENST00000516635 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-344P-201ENST00000516635 PIK3CDO00329 1044 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 ADH1CP00326 375 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 CDK15Q96Q40 435 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 NNTQ13423 1086 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 WASHC4Q2M389 1173 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 GLMNQ92990 594 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 ALG2Q9H553 416 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 C1orf115Q9H7X2 142 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 CEP126Q9P2H0 1117 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 WASF2Q9Y6W5 498 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 ST8SIA5O15466 376 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 SEMA3FQ13275 785 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 MPNDQ8N594 471 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 UCN2Q96RP3 112 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZFAND3Q9H8U3 227 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 ESPNB1AK53 854 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 ERVH48-1M5A8F1 160 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 SCTRP47872 440 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 CBLBQ13191 982 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 NBPF20Q3BBV1 942 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 PKDCCQ504Y2 493 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 WWC1Q8IX03 1113 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 PHTF2Q8N3S3 785 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 ITPKCQ96DU7 683 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 DACH1Q9UI36 760 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 TIMP2P16035 220 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 WDR4P57081 412 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 MYT1Q01538 1121 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 NR5A1Q13285 461 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 XP32Q5T750 250 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 CCDC116Q8IYX3 515 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
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RNU6-344P-201ENST00000516635 BTBD11A6QL63 1104 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 WFS1O76024 890 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 BMP1P13497 986 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 RNF135Q8IUD6 432 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 DEPDC4Q8N2C3 294 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-344P-201ENST00000516635 CYLDQ9NQC7 956 aa4.47□□□□□ -1.69
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RNU6-344P-201ENST00000516635 DGAT1O75907 488 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-344P-201ENST00000516635 STAU1O95793 577 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
RNU6-344P-201ENST00000516635 AVPP01185 164 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-344P-201ENST00000516635 ADD1P35611 737 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
RNU6-344P-201ENST00000516635 SOX11P35716 441 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLFNL1Q499Z3 407 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-344P-201ENST00000516635 AGBL1Q96MI9 1066 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-344P-201ENST00000516635 AAASQ9NRG9 546 aa4.46□□□□□ -1.7
RNU6-344P-201ENST00000516635 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
RNU6-344P-201ENST00000516635 SKIP12755 728 aa4.45□□□□□ -1.7
RNU6-344P-201ENST00000516635 OXLD1Q5BKU9 147 aa4.45□□□□□ -1.7
RNU6-344P-201ENST00000516635 PLPP7Q8NBV4 271 aa4.45□□□□□ -1.7
RNU6-344P-201ENST00000516635 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
RNU6-344P-201ENST00000516635 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
RNU6-344P-201ENST00000516635 POTECB2RU33 542 aa4.44□□□□□ -1.7
RNU6-344P-201ENST00000516635 AXIN1O15169 862 aa4.44□□□□□ -1.7
RNU6-344P-201ENST00000516635 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
RNU6-344P-201ENST00000516635 NCOA4Q13772 614 aa4.44□□□□□ -1.7
RNU6-344P-201ENST00000516635 SEPT12Q8IYM1 358 aa4.44□□□□□ -1.7
RNU6-344P-201ENST00000516635 CCDC82Q8N4S0 544 aa4.44□□□□□ -1.7
RNU6-344P-201ENST00000516635 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
RNU6-344P-201ENST00000516635 CHIC2Q9UKJ5 165 aa4.44□□□□□ -1.7
RNU6-344P-201ENST00000516635 DOLKQ9UPQ8 538 aa4.44□□□□□ -1.7
RNU6-344P-201ENST00000516635 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa4.44□□□□□ -1.7
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